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Flashcard 4832252792076

Question
The median absolute deviation is related to the interquartile range, and [...] takes twice its value.
Answer
in the limit of infinite sample size


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The median absolute deviation is related to the interquartile range (and in the limit of infinite sample size takes twice its value), a common measure of sharpness [33], but is more robust to outliers [51].

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Funk et al. 2019: Assessing the performance of real-time epidemic forecasts: Ebola case study
median (MADN) of y (17) where y is a variable with CDF Pt, and division by 0.675 ensures that if the predictive distribution is normal this yields a value equivalent to the standard deviation. <span>The MAD (i.e., the MADN without the normalising factor) is related to the interquartile range (and in the limit of infinite sample size takes twice its value), a common measure of sharpness [33], but is more robust to outliers [51]. The sharpest model would focus all forecasts on one point and have S = 0, whereas a completely blurred forecast would have S → ∞. Again, we used Monte-Carlo samples from Pt to estimate







Flashcard 4832264588556

Question
The [...] reduces to the mean absolute error (MAE) if the forecast is deterministic.
Answer
Ranked Probability Score (RPS)


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The Ranked Probability Score (RPS) reduces to the mean absolute error (MAE) if the forecast is deterministic and can therefore be seen as its probabilistic generalisation for discrete forecasts.

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Funk et al. 2019: Assessing the performance of real-time epidemic forecasts: Ebola case study
These scores combine the assessment of calibration and sharpness for comparison of overall forecasting skill. The Ranked Probability Score (RPS) [52, 53] for count data is defined as [50] (19) <span>It reduces to the mean absolute error (MAE) if the forecast is deterministic and can therefore be seen as its probabilistic generalisation for discrete forecasts. A convenient equivalent formulation for predictions generated from Monte-Carlo samples is [47, 50] (20) where X and X′ are independent realisations of a random variable with cumulative







Flashcard 4832267209996

Question
The Ranked Probability Score (RPS) reduces to the mean absolute error (MAE) if [...].
Answer
the forecast is deterministic


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The Ranked Probability Score (RPS) reduces to the mean absolute error (MAE) if the forecast is deterministic and can therefore be seen as its probabilistic generalisation for discrete forecasts.

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Funk et al. 2019: Assessing the performance of real-time epidemic forecasts: Ebola case study
These scores combine the assessment of calibration and sharpness for comparison of overall forecasting skill. The Ranked Probability Score (RPS) [52, 53] for count data is defined as [50] (19) <span>It reduces to the mean absolute error (MAE) if the forecast is deterministic and can therefore be seen as its probabilistic generalisation for discrete forecasts. A convenient equivalent formulation for predictions generated from Monte-Carlo samples is [47, 50] (20) where X and X′ are independent realisations of a random variable with cumulative







Flashcard 4859828768012

Tags
#machine-learning #software-engineering #unfinished
Question
This glue code design pattern can be costly in the long term, as it tends to [...].
Answer
freeze a system to the peculiarities of a specific package


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This glue code design pattern can be costly in the long term, as it tends to freeze a system to the peculiarities of a specific package.

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#42 #Cours #Facultaires #Gynécologie #Médecine #Pelvienne #Tuméfaction
Le diagnostic de l'incontinence urinaire est clinique : l'interrogatoire différenciera une incon- tinence urinaire à l'effort, une incontinence sur urgenturies (hyperactivité vésicale) et une inconti nence urinaire mixte.

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#121 #42 #Cours #Facultaires #Gynécologie #Incontinence #Médecine #Pelvienne #Tuméfaction #Urinaire
Cette IUU fait par- tie du syndrome d'hyperactivité vésicale (HAV) défini par la survenue d'urgenturies (parfois provoquées par l'audition d'eau qui coule ou par le froid) avec ou sans incontinence urinaire, habituellement associées à une pollakiurie ou une nycturie (réveil par un besoin mictionnel).

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#121 #42 #Cours #Facultaires #Gynécologie #Incontinence #Médecine #Pelvienne #Tuméfaction #Urinaire
Un examen cytobactériologique des urines (ECBU) sera prescrit dès qu'une infection est suspectée ou devant des symptômes d'incontinence récents. Un calendrier ou catalogue mictionnel (tableau 15.1) sera demandé en cas d'HAV

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#121 #42 #Cours #Facultaires #Gynécologie #Incontinence #Médecine #Pelvienne #Tuméfaction #Urinaire
Il permet de distinguer une pollakiurie (augmentation de la fréquence des mictions) d'une polyurie (augmentation de la diurèse journa- lière), quelle qu'en soit l'origine (régime alimentaire, syndrome polyuropolydipsique, potomanie).

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#121 #42 #Cours #Facultaires #Gynécologie #Incontinence #Médecine #Pelvienne #Tuméfaction #Urinaire
Une échographie pelvienne et vésicale sera demandée uniquement devant une IUU ou une IUM d'apparition récente, afin d'éliminer une pathologie tumorale sous-jacente. En cas d'IUU, une pathologie sous-jacente sera recherchée (diabète, pathologie neurologique centrale, tumeur pelvienne, etc.). Un bilan urodynamique (débitmétrie, cystomanométrie, profilométrie urétrale) ne sera prescrit qu'en cas d'échec d'une 1 re ligne de traitement ou quand un traitement chirurgical est envisagé

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#121 #42 #Cours #Facultaires #Gynécologie #Incontinence #Médecine #Pelvienne #Tuméfaction #Urinaire
Débitmétrie L'examen débitmétrique permet l'étude objective et quantitative de la miction en appréciant notamment le volume mictionnel, le résidu post-mictionnel (obtenu par sondage) et le débit urinaire maximum (Qmax). La patiente est invitée à s'asseoir sur le débitmètre et à « produire » une miction spontanée. Le résidu post-mictionnel est considéré comme « significatif » (patho- logique) quand il dépasse 15 % du volume mictionnel. Le débit maximal doit être supérieur à 15 mL/s mais l'aspect de la courbe compte également beaucoup ; une courbe normale présente un aspect « en cloche »

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#121 #42 #Cours #Facultaires #Gynécologie #Incontinence #Médecine #Pelvienne #Tuméfaction #Urinaire
Cystomanométrie C'est l'étude des pressions intravésicales lors d'un remplissage progressif de la vessie par du sérum physiologique. On étudie la sensibilité de la vessie et on cherche des contractions détrusoriennes en cours de remplissage, avant l'ordre de miction, définissant une hyperactivité détrusorienne, alors que normalement la vessie ne se contracte pas au cours du remplissage

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#121 #42 #Cours #Facultaires #Gynécologie #Incontinence #Médecine #Pelvienne #Tuméfaction #Urinaire
Sphinctérométrie (profilométrie urétrale) Cet examen consiste à mesurer la pression tout au long de l'urètre. La pression maximale mesurée (pression de clôture urétrale maximale, PCUM) représente la force de contraction du sphincter urétral. Une insuffisance sphinctérienne est définie pour une PCUM inférieure à 30 cmH 2 O

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#121 #42 #Cours #Facultaires #Gynécologie #Incontinence #Médecine #Pelvienne #Tuméfaction #Urinaire
L'obésité est un facteur de risque indépendant d'incontinence urinaire (IUE et IUU)

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#121 #42 #Cours #Facultaires #Gynécologie #Incontinence #Médecine #Pelvienne #Tuméfaction #Urinaire
En cas d'IUU (HAV), la rééducation comprendra des thérapies cognitivo-comportementales, une électrostimulation périnéale et des exercices de contraction volontaire des muscles du plancher pelvien

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#121 #42 #Cours #Facultaires #Gynécologie #Incontinence #Médecine #Pelvienne #Tuméfaction #Urinaire
En cas d'IUE, ce sont les exercices de contraction volontaire des muscles du plancher pel- vien, l'électrostimulation et le biofeedback qui ont montré leur efficacité

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#121 #42 #Cours #Facultaires #Gynécologie #Incontinence #Médecine #Pelvienne #Tuméfaction #Urinaire
Thérapies hormonales Seuls les traitements œstrogéniques locaux (ovules et/ou crème) ont montré une efficacité sur les symptômes d'HAV (urgenturies et IUU) chez la femme ménopausée. Ils ne sont pas efficaces pour l'IUE

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#121 #42 #Cours #Facultaires #Gynécologie #Incontinence #Médecine #Pelvienne #Tuméfaction #Urinaire
Anticholinergiques Les anticholinergiques peuvent être prescrits en 1 re intention pour une IUU. Ils inhibent la contraction détrusorienne (antimuscariniques) et agissent également en modulant la sensibi- lité vésicale. Leur efficacité est indépendante de l'existence ou non d'une hyperactivité détru- sorienne à la cystomanométrie. Ils sont prescrits pour une durée initiale de 6 semaines. Leurs effets secondaires doivent être expliqués : constipation, bouche sèche, troubles cognitifs. Ils sont contre-indiqués en cas de glaucome à angle fermé.

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#121 #42 #Cours #Facultaires #Gynécologie #Incontinence #Médecine #Pelvienne #Tuméfaction #Urinaire
Neuromodulation La stimulation des nerfs périphériques peut inhiber la contraction détrusorienne et diminuer les symptômes d'hyperactivité vésicale (urgenturies et IUU). Cette neuromodulation peut être externe (sciatique poplité externe) ou interne (neuromodulation directe des racines sacrées)

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#121 #42 #Cours #Facultaires #Gynécologie #Incontinence #Médecine #Pelvienne #Tuméfaction #Urinaire
Bandelette sous-urétrale Il s'agit du traitement chirurgical de 1 re intention de l'IUE de la femme, après échec de la rééducation périnéale

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#121 #42 #Cours #Facultaires #Gynécologie #Incontinence #Médecine #Pelvienne #Tuméfaction #Urinaire
En cas d'IUM, ces bandelettes sous-urétrales ne diminuent les symptômes d'HAV que dans la moitié des cas.

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#121 #42 #Cours #Facultaires #Gynécologie #Incontinence #Médecine #Pelvienne #Tuméfaction #Urinaire
Recherche d'une cause réversible d'incontinence urinaire Les causes curables d'incontinence urinaire transitoire réversible (IUTR) sont répertoriées par l'acronyme mnémotechnique DIAPPERS (diapers signifie couches en anglais) : délire (syndrome confusionnel), infection urinaire, atrophie vaginale, causes psychologiques (syndrome dépres- sif), causes pharmacologiques, excès de diurèse, restriction de mobilité (impossibilité de se rendre aux toilettes si urgenturie), constipation (S : stool). Le bilan comportera au minimum un calendrier mictionnel, un ECBU et une mesure du résidu post-mictionnel

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#121 #42 #Cours #Facultaires #Gynécologie #Incontinence #Médecine #Pelvienne #Tuméfaction #Urinaire
Pour dépister cette « fragilité », il est recommandé, avant toute prise en charge thérapeutique, de demander un avis gériatrique pour les femmes de plus de 85 ans consultant pour une incontinence urinaire

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#121 #42 #Cours #Facultaires #Gynécologie #Incontinence #Médecine #Pelvienne #Tuméfaction #Urinaire
La dysurie définit les difficultés mictionnelles, regroupant un ou plusieurs des symptômes suivants : difficulté à ini- tialiser la miction, faiblesse du jet, jet haché, miction par poussée, jet en arrosoir, sensation de vidange vésicale incomplète et/ou miction par ajustement postural

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#121 #42 #Cours #Facultaires #Gynécologie #Incontinence #Médecine #Pelvienne #Tuméfaction #Urinaire
Diagnostic Le prolapsus génital est une hernie des organes pelviens à travers le vagin ; il peut concerner la vessie (cystocèle), l'utérus (hystéroptose), le cul-de-sac recto-utérin (de Douglas) (élytrocèle) et le rectum (rectocèle) (fig. 15.1). On le distingue du prolapsus rectal qui est une extériorisation du rectum par l'anus

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#121 #42 #Cours #Facultaires #Gynécologie #Incontinence #Médecine #Pelvienne #Tuméfaction #Urinaire
On détermine le degré d'extériorisation du prolapsus selon 4 stades : • stade 1 : intravaginal (fig. 15.2) ; • stade 2 : à l'entrée de la vulve ; • stade 3 : franchement extériorisé ; • stade 4 : déroulement complet du vagin

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#121 #42 #Cours #Facultaires #Gynécologie #Incontinence #Médecine #Pelvienne #Tuméfaction #Urinaire
Une échographie abdominopelvienne sera donc fréquemment demandée pour éliminer une ascite ou une pathologie tumorale utérine ou annexielle

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#121 #42 #Cours #Facultaires #Gynécologie #Incontinence #Médecine #Pelvienne #Tuméfaction #Urinaire
Un prolapsus génital peut entraîner une dysurie (mauvaise vidange vésicale), une pesanteur pelvienne, une sensation de boule à la vulve, une dyschésie (exonération des selles difficile), des urgenturies et/ou une incontinence urinaire sur urgenturie. Quand il existe une dysurie ou une dyschésie, les femmes rapportent parfois une nécessité de réaliser des manœuvres digi- tales de réintroduction du prolapsus dans le vagin, pour pouvoir uriner ou vidanger le rectum

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#121 #42 #Cours #Facultaires #Gynécologie #Incontinence #Médecine #Pelvienne #Tuméfaction #Urinaire
Traitement Un traitement n'est proposé que si la femme se plaint d'être gênée par ce prolapsus. La réé- ducation périnéale peut diminuer les symptômes associés à un prolapsus de stade 1 ou 2 et elle peut parfois faire « remonter » le prolapsus de 1 ou 2 cm au maximum ; elle est inefficace pour les prolapsus de stade 3 ou 4

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#121 #42 #Cours #Facultaires #Gynécologie #Incontinence #Médecine #Pelvienne #Tuméfaction #Urinaire
La figure 15.4 montre un pessaire cube que la femme mettra elle-même dans le vagin chaque matin avec un peu de lubrifiant (ou de crème aux œstrogènes si elle est ménopausée) et enlèvera chaque soir. Il existe aussi des pessaires en anneau qui sont posés par un médecin (si la patiente ne peut pas gérer le pessaire elle-même) et changés ou nettoyés régulièrement tous les 2 à 6 mois

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#121 #42 #Cours #Facultaires #Gynécologie #Incontinence #Médecine #Pelvienne #Tuméfaction #Urinaire
Devant toute suspicion d'incontinence, il faut éliminer une infection urinaire et une fistule urinaire

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#42 #Cours #Facultaires #Femme #Médecine #Pelvienne #Tuméfaction #Urologie
Le pelvis est un compartiment de la cavité abdominale situé entre le détroit supérieur (ligne entre bord supérieur du pubis et promontoire) et le plancher pelvien musculaire principale- ment représenté par le muscle levator ani

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#42 #Cours #Facultaires #Femme #Médecine #Pelvienne #Tuméfaction #Urologie
Le périnée est situé au-dessous du pelvis (sous le plan du muscle levator ani). Il contient l'orifice vulvaire, l'orifice anal et les fosses ischiorectales.

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#42 #Cours #Facultaires #Femme #Médecine #Pelvienne #Tuméfaction #Urologie
Chez la femme, le plancher pelvien a deux points de faiblesse : le hiatus urogénital et le hiatus rectal. La statique pelvienne (c'est-à-dire ce qui permet de maintenir les organes pelviens à leur place) est liée à l'action conjointe de trois systèmes : soutènement, suspension et angulation.

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#42 #Cours #Facultaires #Femme #Médecine #Pelvienne #Tuméfaction #Urologie
Enfin, l'angulation des organes pelviens assure une répartition des forces de contraintes sur le plancher pelvien : angulation de 60° du vagin par rapport à l'horizontal et antéversion de l'utérus sur le dôme vésical

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#42 #Cours #Facultaires #Femme #Médecine #Pelvienne #Tuméfaction #Urologie
Le prolapsus génital de la femme est une protrusion d'un ou plusieurs organes pelviens dans la cavité vaginale, voire extériorisés par l'orifice vulvaire, apparaissant ou s'accentuant à la poussée abdominale.

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#42 #Cours #Facultaires #Femme #Médecine #Pelvienne #Tuméfaction #Urologie
Diagnostics différentiels • Il doit être différencié du prolapsus rectal qui est une protrusion du conduit digestif dans le canal anal qui s'extériorise par l'anus, qui peut cependant être associé au prolapsus génital

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#42 #Cours #Facultaires #Femme #Médecine #Pelvienne #Tuméfaction #Urologie
Une caroncule urétrale qui est une lésion exophytique du méat urétral qui s'observe surtout chez la femme ménopausée

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#42 #Cours #Facultaires #Femme #Médecine #Pelvienne #Tuméfaction #Urologie
Les questionnaires ne permettent de dépister que les prolapsus symptomatiques tandis que l'examen clinique est descriptif de l'anatomie et évalue la prévalence des prolapsus de 31 à 97 %. Cela souligne qu'il existe un nombre important de prolapsus génitaux non symptomatiques. Cette prévalence augmente avec l'âge jusqu'à 50 ans. À partir de 50 ans la prévalence stagne et c'est le grade du prolapsus qui augmente alors avec l'âge

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#42 #Cours #Facultaires #Femme #Médecine #Pelvienne #Tuméfaction #Urologie
Facteurs de risque de l'apparition d'un POP • Facteurs de risque gynécologiques : ménopause, hypo-œstrogénie. • Facteurs de risque obstétricaux : la grossesse, l'accouchement par voie basse (poids du fœtus > 4 kg, manœuvres instrumentales), la multiparité. • Facteur de risque chirurgical : hystérectomie. • Facteurs de risque gastroentérologiques : troubles chroniques de l'exonération (constipation terminale ou dyschésie) et en règle générale toutes les poussées abdominales chroniques. • Antécédents familiaux de prolapsus (prédisposition génétique). • Les Caucasiennes et Hispaniques auraient plus de prolapsus que les Afro-Américaines

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#42 #Cours #Facultaires #Femme #Médecine #Pelvienne #Tuméfaction #Urologie
l'urgenturie, l'incontinence urinaire par urgenturie et l'hyperactivité vésicale peuvent être associées au prolapsus génital. Le lien physiopathologique n'est pas clairement élucidé (traction sur le trigone…) ; et la relation causale entre le prolapsus et ces symp- tômes n'est pas systématique

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#42 #Cours #Facultaires #Femme #Médecine #Pelvienne #Tuméfaction #Urologie
aux stades plus avancés, c'est la mauvaise vidange vésicale qui domine : dysurie et résidu, infections urinaires récidivantes, à l'extrême rétention urinaire et mictions par regorgement.

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#42 #Cours #Facultaires #Femme #Médecine #Pelvienne #Tuméfaction #Urologie
un cas particulier rare et classique doit être cité : l'insuffisance rénale obstructive par plicature urétérale bilatérale en cas de grand prolapsus vésical

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#42 #Cours #Facultaires #Femme #Médecine #Pelvienne #Tuméfaction #Urologie
Le troisième est de rechercher une incontinence urinaire à l'effort masquée par le prolapsus. (On réalisera un test d'effort de poussée abdominale et de toux vessie pleine et prolapsus réduit). Il n'y a pas de lien direct entre POP et incontinence urinaire d'effort mais des facteurs de risque communs expliquent la possible association des deux pathologies

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#42 #Cours #Facultaires #Femme #Médecine #Pelvienne #Tuméfaction #Urologie
la colpocystodéfécographie dynamique comporte deux phases : cystographie rétrograde dynamique (voire mictionnelle si des troubles de la miction sont associés), et une déféco- graphie obtenue par opacification vaginale, rectale et de l'intestin grêle. L'examen a l'avan- tage d'être réalisé en position assise plus physiologique pour obtenir une défécation, mais elle nécessite l'opacification des organes pelviens

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Article 4859883818252

AKBC_2019-openreview,net
#has-images #knowledge-base-construction #machine-learning #unfinished

AKBC 2019 Automated Knowledge Base Construction Amherst, Massachusetts, United States May 20 - May 21, 2019 http://www.akbc.ws/2019/ Important Information Note to Authors and Reviewers: Please update your OpenReview profile to have all your recent emails. AKBC 2019 Conference submissions are now closed. For more details refer to the AKBC 2019 - Call for Papers. Questions or Concerns Please contact the AKBC 2019 Program Chairs at info@akbc.ws with any questions or concerns about conference administration or policy. Please contact the OpenReview support team at info@openreview.net with any questions or concerns about the OpenReview platform. Submission Deadline: Midnight Pacific Time, Friday, November 16, 2018 Accepted Submissions Withdrawn Submissions Recent Activity NormCo: Deep Disease Normalization for Biomedical Knowledge Base Construction Dustin Wright, Yannis Katsis, Raghav Mehta, Chun-Nan Hsu 17 Nov 2018 (modif



#42 #Cours #Facultaires #Femme #Médecine #Pelvienne #Tuméfaction #Urologie
la défécographie IRM dynamique nécessite l'introduction de gel dans le rectum. La défini- tion des organes pelviens est de très bonne qualité, mais l'épreuve dynamique avec défé- cation est plus difficile à obtenir en position allongée dans l'IRM (fig. 4.7)

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#42 #Cours #Facultaires #Femme #Médecine #Pelvienne #Tuméfaction #Urologie
la chirurgie par voie abdominale : c'est la promonto-fixation (fig. 4.12) qui consiste à fixer une bandelette prothétique synthétique en haut sur le promontoire et en bas dans la cloi- son vésicovaginale pour la correction de la cystocèle et/ou dans la cloison recto-vaginale pour la correction de l'élytrocèle et de la rectocèle. Cette intervention est réalisée le plus souvent par cœlioscopie, parfois par laparotomie

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#42 #Cours #Facultaires #Femme #Médecine #Pelvienne #Tuméfaction #Urologie
la chirurgie par voie vaginale qui peut se faire par plicature des tissus naturels ou parfois avec interposition de prothèse synthétique. Chez la femme très âgée, fragile ne désirant plus de rapport sexuel, il peut être proposé une fermeture vaginale (colpocléisis)

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#42 #Cours #Facultaires #Femme #Médecine #Pelvienne #Tuméfaction #Urologie
La chirurgie « préventive » n'a pas de place car elle expose des patientes asymptomatiques à des complications sévères. On opère uniquement une patiente avec un prolapsus responsable d'une gêne lorsque l'on a établi avec une bonne probabilité le lien de cause à effet entre le prolapsus et la gêne. La chirurgie est le traitement de référence des formes symptomatiques modérées et sévères (≥ stade 2)

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#158 #Cours #Facultaires #Gynécologie #IST #Médecine
Chaque jour, plus d'un million de personnes contractent une IST et on estime que, chaque année, 500 millions de personnes contractent l'une des quatre IST suivantes : chlamydiose, gonococcie, syphilis, trichomonase (OMS 2013)

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#158 #Cours #Facultaires #Gynécologie #IST #Médecine

Infections à Chlamydia trachomatis

Chlamydia trachomatis est une bactérie de transmission sexuelle qui entraîne des infections génitales chez l'homme (urétrite, prostatite), et chez la femme : salpingite subaiguë et surtout chronique, volontiers latente et persistante

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#158 #Cours #Facultaires #Gynécologie #IST #Médecine

(Chlamydia)

  • Chez la femme, l'infection cervicale est de courte durée (localisation contaminante), donnant lieu, si elle n'est pas traitée, à une endométrite et à une salpingite qui peuvent être aiguës (elles sont alors traitées) ou chroniques (souvent reconnues plusieurs années plus tard au décours d'une consultation pour stérilité ou grossesse extra-utérine [GEU]).
    La femme n'est donc contaminante que pour une courte durée.
  • À l'inverse, chez l'homme, si l'infection non traitée atteint la prostate, le sperme peut être contaminant pendant plusieurs années lors des rapports sexuels

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#158 #Cours #Facultaires #Gynécologie #IST #Médecine
Chlamydia trachomatis qui comprend 15 sérovars. Les sérovars D-K sont responsables d'infections génitales mais aussi périhépatiques, de rhumatismes, d'infections néonatales

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#158 #Cours #Facultaires #Gynécologie #IST #Médecine
Les Chlamydia sont des germes intracellulaires qui nécessitent pour leur isolement l'utilisation de cultures cellulaires

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#158 #Cours #Facultaires #Gynécologie #IST #Médecine

(Chlamydia)

Diagnostic :

  • Il se fait par PCR en détectant l'antigène par multiplication du génome, méthode applicable à des prélèvements porteurs de peu d'antigènes.
  • Elle peut être réalisée sur un prélèvement d'endocol, urétral, vaginal ou sur 1er jet d'urines.
  • C'est aujourd'hui la technique diagnostique de référence

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#158 #Cours #Facultaires #Gynécologie #IST #Médecine
La sérologie (constamment positive en IgG en cas d'infection génitale haute, fréquemment positive en IgA, rarement en IgM) n'a en pratique aucun intérêt ++. En cas d'infection génitale basse isolée (col, urètre), elle est le plus souvent négative.

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#158 #Cours #Facultaires #Gynécologie #IST #Médecine

(Chlamydia)

  • Chez la femme :
    • une infection génitale basse (cervicite) : le plus souvent pauci ou asymptomatique (leucorrhées claires)
    • une infection génitale haute :
      • Endométrite possible, qui se manifeste souvent par des métrorragies minimes et intermittentes
      • Salpingite aiguë : douleurs pelviennes associées à un syndrome infectieux (fièvre, hyperleucocytose, élévation de la CRP) qui reste inconstant. La normalité du bilan inflammatoire n'élimine pas le diagnostic
      • Salpingite silencieuse : cause importante mais difficilement chiffrable de stérilité. L'étiologie de ces salpingites silencieuses est dominée par C. trachomatis

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#158 #Cours #Facultaires #Gynécologie #IST #Médecine

(Chlamydia)

  • Chez l'homme :
    • Une infection génitale basse : urétrite subaiguë avec écoulement séreux, urétrite aiguë purulente possible (mais la participation d'autres germes doit alors être discutée), fréquemment latente
    • Une infection génitale haute : orchite, prostatite subaiguë ou chronique souvent découverte lors d'un bilan de stérilité.

  • Le rôle de C. trachomatis dans la stérilité masculine a été discuté et semble faible. La plupart des hommes porteurs chroniques de C. trachomatis ont un sperme de fertilité conservée.

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[unknown IMAGE 4860057619724]
#158 #Cours #Facultaires #Gynécologie #IST #Médecine #has-images

(Chlamydia)

Traitement (fig. 16.1) :

  • Il repose sur les antibiotiques à diffusion intracellulaire : tétracyclines de synthèse, fluoroquinolones ou macrolides

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#158 #Cours #Facultaires #Gynécologie #IST #Médecine
La mauvaise observance des jeunes et des sujets à IST amène à préférer les traitements en une prise avec effet retard sur 8 jours, comme l'azithromycine (Zithromax ® ) qui peut être donnée à la dose de 1 g en une prise chez les deux partenaires avec autant de chances de succès (80 %) qu'avec les tétracyclines de synthèse.

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#158 #Cours #Facultaires #Gynécologie #IST #Médecine

(Chlamydia)

En cas d'infection génitale haute, le traitement doit être prolongé, le plus souvent par fluoroquinolones (ofloxacine : Oflocet ® ) pendant 14 à 21 jours

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Article 4860058930444

Olah-2015-Understanding_LSTM_Networks-colah,github,io
#has-images #machine-learning #nlp #unfinished

Understanding LSTM Networks Posted on August 27, 2015 Recurrent Neural Networks Humans don’t start their thinking from scratch every second. As you read this essay, you understand each word based on your understanding of previous words. You don’t throw everything away and start thinking from scratch again. Your thoughts have persistence. Traditional neural networks can’t do this, and it seems like a major shortcoming. For example, imagine you want to classify what kind of event is happening at every point in a movie. It’s unclear how a traditional neural network could use its reasoning about previous events in the film to inform later ones. Recurrent neural networks address this issue. They are networks with loops in them, allowing information to persist. Recurrent Neural Networks have loops. In the above diagram, a chunk of neural network, AA, looks at some input xtxt and outputs a value htht. A loop allows information to be passed from one step of the network to



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Infections à gonocoque

  • Le gonocoque, ou Neisseria gonorrhoeae, est un diplocoque à Gram négatif très fragile.

  • Il est responsable d'urétrite aiguë chez l'homme alors qu'il est souvent peu symptomatique chez la femme lors des infections génitales basses.
    Le diagnostic est souvent fait de manière indirecte chez une patiente dont le partenaire se plaint de brûlures mictionnelles.

  • Il s'agit d'une IST à déclaration obligatoire ++

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#158 #Cours #Facultaires #Gynécologie #IST #Médecine

(Gonocoque)

La culture sur milieux spécifiques est impérative pour pouvoir isoler le germe et réaliser un antibiogramme

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#158 #Cours #Facultaires #Gynécologie #IST #Médecine
En pratique, comme pour le Chamydia, le diagnostic d'infection à gonocoque se fait aujourd'hui par PCR

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Article 4860080688396

Weng-2018-Attention_Attention-lilianweng,github,io
#has-images #machine-learning #nlp #unfinished

Attention? Attention! Jun 24, 2018 by Lilian Weng attention rnn Attention has been a fairly popular concept and a useful tool in the deep learning community in recent years. In this post, we are gonna look into how attention was invented, and various attention mechanisms and models, such as transformer and SNAIL. [Updated on 2018-10-28: Add Pointer Network and the link to my implementation of Transformer.] [Updated on 2018-11-06: Add a link to the implementation of Transformer model.] [Updated on 2018-11-18: Add Neural Turing Machines.] [Updated on 2019-07-18: Correct the mistake on using the term “self-attention” when introducing the show-attention-tell paper; moved it to Self-Attention section.] What’s Wrong with Seq2Seq Model? Born for Translation Definition A Family of Attention Mechanisms Summary Self-Attention Soft vs Hard Attention Global vs Local Attention Neural Turing Machines Reading and Writing Attention Mechanisms Pointer Network



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(Gonocoque)

  • Chez l'homme
    • Urétrite symptomatique, épididymite et prostatite sont les atteintes habituelles.
    • Les signes rencontrés sont les brûlures mictionnelles, les dysuries, les hématuries, des écoulements purulents au niveau du méat, des douleurs éjaculatoires, des douleurs scrotales et un ténesme rectal (dans le cadre d'une prostatite)

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#158 #Cours #Facultaires #Gynécologie #IST #Médecine

(Gonocoque)

  • Chez la femme
    • Souvent asymptomatique (40 à 60 % des cas), on doit l'évoquer et rechercher le gonocoque devant des leucorrhées jaunes, verdâtres, purulentes, surtout si elles sont associées à une urétrite ou une skénite (inflammation de la glande de Skene para-urétrale). L'aspect au spéculum est celui d'une endocervicite purulente

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#158 #Cours #Facultaires #Gynécologie #IST #Médecine
Le gonocoque représente environ 10 % des salpingites aiguës. L'évolution se fait vers le pyo-salpinx ou l'abcès tubo-ovarien, et vers la périhépatite (syndrome de Fitz-Hugh-Curtis)

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#158 #Cours #Facultaires #Gynécologie #IST #Médecine

(Gonocoque)

Traitement :

  • On assiste depuis quelques années à une augmentation des résistances du germe à la pénicilline et aux cyclines (13 % pour la pénicilline G, 56 % pour la tétracycline en 2012).
  • Le traitement de 1ère intention utilise :
    • Une céphalosporine de 3ème génération en traitement minute (ceftriaxone : Rocéphine ® 500 mg IM)
      OU
    • Une fluoroquinolone (ofloxacine : Oflocet ® 400 mg per os)

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#158 #Cours #Facultaires #Gynécologie #IST #Médecine

Syphilis :

  • Le germe est Treponema pallidum.
    C'est un germe fragile, parfois difficile à mettre en évidence.

  • Les sérologies posent des problèmes de faux positifs et de réactions croisées avec d'autres tréponèmes.

  • La durée d'incubation est de 3 à 4 semaines

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#158 #Cours #Facultaires #Gynécologie #IST #Médecine
La mise en évidence du tréponème au microscope à fond noir se fait à partir de sérosités du chancre primaire (grattage au vaccinostyle). Il s'agit du seul diagnostic de certitude, avec une spécificité de 100 %

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#158 #Cours #Facultaires #Gynécologie #IST #Médecine

Méthode à antigène non tréponémique :

  • VDRL (Veneral Disease Research Laboratory), reposant sur une réaction non spécifique utilisant le cardiolipide.
  • Il existe des faux positifs (grossesse, LES, SAPL, toxicomanie)

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Article 4860125515020

Olah_Carter-2016-Attention_and_Augmented_RNNs-distill,pub
#has-images #machine-learning #unfinished

Attention and Augmented Recurrent Neural Networks CHRIS OLAHGoogle Brain SHAN CARTERGoogle Brain Sept. 8 2016 Citation: Olah & Carter, 2016 Recurrent neural networks are one of the staples of deep learning, allowing neural networks to work with sequences of data like text, audio and video. They can be used to boil a sequence down into a high-level understanding, to annotate sequences, and even to generate new sequences from scratch! x0y0x1y1x2y2x3y3One cell...can be used over...and over...and over...x4y4again. The basic RNN design struggles with longer sequences, but a special variant—“long short-term memory” networks [1]—can even work with these. Such models have been found to be very powerful, achieving remarkable results in many tasks including translation, voice recognition, and image captioning. As a result, recurrent neural networks have become very widespread in the last few years. As this has happened, we’ve seen a gr



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Méthodes à antigène tréponémique :

  • Tests classiques de dépistage et de confirmation de 1ère ligne :
    • TPHA (Treponema Pallidum Hemagglutination Assay)
    • FTA (Fluorescent Treponema Antibody test-absorbed).
      • Il se positive précocement (il détecte les IgM spécifiques), 5 à 8 jours après le chancre, mais nécessite un microscope à fluorescence.
        Il s'agit d'une recherche coûteuse

  • Tests immuno-enzymatiques plus récents (ELISA), détectant les IgM (moins utilisés en France)

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#158 #Cours #Facultaires #Gynécologie #IST #Médecine

(Syphilis)

C'est la diminution du VDRL qui permet de suivre l'efficacité du traitement

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#158 #Cours #Facultaires #Gynécologie #IST #Médecine
La sérologie syphilitique est obligatoirement prescrite lors de la déclaration de grossesse. Il s'agit d'une pathologie à déclaration obligatoire

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#158 #Cours #Facultaires #Gynécologie #IST #Médecine

(Syphilis)

L'ulcération est unique, superficielle, non douloureuse, de 5 à 15 mm de diamètre, à fond propre, limite nette et base indurée. Les adénopathies inguinales sont fermes, indolores et souvent bilatérales

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#158 #Cours #Facultaires #Gynécologie #IST #Médecine
La présence du chancre syphilitique signe une syphilis primaire.

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Article 4860144389388

Irving_Askell-2019-AI_Needs_Social_Scientists-distill,pub
#ai-safety #has-images #machine-learning #philosophy #unfinished

AI Safety Needs Social Scientists Properly aligning advanced AI systems with human values will require resolving many uncertainties related to the psychology of human rationality, emotion, and biases. These can only be resolved empirically through experimentation — if we want to train AI to do what humans want, we need to study humans. AUTHORS AFFILIATIONS Geoffrey Irving OpenAI Amanda Askell OpenAI PUBLISHED Feb. 19, 2019 DOI 10.23915/distill.00014 Contents An overview of AI alignment Debate: learning human reasoning Questions social science can help us answer Reasons for optimism Reasons to worry The scale of the challenge Conclusion: how you can help The goal of long-term artificial intelligence (AI) safety is to ensure that advanced AI systems are reliably aligned with human values — that they reliably do things that people want them to do. 1 Since it is difficult to write down precise rules describing human values,



#158 #Cours #Facultaires #Gynécologie #IST #Médecine
Le contexte clinique au stade de syphilis primaire est généralement évocateur avec la notion de chancre et/ou la notion de rapport sexuel récent avec une personne ayant eu une syphilis. Le traitement devra être instauré sur la clinique sans attendre les résultats du laboratoire.

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#158 #Cours #Facultaires #Gynécologie #IST #Médecine

On distingue différents stades :

  • Syphilis primaire :
    • Chancre, adénopathies

  • Syphilis secondaire :
    • Éruption cutanéomuqueuse ± fièvre, arthralgies, adénopathies, etc.
    • Elle survient 6 semaines à 6 mois après le chancre

  • Syphilis tertiaire :
    • Atteinte cutanée (gommes), neurologique, cardiovasculaire.
    • Elle survient plusieurs années après le contage. Elle est rare de nos jours

  • Syphilis latente :
    • Pas de signes cliniques. La forme précoce a moins d'un an d'évolution, la forme tardive a plus d'un an d'évolution

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#158 #Cours #Facultaires #Gynécologie #IST #Médecine

Parmi ces stades, on distingue :

  • La syphilis récente : syphilis primaire, secondaire et latente précoce
  • La syphilis tardive : syphilis latente tardive et tertiaire

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Article 4860151205132

Olah-2019-Collaboration_&_Credit_Principles-colah,github,io
#collaboration #soft-skills #unfinished

Collaboration & Credit Principles How can we be good stewards of collaborative trust? Posted on May 30, 2019 TL;DR: This essay makes a lot of suggestions, but the most useful/non-obvious/actionable are likely: (1) Be generous. (2) Use author contribution statements. (3) Put "author order not finalized" if it hasn't been. A lot of the best research in machine learning comes from collaborations. In fact, many of the most significant papers in the last few years (TensorFlow, AlphaGo, etc) come from collaborations of 20+ people. These collaborations are made possible by goodwill and trust between researchers. This goodwill and trust is a precious shared resource, and it can be a fragile thing. When people work together, it’s easy to have conflict, especially around attribution and credit. If dealt with poorly, attribution issues can fester. I'm aware of several cases of collaborations dieing, or people leaving teams and organizations, where and the underlying issue wa



#158 #Cours #Facultaires #Gynécologie #IST #Médecine

Traitement :

  • Le traitement de référence reste la pénicilline G qui est constamment efficace.

  • Pour une syphilis récente (primosecondaire de moins d'un an), une dose unique de benzathine benzylpénicilline (Extencilline ® ) 2,4 MUI en IM.
  • Pour une syphilis tardive, on fera 3 injections d'Extencilline ® en IM espacées d'une semaine chacune.

  • En cas d'allergie à la pénicilline, on utilisera la doxycycline à la dose de 100 mg per os, 2 fois/j pendant 2 semaines

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[unknown IMAGE 4860165098764]
#158 #Cours #Facultaires #Gynécologie #IST #Médecine #has-images
Les leucorrhées correspondent à des écoulements vaginaux anormaux en rapport avec une infection génitale, basse ou haute. Elles sont à distinguer des leucorrhées physiologiques dues aux sécrétions de glaire cervicale et des glandes annexes (Skène et Bartholin) et à la desquamation vaginale

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#158 #Cours #Facultaires #Gynécologie #IST #Médecine

Les leucorrhées physiologiques proviennent :

  • De la desquamation vaginale, responsable de leucorrhée laiteuse, peu abondante, opalescente, augmentant en période prémenstruelle
  • De la glaire cervicale sécrétée par les cellules cylindriques de l'endocol qui augmente du 8 e au 15 e jour du cycle, translucide, cristallisant en feuille de fougère.

  • Ces sécrétions physiologiques n'engendrent aucune irritation, sont inodores et ne contiennent pas de polynucléaires

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#158 #Cours #Facultaires #Gynécologie #IST #Médecine
La flore dominante est le bacille de Döderlein : lactobacille tapissant la muqueuse vaginale.
Il transforme le glycogène abondamment contenu dans les cellules vaginales et cervicales grâce à l'imprégnation œstrogénique en acide lactique.
Cet acide lactique explique le pH acide du vagin qui est un facteur protecteur de la pullulation microbienne

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#158 #Cours #Facultaires #Gynécologie #IST #Médecine

Cette flore vaginale évolue selon :

  • L'âge : il y a moins de bacilles de Döderlein avant la puberté et après la ménopause
  • Le cycle : les aérobies diminuent avant et après les règles
  • La contraception : en cas de DIU, on constate une augmentation des anaérobies.

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#158 #Cours #Facultaires #Gynécologie #IST #Médecine
Le prurit oriente vers une mycose, la brûlure vers un Trichomonas ou un germe banal

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#158 #Cours #Facultaires #Gynécologie #IST #Médecine
Le frottis de dépistage n'est pas optimal dans des conditions d'infection mais pourra être réalisé chez une patiente mal ou non suivie

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#158 #Cours #Facultaires #Gynécologie #IST #Médecine

Test à la potasse (sniff test)

  • Il consiste à ajouter sur le prélèvement étalé sur lame une goutte de potasse à 10 %.
  • Cette potasse permet de lyser les corps cellulaires et, ainsi, de mieux voir les éléments mycosiques et surtout dégage une odeur de poisson pourri très évocatrice de la présence conjuguée d'anaérobies et de Gardnerella vaginalis signant une vaginose bactérienne

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Modalité de prélèvement vaginal (pas obligatoire, recommandé dans certaines situations)

Il peut s'agir :

  • D'un prélèvement vaginal standard à la recherche d'une candidose, d'une vaginose (importance du score de Nugent qui évalue la flore lactobacillaire) ou d'une vaginite
  • D'une recherche des IST : Chlamydia trachomatis, gonocoque ou Mycoplasma genitalium par technique d'amplification génique sur un prélèvement vaginal
  • D'un prélèvement endocervical en cas de suspicion d'IGH (sur milieu de transport type Portagerm ® )

  • Le suivi post-thérapeutique ne nécessite pas de contrôle systématique par prélèvement sauf en cas de persistance des signes

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#158 #Cours #Facultaires #Gynécologie #IST #Médecine

La vaginite à Trichomonas est de contamination vénérienne par un parasite, T. vaginalis ; elle est un bon marqueur d'IST et justifie ainsi la recherche systématique d'autres germes.

  • Les leucorrhées sont verdâtres, mousseuses, spumeuses, abondantes et nauséabondes (odeur de plâtre frais).
  • Au spéculum, le vagin est rouge, le col framboisé.
  • Le prurit est variable en intensité, il existe souvent des brûlures au moment des rapports ou des mictions

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#158 #Cours #Facultaires #Gynécologie #IST #Médecine

Mycose :

  • Le symptôme essentiel est une vulvovaginite prurigineuse.
    Intense, parfois intolérable, le prurit entraîne souvent une dysurie, voire une pollakiurie.

  • Au spéculum, les leucorrhées sont blanches, caillebottées (comme du lait caillé), grumeleuses, tapissant les parois du vagin.

  • La vulve est inflammatoire, œdémateuse avec de fréquentes lésions de grattage.
    L'extension sur le périnée postérieur est fréquente.
    Le vagin est rouge, faisant ressortir le blanc des leucorrhées.

  • L'examen au microscope montre des filaments mycéliens. Candida albicans est la levure le plus souvent retrouvée.

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(Mycose vaginale)

  • La prescription comprend un traitement topique à base d'un imidazolé, tel le sertaconazole (Monazol ® ), ou le fenticonazole (Lomexin ® ), en ovule vaginal en dose unique et crème (applications pendant 7 jours).
  • Le traitement du partenaire n'est pas utile en l'absence de signes cliniques.

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(Mycose vaginale)

En cas de récidive, il faut :

  • Rechercher des facteurs favorisants comme une antibiothérapie, un diabète ou une grossesse
  • Éliminer une autre cause infectieuse (herpès)
  • Réaliser un mycogramme pour éliminer une résistance aux traitements
  • Envisager un traitement de longue durée per os (fluconazole) ou par voie vaginale

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Vaginose bactérienne (VB) :

  • La VB est un déséquilibre de la flore vaginale caractérisé où la flore lactobacillaire est remplacée par la prolifération anormale d'autres espèces microbiennes (anaérobies essentiellement mais aussi G. vaginalis et M. hominis).
  • Très fréquente, elle est caractérisée par des pertes grises peu abondantes malodorantes.

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(Vaginose bactérienne)

Le traitement comprend un traitement par métronidazole (Flagyl ® ) :

  • Soit 2 g per os en monodose
  • Soit 2 fois 500 mg/j pendant 7 jours.

Le traitement du partenaire est inutile car il ne s'agit pas d'une IST.

Les récidives sont fréquentes et doivent faire rechercher les causes de déséquilibre de l'écosystème vaginal (traitement hormonal, etc.)

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#158 #Cours #Facultaires #Gynécologie #IST #Médecine
Au prélèvement vaginal, on note un score de Nugent élevé mais son association avec des anaérobies est facilement reconnue par le test à la potasse (sniff test)

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#158 #Cours #Facultaires #Gynécologie #IST #Médecine
Gonocoque Hautement pathogène, il est aussi responsable d'IGH. Les leucorrhées sont jaunes ou verdâtres, purulentes avec parfois des signes d'urétrite ou de skénite. L'examen au spéculum trouve une cervicite avec glaire purulente, les parois vaginales sont rouges, saignant au contact. La notion d'urétrite chez le partenaire ou d'écoulement méatique doit faire penser au diagnostic

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#158 #Cours #Facultaires #Gynécologie #IST #Médecine
La recherche se fait à présent par technique d'amplification génique (PCR). De plus en plus de souches de gonocoque sont devenues multirésistantes aux antibiotiques et le traitement (et celui systématique du parte- naire) repose sur la ceftriaxone (Rocéphine ® ) : 1 g IM en dose unique

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#158 #Cours #Facultaires #Gynécologie #IST #Médecine
Mycoplasme, Chlamydia Les leucorrhées sont inconstantes mais il existe habituellement une endocervicite, parfois discrète. Chlamydia trachomatis et Mycoplasma genitalium sont des IST fréquentes chez les 15-25 ans, souvent asymptomatiques mais responsables d'IGH

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Le diagnostic se fait par PCR. Les autres mycoplasmes retrouvés au niveau génital, Mycoplasma hominis et les Ureaplasma peuvent faire partie de la flore vaginale commensale. Ils ne sont pas responsables d'IST. Leur rôle pathogène dans les infections génitales est discutable. Ils sont en revanche responsables de pathologies obstétricales (accouchements prématurés, rupture prématurée des membranes). Le traitement repose sur les cyclines (7 jours par voie orale) ou sur l'azithromycine (Zithromax Monodose ® en prise unique de 1 g)

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Cervicite Souvent due à C. trachomatis, au gonocoque ou à M. genitalium, une endocervicite peut être asymptomatique ou responsable de leucorrhées.

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#158 #Cours #Facultaires #Gynécologie #IST #Médecine
Causes néoplasiques Les leucorrhées (associées ou non à des métrorragies provoquées) peuvent être révélatrices d'un cancer cervica

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#158 #Cours #Facultaires #Gynécologie #IST #Médecine
Une hydrorrhée doit faire évoquer une pathologie utérine ou tubaire

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#158 #Cours #Facultaires #Gynécologie #IST #Médecine
Femme ménopausée Les deux causes de leucorrhées auxquelles il faut penser chez les personnes ménopausées sont : • l'atrophie par carence hormonale et dont la modification de la flore explique l'aspect de vaginite sénile. Le traitement sera hormonal ; • l'origine néoplasique cervicale, endométriale ou tubaire

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Jeune fille Les vulvovaginites infectieuses sont possibles chez la jeune fille. Le plus souvent, il s'agit de germes banals (Streptococcus pyogenes notamment), parfois une oxyurose ou une mycose. Il faut toutefois penser à l'exceptionnel corps étranger intravaginal que l'on sent parfois par le toucher rectal.

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#158 #Cours #Facultaires #Gynécologie #IST #Médecine
La notion de salpingite doit être remplacée par celle d'IGH qui recouvre les infections utérines et annexielles. Il s'agit d'infections secondaires à l'ascension de germes du vagin à travers le col

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#158 #Cours #Facultaires #Gynécologie #IST #Médecine
Les pathogènes (les infections polymicrobiennes sont fréquentes) peuvent être des IST ou des germes banals transmis ou d'une manœuvre endo-utérine (hystérographie, hystéroscopie, curetage, IVG, délivrance artificielle, révision utérine, DIU). Il s'agit exceptionnellement d'une infection de voisinage (appendicite, sigmoïdite)

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Chlamydia trachomatis : germe intracellulaire, c'est la plus fréquente des bactéries sexuellement transmissibles.

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Symptomatologie Il s'agit : • de douleurs pelviennes récentes aux caractéristiques cliniques très variables (localisation, intensité, etc.). Les dyspareunies sont fréquentes ; • de leucorrhées anormales ; • parfois de métrorragies ; • de signes fonctionnels urinaires : pollakiurie, brûlures mictionnelles. Un syndrome infectieux, voire des signes discrets d'irritation péritonéale n'existent que dans les formes compliquées (abcès pelviens, pelvipéritonite).

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Examen de l'abdomen Il relève : • une sensibilité, une douleur limitée à l'hypogastre, parfois une défense ; • l'absence de défense ou de contracture ; • parfois une douleur de l'hypocondre droit (dans le cadre d'une périhépatite ou syndrome de Fitz-Hugh-Curtis) ; • l'absence de douleurs à la palpation des fosses lombaires ; le signe de MacBurney est négatif

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• Au toucher vaginal, on retrouve : – une mobilisation utérine douloureuse qui constitue le signe le plus évocateur ; – associée ou non à une douleur au niveau d'un ou des deux culs-de-sac vaginaux laté- raux, voire d'un empâtement douloureux des culs-de-sac

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#158 #Cours #Facultaires #Gynécologie #IST #Médecine
Les examens microbiologiques sont indispensables : • recherche d'une IST par technique PCR à partir d'un prélèvement vaginal ; • recherche des autres pathogènes par un prélèvement endocervical avec milieu de transport adapté (type Portagerm ® ) ; • en cas de contraception par DIU, il est préférable de le retirer et de le mettre en culture.

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#158 #Cours #Facultaires #Gynécologie #IST #Médecine
L'échographie pelvienne (surtout par voie endovaginale) est nécessaire. On cherche les inconstants signes directs d'atteinte tubaire (épaississement, aspect en roue dentée) ; l'échographie peut diagnos- tiquer un abcès pelvien et s'avère utile pour éliminer une autre pathologie notamment annexielle.

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#158 #Cours #Facultaires #Gynécologie #IST #Médecine
La cœlioscopie était l'examen de référence pour les salpingites. Compte tenu de son carac- tère invasif pouvant entraîner des effets indésirables graves, elle n'est actuellement réservée qu'aux cas d'incertitude diagnostique ou en l'absence d'amélioration après quelques jours de traitement

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#158 #Cours #Facultaires #Gynécologie #IST #Médecine
Abcès pelviens Pyosalpinx, abcès ovariens ou abcès du cul-de-sac recto-utérin constituent les plus fréquentes des complications aiguës : ils compliquent 10 à 35 % des IGH. Il existe des signes généraux avec fièvre et altération de l'état général. Les douleurs pelviennes sont habituellement importantes et peuvent s'accompagner de troubles du transit intestinal. Le toucher vaginal est très douloureux ; il existe une masse pelvienne latéro-utérine fixée, uni ou bilatérale, habituellement collée à l'utérus

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L'examen trouve une défense abdominale – voire une contracture – localisée à la région sous-ombilicale. Les touchers pelviens déclenchent une douleur diffuse, classiquement plus marquée au niveau du cul-de-sac recto-utérin où une masse est parfois perçue. La présence de leucorrhées ou d'une contraception par DIU peut orienter vers l'origine génitale de cette péritonite

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#158 #Cours #Facultaires #Gynécologie #IST #Médecine
l comporte une antibiothérapie probabiliste, c'est-à-dire efficace sur les différents pathogènes habituels des IGH pour une durée de 14 jours. Les formes non compliquées sont traitées en externe, essentiellement par voie orale, alors que les formes compliquées sont hospitalisées et l'antibiothérapie est instaurée par voie IV

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#158 #Cours #Facultaires #Gynécologie #IST #Médecine
Les mesures associées sont : • le retrait d'un éventuel DIU ; • le repos ; • l'administration d'un antalgique ; • la protection des rapports sexuels (préservatifs) ; • le traitement du partenaire en cas d'IST. Un examen clinique de contrôle doit être effectué

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#158 #Cours #Facultaires #Gynécologie #IST #Médecine
Traitement des IGH compliquées La patiente est hospitalisée et une antibiothérapie est instaurée par voie parentérale, souvent complétée par un drainage en cas de collection abcédée. Le CNGOF, dans ses recommandations, propose les associations ceftriaxone + métronidazole + doxycycline, ofloxacine + métronidazole ou céfoxitine + doxycycline, pour une durée totale de 14 à 21 jours, avec l'éventuelle adjonction de gentamicine en cas de sepsis sévère

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#158 #Cours #Facultaires #Gynécologie #IST #Médecine
L'antibiothérapie parentérale est ensuite poursuivie quelques jours (jusqu'à l'obtention de l'apyrexie et de l'amélioration clinique) avant un relais oral. La durée totale de traitement sera généralement de 21 jours en fonction de l'évolution clinique et biologique

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#158 #Cours #Facultaires #Gynécologie #IST #Médecine
En complément à l'antibiothérapie et en cas d'abcès pelvien, un drainage de la collection est utile dès que celle-ci mesure plus de 3 cm de diamètre.

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#158 #Cours #Facultaires #Gynécologie #IST #Médecine
En cas de pelvipéritonite, le traitement repose essentiellement sur l'antibiothérapie parenté- rale, sous surveillance, en milieu chirurgical, et la patiente étant laissée à jeun les premières 36 à 48 heures. Une amélioration clinique et biologique doit être observée après 48 heures, autorisant la poursuite de l'antibiothérapie puis le relais par voie orale. Dans le cas contraire, une vérification chirurgicale s'impose.

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
• Principaux sites d'infection sont : – urètre chez l'homme (portage asymptomatique exceptionnel) ; – col et vagin chez la femme. • Portage pharyngé fréquent, le plus souvent asymptomatique chez les homo- ou bisexuels et impose une recherche systématique en cas de conduite à risque (partenaires multiples et rapports oro-génitaux réceptifs non protégés)

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
Épidémiologie • Incidence en augmentation : – elle est plus élevée chez les hommes que chez les femmes ; – elle est plus élevée en Ile-de-France qu'ailleurs en France

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
• Diminution de la sensibilité aux antibiotiques avec : – résistances : – à la pénicilline par production de β-lactamase (15 % des souches), – aux cyclines (20 %), – à la ciprofloxacine (40 %) ; – augmentation des CMI pour les céphalosporines de 3 e génération et observation ponc- tuelle de résistances vraies

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
L'incubation est courte (2 à 7 jours) et le malade contagieux

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
L'oropharyngite est le plus souvent asymptomatique. La mauvaise diffusion des anti- biotiques dans cette localisation est responsable de portage persistant après traitement et de maintien de la chaîne de contamination

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
L'anorectite est asymptomatique dans 2/3 des cas. On peut observer : • prurit anal ; • anite ; • écoulement rectal purulent ; • diarrhée, saignements anorectaux ; • syndrome rectal (ténesme, épreintes, diarrhée mucopurulente) et/ou sensations de déféca- tions incomplètes.

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
Infections non compliquées chez l'homme Le tableau est le plus souvent bruyant. L'urétrite antérieure aiguë est la manifestation la plus fréquente. On peut observer : • écoulement urétral purulent (90 % des cas) ; • dysurie ; • douleurs urétrales : brûlures permanentes ou mictionnelles ; • prurit urétral ; • méatite, voire balanite

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
Infections non compliquées chez la femme L'infection est asymptomatique dans 70 % des cas. La cervicite est la manifestation la plus fréquente chez la femme. On peut observer : • leucorrhées purulentes ; • pesanteur pelvienne ; • signes d'urétrite associée ; • col non ou peu inflammatoire et écoulement purulent à l'orifice cervical. L'anorectite est plus rare que chez l'homme. L'oropharyngite présente les mêmes caractéristiques que chez l'homme

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
Septicémie gonococcique : • fièvre ; • atteinte cutanée : purpura pétéchial ; papules ou papulo-pustules acrales ou périarticulaires ; • et/ou atteinte articulaire : mono- ou oligo-arthrites septiques ; ténosynovites. Plus rarement, péri-hépatite, endocardite ou méningite

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
Devant un tableau d'urétrite, le prélèvement bactériologique peut être réalisé : • sur écoulement urétral spontané (majorité des cas) ; • en l'absence d'écoulement : – au mieux sur premier jet d'urine (au moins 2 heures après la dernière miction)

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
Les prélèvements pharyngé et anal doivent être recommandés chez les patients à risque ayant des rapports oro-génitaux ou anaux non protégés

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
L'urétrite « biologique » est définie par : • > 5 polynucléaires neutrophiles au frottis urétral à grossissement 100 ; • ou > 10 polynucléaires neutrophiles au grossissement 400

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
L'examen direct (coloration de Gram ou bleu de méthylène) montre des diplocoques Gram négatifs, « en grain de café », intracellulaires : • bonne sensibilité et bonne spécificité > 95 % dans l'urétrite masculine symptomatique, moins bonne pour les autres sites et chez la femme.

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
La mise en culture sur gélose au sang cuit (« gélose chocolat ») est systématique : • elle confirme le diagnostic ; • elle donne un antibiogramme en 24 à 48 heures (utile pour le suivi des résistances) ; • la sensibilité de la culture est moins bonne à l'oropharynx, l'anus et au col, intérêt de la PCR mais qui ne permet pas de tester la sensibilité de la souche et qui n'est pas remboursée

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
Traitement Un traitement anti-Chlamydia est systématiquement associé (urétrite mixte dans 15 % des cas)

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
Les relations sexuelles doivent être évitées/protégées pendant au moins 7 jours et le traitement du/de la ou des partenaires est systématique.

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
Traitement des infections non compliquées (urétrite, cervicite, anorectite, pharyngite) : • 1 re intention : ceftriaxone IM unique ou IV si anomalie de l'hémostase de 500 mg ; • en cas d'allergie aux β-lactamines : – azithromycine 2 gr PO DU, – gentamycine 240 mg IM DU, – ciprofloxacine (avec antibiogramme) 500 mg PO DU ; • traitement anti-chlamydia systématique (azithromycine ou doxycycline)

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
hez la femme enceinte : • quinolones, cyclines, aminosides contre-indiqués ; • Ceftriaxone (IM unique de 500 mg) ou céfixime (prise orale unique de 400 mg)

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
Orchi-épididymite : ceftriaxone (IM unique de 500 mg) ou céfixime (prise orale unique de 800 mg).

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
Septicémie à gonocoque : hospitalisation + ceftriaxone (1 g/j, IV, 7 à 10 jours)

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
Endocardite, méningite : • hospitalisation ; • ceftriaxone (1 à 2 g/j, IV) : – 10 à 14 jours si méningite, – 4 semaines si endocardite

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
Endométrite, salpingite : ceftriaxone (1 g/j, IV, 14 jours)

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
Un contrôle clinique systématique doit être réalisé à J7

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
Un contrôle bactériologique est indiqué à J7 : • si infection pharyngée non traitée par ceftriaxone (mauvaise pénétration des AB) ; • si persistance de signes cliniques dans les autres localisations

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
Infections à Chlamydia trachomatis • Bacille Gram négatif, intracellulaire obligatoire, immobile • Sérotypes D à K, responsables d'infections urogénitales. • Sérotypes L1, L2 et L3, responsables de la lymphogranulomatose vénérienne (LGV), ou maladie de Nicolas-Favre

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
Épidémiologie • 50 fois plus fréquente que la gonococcie. • Première cause d'IST bactérienne dans les pays industrialisés (prévalence estimée jusqu'à 10 %). • Première cause identifiée d'urétrite aiguë, suivie par le gonocoque

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
• Pic d'incidence survient entre 15 et 34 ans chez la femme et entre 20 et 39 ans chez l'homme. • Fréquence élevée du portage asymptomatique favorisant la diffusion dans la population générale. • Dépistage systématique par auto-prélèvement vaginal chez les femmes de moins de 25 ans recommandé en France.

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
Symptomatologie clinique La fréquence du portage asymptomatique de Chlamydia trachomatis (50 % des cas chez l'homme et 50 à 90 % des cas chez la femme) contribue au maintien de la chaîne épidémio- logique, et à la survenue des complications tardives de l'infection

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
Chlamydioses non compliquées chez l'homme L'incubation est variable, de quelques jours à quelques mois. L'urétrite est la manifestation la plus fréquente chez l'homme : • écoulement urétral présent dans moins de 50 % des cas ; • le plus souvent clair, modéré et intermittent. Des pharyngites et des anorectites sont possibles, mais rarement symptomatiques

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
Chlamydioses non compliquées chez la femme La cervicite est la forme la plus fréquente des chlamydioses urogénitales basses de la femme. Elle est le plus souvent asymptomatique (50 à 90 % des cas) : • si symptomatique : – leucorrhées blanchâtres ou jaunâtres ; – cystalgies ; – syndrome urétral ; – et/ou une dyspareunie. • à l'examen : – fragilité du col utérin ; – et/ou sécrétions mucopurulentes ; – et/ou un ectropion friable et hémorragique.

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Chez l'homme Complications locorégionales : • prostatite ; • épididymite aiguë

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Chez la femme • Endométrite, salpingite, le plus souvent subaiguës ou chroniques ; • Secondairement, algies pelviennes inflammatoires, stérilité tubaire et grossesse extra-utérine • Plus rarement : péri-hépatite (tableau de cholécystite alithiasique, diagnostic sous cœlioscopie)

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
Dans les deux sexes • Syndrome oculo-uréthro-synovial : – polyarthrite aiguë ou subaiguë réactionnelle ; – urétrite ; – conjonctivite bilatérale ; – balanite circinée ; – kératodermie palmoplantaire psoriasiforme. • Kératoconjonctivite. • Arthrite

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
Chez le nouveau-né (en cas d'infection urogénitale maternelle) • Kératoconjonctivite. • Pneumopathie

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
'amplification génique par PCR (plus sensible que la culture) est l'examen clé du diagnostic Les prélèvements bactériologiques peuvent être pratiqués : – chez l'homme symptomatique ou non : sur un 1 er jet urinaire (10 à 20 ml), au moins 2 heures après la dernière miction ; – chez la femme symptomatique : sur un écouvillonnage d'endocol associé au mieux par un prélèvement au pourtour urétral lors d'un examen au spéculum, en réalisant un raclage de la muqueuse ; – chez la femme asymptomatique : sur un écouvillonnage vulvovaginal (auto-prélèvement). La sérologie n'a pas d'intérêt dans le diagnostic des infections à Chlamydia

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
Traitement des formes non compliquées • Première intention : azithromycine (prise orale unique d'1 g) ou doxycycline (100 mg/12 heures, per os, 7 jours) • Deuxième intention : érythromycine (500 mg/6 heures, per os, 7 jours) ou ofloxacine (300 mg/12 heures, per os, 7 jours) • Contrôle PCR systématique entre 1 à 6 mois chez les femmes jeunes

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
Femme enceinte • Azithromycine (prise orale unique d'1 g). • PCR systématique à 1 mois

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
Orchiépididimyte Doxycycline (100 mg/12 heures, 10 jours)

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Article 4860262878476

Fearnhead et al. 2007: On‐line inference for multiple changepoint problems

On‐line inference for multiple changepoint problems Paul Fearnhead Lancaster University, UK Search for more papers by this author Zhen Liu Lancaster University, UK Search for more papers by this author Paul Fearnhead Lancaster University, UK Search for more papers by this author Zhen Liu Lancaster University, UK Search for more papers by this author First published: 02 August 2007 https://doi.org/10.1111/j.1467-9868.2007.00601.x Citations: 87 'ejournals@cambridge - find full text' Paul Fearnhead, Department of Mathematics and Statistics, Fylde College, Lancaster University, Lancaster, LA1 4YF, UK. E‐mail: p.fearnhead@lancaster.ac.uk About Sections Abstract 1. Introduction 2. Models and notation 3. On‐line inference 4. Numerical examples 5. DNA segmentation 6. Discussions Acknowledgements Appendices References Citing Literature Abstract



We (Fearnhead et al. 2007) propose an on‐line algorithm for exact filtering of multiple changepoint problems. This algorithm enables simulation from the true joint posterior distribution of the number and position of the changepoints for a class of changepoint models. The computational cost of this exact algorithm is quadratic in the number of observations.

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Fearnhead et al. 2007: On‐line inference for multiple changepoint problems
t 1. Introduction 2. Models and notation 3. On‐line inference 4. Numerical examples 5. DNA segmentation 6. Discussions Acknowledgements Appendices References Citing Literature Abstract Summary. <span>We propose an on‐line algorithm for exact filtering of multiple changepoint problems. This algorithm enables simulation from the true joint posterior distribution of the number and position of the changepoints for a class of changepoint models. The computational cost of this exact algorithm is quadratic in the number of observations. We further show how resampling ideas from particle filters can be used to reduce the computational cost to linear in the number of observations, at the expense of introducing small erro




The advantages of direct simulation methods over MCMC and reversible jump MCMC methods are that

  • (a)

    there is no need to diagnose whether the MCMC algorithm has converged, and

  • (b)

    as the draws from the posterior distribution are independent it is straightforward to quantify uncertainty in estimates of features of the posterior distributions based on them.

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Fearnhead et al. 2007: On‐line inference for multiple changepoint problems
nce (1999) and has been proposed more generally by Fearnhead (2005, 2006). The ideas for direct simulation are based on exact methods for calculating posterior means (Barry and Hartigan, 1992). <span>The advantages of direct simulation methods over MCMC and reversible jump MCMC methods are that (a) there is no need to diagnose whether the MCMC algorithm has converged, and (b) as the draws from the posterior distribution are independent it is straightforward to quantify uncertainty in estimates of features of the posterior distributions based on them. For examples of the potential difficulties with MCMC methods caused by (a), compare the inferences that were obtained for the coal‐mining disaster data which were analysed in Green (199




consider changepoint models for the data with the following conditional independence property: given the position of a changepoint, the data before that changepoint are independent of the data after the changepoint

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Fearnhead et al. 2007: On‐line inference for multiple changepoint problems
ng our algorithm to the analysis of the C+G structure of human DNA data (Section 5). The paper concludes with a discussion. 2. Models and notation Assume that we have data y1:n=(y1,y2,…,yn). We <span>consider changepoint models for the data with the following conditional independence property: given the position of a changepoint, the data before that changepoint are independent of the data after the changepoint. These models can be described in terms of the following hierarchical structure. Firstly we model the changepoint positions via a Markov process. This Markov process is determined by a




#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
Nouveau-né Si pneumopathie ou ophtalmie : érythromycine (12,5 mg/kg/6 heures, per os ou IV, 14 jours)

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
Endométrite, salpingite • Doxycycline (100 mg/12 heures, per os ou IV, 14 jours). • Contrôle PCR systématique à faire 2 à 3 mois après le traitement

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
La syphilis est une infection sexuellement transmissible (IST) due à un spirochète, Treponema pallidum. Il s'agit d'une maladie non immunisante très contagieuse

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
Il existe une sur-représentation des patients infectés par le VIH (40 %) • On recommande la pratique d'une sérologie de syphilis dans le cadre du dépistage chez les sujets à risque homo-, bi- ou hétérosexuels à partenaires multiples et au moins une fois par an chez les patients VIH

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
• Transmission materno-fœtale possible (surtout 2 e moitié). • Les transmissions post-transfusionnelles ou après greffe d'organe sont exceptionnelles

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
Syphilis primaire L'incubation est de durée variable (10 à 90 jours), en moyenne de 3 semaines. La syphilis primaire est caractérisée par : • un chancre au point d'inoculation ; • une adénopathie satellite. Le chancre est contagieux car il fourmille de tréponèmes. Le diagnostic de syphilis primaire est souvent méconnu lorsque le chancre n'est pas visible (chancre vaginal, chancre du col utérin, chancre anorectal, chancre pharyngé)

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
Chancre syphilitique On observe typiquement : • une exulcération (ou érosion) : perte de substance superficielle mettant plus ou moins à nu la partie superficielle du chorion ; • plus rarement, une ulcération muqueuse : perte de substance profonde avec atteinte du chorion moyen et/ou profond ; • de 5 à 15 mm de diamètre en moyenne ; • unique, plus rarement multiple ; • à fond propre, rosé ; • induré (seul caractère sémiologique vraiment évocateur). Avec impossibilité de plisser entre deux doigts la surface de l'ulcération qui ne fait qu'un bloc avec l'induration sous-jacente ; • indolore (différent de l'herpès +++)

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
Le chancre siège : • chez l'homme : – assez électivement dans le sillon balano-préputial (figure 158.1) – plus rarement sur le gland ou sur le fourreau ; • chez la femme : – le plus souvent sur la partie externe de la vulve (petites lèvres, grandes lèvres, four- chette) (figure 158.2) – plus rarement vaginal (passe alors volontiers inaperçu) ; • dans les deux sexes au niveau : – de la muqueuse buccale ou pharyngée (fellation), – de la muqueuse anorectale

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Adénopathie satellite Le chancre s'accompagne d'une adénopathie satellite : • non inflammatoire • le plus souvent unilatérale.

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
Évolution L'évolution se fait vers la régression spontanée du chancre sans séquelle en quelques semaines. Si le patient n'est pas traité, il sera apparemment guéri mais son état peut évoluer vers les stades plus tardifs : • environ 30 % des patients ayant présenté un chancre syphilitique vont présenter des signes de syphilis secondaire ; • des patients non traités peuvent également évoluer vers les stades de syphilis tardive ( neurosyphilis) sans forcément présenter des signes de syphilis secondaire

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Syphilis secondaire Sa durée est en règle inférieure à un an. Elle est liée à la diffusion systémique du tréponème. Elle est marquée par plusieurs éruptions cutanéo-muqueuses entrecoupées de phases asymp- tomatiques de quelques semaines ou mois

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Roséole syphilitique La roséole syphilitique est la première éruption de la syphilis secondaire survenant dans les 6 semaines qui suivent le chancre. Elle passe souvent inaperçue car peu intense et transitoire (elle disparaît spontanément en 7 à 10 jours). Elle se caractérise par : • des macules rose pâle (figure 158.3) de 5 à 15 mm de diamètre, disséminées sur le tronc ; • une absence de signes fonctionnels à ce stade

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
Syphilides papuleuses (figure 158.4) Elles sont monomorphes, et la lésion élémentaire en est presque toujours une papule • localisées au visage, au tronc et/ou aux membres ; • en nombre variable (quelques-unes à plus d'une centaine) ; • de couleur cuivrée ; • avec inconstamment une fine desquamation péri-lésionnelle qui est évocatrice mais non spécifique ; • parfois d'aspect aspect nécrotique, croûteux ou ulcéré

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
Syphilides palmoplantaires Elles sont très évocatrices car elles siègent électivement à cheval sur les plis palmaires (figure 158.5). Inconstantes (environ 30 % des cas de syphilis secondaire) et souvent discrètes mais évoca- trices de syphilis

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
Syphilides génitales et périnéales Elles sont : • indolores et non prurigineuses ; • en général, multiples, molles, papuleuses ou érosives ; • très contagieuses (+++)

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine

Symptômes cutanéo-phanériens plus trompeurs On distingue : • la fausse perlèche (papule commissurale fendue en deux et non simple fissure sans relief du fond du pli) ; • les lésions d'allure séborrhéique des sillons nasogéniens ; • les papules acnéiformes du menton

• la dépapillation en aires de la langue (plaques « fauchées ») (figure 158.6) ;

• la dépilation des sourcils ;

• l'alopécie récente faite de plusieurs aires incomplètement dépilées sur un cuir chevelu

intact (dite en « fourrure mitée »)

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
• céphalées (ne sont pas synonymes d'une atteinte neuroméningée mais souvent secon- daires à des micro-abcès périostés)

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
• manifestations ophtalmiques (surtout uvéite antérieure mais aussi uvéite postérieure, papil- lite, névrite optique), d'où l'importance d'un bon interrogatoire à la recherche d'anomalies de la vision (baisse acuité visuelle, phosphènes, douleurs…) : – à interpréter comme une neurosyphilis « précoce », – justifiant la pratique d'une ponction lombaire et, quel que soit le résultat de cette der- nière, un traitement par pénicilline G pendant 14 jours ; • atteinte d'une paire crânienne : hypoacousie ou acouphènes, paralysie faciale… qui, comme l'atteinte ophtalmique, sont des manifestations de neurosyphilis précoce

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
Diagnostic biologique Le tréponème ne se cultivant pas in vitro, le diagnostic de syphilis ne peut se faire que : • par la mise en évidence du tréponème lui-même au microscope à fond noir qui est cepen- dant abandonné et a été sorti de la nomenclature des examens biologiques ; • ou, indirectement, par la mise en évidence de la réponse spécifique anticorps

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
L'association des deux tests est obligatoire. Il n'existe aucun test sérologique permettant de différencier les anticorps de la syphilis de ceux des tréponématoses endémiques non vénériennes. Des techniques ELISA et PCR sont développées et devraient remplacer à terme le TPHA/VDRL

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
Cinétique Le TPHA se positive entre le 7 e et 10 e jour du chancre. L'intensité de la réaction est cotée en dilution de 1/80 puis de 1/160, 1/320… Le titre du TPHA quantitatif n'est pas un bon marqueur de l'évolutivité de la maladie ni de la réponse au traitement, car il varie de façon importante d'un examen à l'autre pour un même patient. Seul le TPHA qualitatif (« 0 » à « +++ ») est donc intéressant par sa positivité ou sa négativité

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
VDRL ( Venereal Disease Research Laboratory ) Il met en évidence, dans le sérum du patient, des anticorps anti-cardiolipidiques. Le VDRL n'est pas une réaction spécifique des tréponématoses (+++). Une sérologie syphilitique faussement positive (VDRL positif, TPHA négatif) s'observe au cours de maladies dysimmunitaires, notamment au cours du lupus et du syndrome des anticorps anti-phospholipides, ainsi que dans certaines maladies infectieuses à Mycoplasma pneumo- niae ou dans les borrélioses

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
Après la phase initiale, le titre du VDRL augmente rapidement pour atteindre un plateau durant la phase secondaire, variable selon les patients, généralement situé entre 1/16 à 1/128. Le VDRL reste donc très positif durant toute la phase secondaire.

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
La surveillance biologique de l'efficacité du traitement se fait sur le VDRL quantitatif (+++). On considère que le traitement est efficace quand le titre du VDRL est divisé par 4 (deux dilutions), 6 mois après le traitement

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
Résultat des tests TPHA-VDRL au cours des différents stades de la syphilis Au cours de la syphilis primaire : le TPHA et le VDRL sont négatifs dans les sept premiers jours du chancre. Passé ce délai, le TPHA est rapidement positif et le VDRL grimpe progres- sivement pour atteindre son maximum vers le 3 e –6 e mois de la maladie. Tous les profils sont observables au cours de la syphilis primaire (TPHA-/VDRL- ; TPHA +/VDRL- ; TPHA-/VDRL + ; TPHA +/VDRL +). Au cours de la syphilis secondaire : les deux tests (TPHA et VDRL) sont toujours positifs

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine

On commence par le résultat du TPHA : • un TPHA positif (« +++ ») signifie que le patient a contracté une tréponématose (syphilis ou tréponématose endémique non vénérienne). • On s'intéresse alors au VDRL dont la positivité et le titre donnent une idée de l'évolutivité de la maladie (cf. supra). Un titre élevé (1/16, par exemple) témoigne toujours d'une maladie évolutive (sauf si celle-ci est déjà traitée avec décroissance progressive du titre) ;

• un TPHA négatif (« 0 ») signifie que le sujet n'a pas contracté de tréponématose ou qu'il en

est guéri. Le VDRL est alors lui-même négatif.

• Si le VDRL est positif, c'est qu'il s'agit d'une fausse sérologie tréponémique, comme on le voit

au cours du syndrome des anticorps anti-phospholipides primaire ou secondaire (lupus) ;

• la seule exception à cette démarche s'observe dans les sept premiers jours du chancre où

les deux tests (TPHA et VDRL) peuvent être négatifs.

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
Il faut systématiquement évoquer la syphilis devant toute ulcération muqueuse, géni- tale, anale ou buccopharyngée. Il faut éliminer : • un herpès : ulcérations superficielles douloureuses à contours polycycliques ; • un chancre mou : terrain (Africains), lésions multiples, fond sale, douleurs (+++), adénopa- thies inflammatoires ; • une donovanose : terrain (Africains), lésions peu douloureuses granulomateuses ; • une maladie de Nicolas-Favre (ou lymphogranulomatose vénérienne) : terrain (Africains, homosexuels), anorectite, ulcérations anogénitales, diarrhées trompeuses

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
La syphilis secondaire est la « grande simulatrice » et doit être évoquée devant toute éruption maculo-papuleuse, fugace ou persistante : • la roséole peut faire évoquer une virose (une primo-infection VIH doit être éliminée), une toxidermie (exanthème maculeux) ; • au visage, elle peut mimer une dermatite séborrhéique, une acné, un psoriasis ; • les lésions papuleuses peuvent simuler un psoriasis (érythémato-squameux), un lichen plan, un eczéma

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
devant une ulcération génitale, il ne faut pas attendre le résultat du TPHA-VDRL pour traiter (+++)

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
Si le diagnostic de syphilis précoce est évoqué : • faire un examen clinique soigneux (rechercher notamment des signes neurologiques, ophtalmologiques…) ; • rechercher une autre IST (gonocoque, C. trachomatis, VIH, hépatite B) ; • faire une ordonnance pour un TPHA-VDRL

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Le diagnostic de « syphilis latente précoce » n'est acceptable que si le patient peut fournir une sérologie syphilitique négative datant de moins d'un an, avant la découverte d'une sérologie positive alors qu'il est asymptomatique. Le schéma thérapeutique recommandé est le même pour les trois situations (syphilis primaire, secondaire précoce ou latente précoce)

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En cas d'allergie à la pénicilline : cure de 14 jours de doxycycline (100 mg per os matin et soir), sauf chez la femme enceinte et le patient séropositif pour le VIH (indication d'une induction de tolérance)

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En l'absence d'allergie à la pénicilline et de contre-indication aux injections intramuscu- laires : une injection intramusculaire unique de 2,4 millions d'unités de benzathine pénicilline G. La réaction d'Herxheimer qui est secondaire à la lyse des tréponèmes est sans gravité dans la syphilis primaire

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Le VDRL doit être négatif 1 an après le traitement d'une syphilis primaire et dans un délai de 2 ans après traitement d'une syphilis secondaire

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Suivi du traitement L'efficacité du traitement doit être contrôlée cliniquement et biologiquement à 3 mois, 6 mois, et un an puis tous les ans jusqu'à négativation. Le suivi biologique se fait sur le VDRL quantitatif. Le titre du VDRL doit être divisé par 4 (2 dilutions) à 3–6 mois. Si ce n'est pas le cas : • l'avis d'un spécialiste est justifié ; • le traitement repose sur 3 injections d'Extencilline ® de 2,4 millions d'unités à 8 jours d'intervalle

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la syphilis est douteuse chez le sujet source, examiner le patient contact : faire sérologie de la syphilis : – si + : traiter, – si - : refaire à 3 mois

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Sujets contacts sexuels En cas de contact sexuel avec une personne ayant la syphilis : • la syphilis est certaine chez le sujet source, examiner le patient contact : – si contact > 6 semaines, faire sérologie de la syphilis :

– si + : traiter ;

– si - : refaire à 3 mois ;

– si contact < 6 semaines : traiter systématiquement le patient contact (une injection

de benzathine pénicilline) - une sérologie de la syphilis sera bien sûr prélevée

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Classiquement, le tréponème ne passe la barrière placentaire qu'à partir du 4 e –5 e mois de la grossesse.

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En l'absence d'allergie aux pénicillines : • le traitement de la syphilis est identique, pour un même stade de la maladie, à celui préco- nisé chez la femme non enceinte ; • en cas de syphilis secondaire profuse, prévention de la réaction d'Herxheimer par pres- cription systématique de paracétamol ± associé à de la prednisone 1/2 mg/kg par jour d'équivalent prednisone la veille de l'injection, le jour de l'injection et pendant les 3 jours qui suivent l'injection ; • le suivi clinique et biologique est mensuel ; • la surveillance échographique est essentielle à la recherche de signes de fœtopathie très évocateurs (MFIU, RCIU, stries osseuses, anasarque fœtoplacentaire)

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Traitement de la syphilis du sujet séropositif pour le VIH Le traitement standard par la pénicilline est le même en cas de syphilis primaire ou secondaire du sujet séropositif pour le VIH. Une étude du LCR préalablement au traitement n'est pas justifiée sauf en cas de manifes- tations neurologiques ou ophtalmiques patentes (comme chez le patient séronégatif pour le VIH), ce qui nécessiterait un traitement par pénicilline G IV : 20 millions d'unités par jour pendant 10 à 15 jours. Les cyclines ne sont pas validées chez le patient séropositif pour le VIH. Chez les patients VIH engagés dans des pratiques à risque, on recommande la pratique d'une sérologie de syphilis au moins une fois par an.

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
Les condylomes sont en constante augmentation dans tous les pays développés, avec une prédilection pour les 16–25 ans avec une prévalence de 5 % en dessous de 25 ans. La transmission est majoritairement sexuelle. Il s'agit de l'IST la plus fréquente actuellement

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
seule une faible fraction (moins de 10 %) est dite porteurs asymptomatiques

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
La transmission non sexuelle est possible après contact avec des linges humides contaminés ou lors de l'accouchement si la mère est porteuse de condylomes, exposant l'enfant au risque de papillomatose laryngée juvénil

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
Pour les lésions anales, un examen proctologique complet (anuscopie) est recommandé. Une biopsie ne sera réalisée qu'en cas de doute diagnostique ou de suspicion de néoplasie

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
Condylomes acuminés (figure 158.7) Ce sont les classiques « crêtes-de-coq », masses charnues hérissées de petites verrucosités kératosiques de 0,2 à 1 cm, plus ou moins profuses. Leur nombre varie de quelques-unes à plusieurs dizaines

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
Condylomes plans Ce sont des macules isolées ou en nappes ou mosaïques, de couleur rosée, parfois difficiles à voir à l'œil nu. Elles peuvent être mieux visualisées par l'application d'acide acétique

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
Ce caractère multifocal impose un examen gynécologique et anal complet et un dépis- tage par frottis cervical chez toutes les femmes en période d'activité génitale. Il existe un risque de très grande fréquence de co-infection avec des HPV à haut risque onco- gène et donc un risque de dysplasie

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
Chez l'enfant Les condylomes sont le plus souvent dus à une contamination manuportée à partir de verrues vulgaires ou à partir de linges domestiques. Ils peuvent aussi résulter d'une contamination mère enfant Ils sont un mauvais marqueur de sévices sexuels même s'il faut rester vigilant

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
Chez l'homme Les condylomes siègent au pubis, à la face interne du prépuce, au niveau du sillon et du frein balano-préputial, plus rarement sur le gland et le fourreau de la verge

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
Condylomes géants de Buschke-Loewenstein (figure 158.8) Forme rare associée aux HPV6 et 11. Aspect tumoral, cliniquement inquiétante mais tumeur bénigne à l'examen histologique. Pas de potentiel métastatique

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
Papulose bowénoïde (figure 158.9) Survient chez l'adulte jeune (30 ans). Prend la forme de multiples lésions papuleuses isolées ou confluentes, de couleur rose ou brunâtre, à surface lisse ou mamelonnée, parfois squameuse ou kératosique. Est associée aux HPV16 et 18

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
Correspond à une dysplasie sévère. Risque de dégénérescence variable en fonction du terrain (généralement faible, mais nécessité d'une surveillance)

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
Les condylomes acuminés doivent être différenciés : • d'une hyperplasie physiologique des papilles de la couronne du gland (couronne perlée du gland) ou d'une papillomatose vestibulaire vulvaire physiologique ; • de syphilides secondaires (lésions de type condylomata lata) ; • de lésions dysplasiques • de kératoses séborrhéiques dans leur localisation périnéale

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
L'objectif est la disparition des lésions macroscopiquement visibles. Le risque de récidive est d'environ 30 %. Après l'éradication des lésions, le virus peut persister dans l'épiderme sain.

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
Le délai d'incubation des HPV est très variable et les récidives sont fréquentes (30 %). Il faut dédramatiser et déculpabiliser le patient. Il faut avoir un suivi évolutif des lésions (à 1 mois, puis tous les 3 mois jusqu'à guérison clinique)

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
Des rapports protégés peuvent être proposés. Ils n'empêchent pas la contamination qui se fait essentiellement par contact de peau à peau

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
IST Il faut rechercher une autre IST associée (présente dans 25 % des cas en moyenne)

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
Cryothérapie Elle consiste en l'application d'azote liquide à l'aide d'un coton-tige. Elle ne peut se concevoir que pour des lésions d'étendue limitée en raison de son caractère douloureux. Laser CO 2 Cette technique doit être réalisée sous anesthésie topique, locale ou générale. Électrocoagulation Elle s'effectue sous anesthésie locale et permet soit la destruction des lésions, soit un prélève- ment pour analyse histologique

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
Destruction chimique Podophyllotoxine à 5 % Il s'agit d'une résine naturelle appliquée par le patient lui-même de façon indolore. Les applications sont réalisées matin et soir 3 jours consécutifs par semaine jusqu'à guérison. Le produit ne doit être appliqué que sur les lésions en raison de sa causticité et convient mal aux lésions vulvaires ou intravaginales. Ce traitement est contre-indiqué chez la femme enceinte et l'enfant.

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine

« Destruction immunologique » Imiquimod Il s'agit d'une molécule immunomodulatrice entraînant la synthèse de cytokines aux propriétés pro-inflammatoires antivirales (IFNγ, TNFα, IL-1, IL-6). Cette molécule conçue pour l'application locale peut provoquer une irritation

Elle sera prescrite avec prudence chez la femme enceinte.

Les applications se font au rythme de 3 fois par semaine pendant 16 semaines

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
Le traitement des condylomes sera idéalement réalisé au début du troisième trimestre par laser CO 2 , éventuellement renouvelé en cas de récidive dans les semaines précédant l'accouchement

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
Elles sont responsables des papillomatoses laryngées de l'enfant (HPV6 et 11)

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
La grossesse favorise les condylomes

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
Chez l'homme L'infection est dans la plupart des cas asymptomatique. Trichomonas vaginalis est responsable d'urétrites le plus souvent subaiguës ou de balanoposthites. Un écoulement urétral matinal et un prurit peuvent être associés

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
Chez la femme L'infection est asymptomatique dans 20 % des cas environ. Il s'agit le plus souvent de vaginites ou de cervicovaginites. Avec prurit intense pouvant être associé à une dyspareunie ou à des signes urinaires. Leucorrhées abondantes, verdâtres, spumeuses et malodorantes. La vulve est œdématiée. L'examen au spéculum met en évidence une colpite punctiforme (« léopard »)

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#158 #Cours #Dermatologie #Facultaires #IST #Médecine
Des colorations spéciales (MGG) sont possibles ou les cultures sur milieux spéciaux

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#ANOFEL #Cours #Facultaires #Infectiologie #Maladies-infectieuses-et-tropicales #Médecine #Toxoplasmose
Le diagnostic de certitude est fondé sur la sérologie

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#ANOFEL #Cours #Facultaires #Infectiologie #Maladies-infectieuses-et-tropicales #Médecine #Toxoplasmose
Chez l'immunocompétent Un syndrome mononucléosique et un syndrome inflammatoire (augmentation de la CRP) sont habituels mais non spécifiques.

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#ANOFEL #Cours #Facultaires #Infectiologie #Maladies-infectieuses-et-tropicales #Médecine #Toxoplasmose
Classiquement, les IgM apparaissent les premières, à la fin de la première semaine suivant la contamination, et sont détectées 7 à 12 mois en moyenne avec les techniques actuelles ; la présence d'anticorps de classe IgM ne permet pas d'affirmer une toxo- plasmose évolutive

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#ANOFEL #Cours #Facultaires #Infectiologie #Maladies-infectieuses-et-tropicales #Médecine #Toxoplasmose
Les IgG apparaissent habituellement à partir du 8 e jour (leur délai d'apparition peut parfois atteindre 5 à 6 semaines) et s'élèvent progressivement pour atteindre un plateau à partir du 2 e ou 3 e mois. Les titres diminuent ensuite lentement. Les IgG persistent toute la vie à un taux résiduel

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#ANOFEL #Cours #Facultaires #Infectiologie #Maladies-infectieuses-et-tropicales #Médecine #Toxoplasmose
L'analyse de deux sérums à 3 semaines d'intervalle et la détermination de l'index d'avidité des anticorps IgG permettent le plus souvent de faire la distinction entre une infection récente ou ancienne

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#ANOFEL #Cours #Facultaires #Infectiologie #Maladies-infectieuses-et-tropicales #Médecine #Toxoplasmose
Aucune conclusion correcte ne peut être tirée de la comparaison de deux résultats de sérologie de la toxoplasmose qui n'auraient pas été effectués en parallèle dans le même laboratoire et par la même technique.

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#ANOFEL #Cours #Facultaires #Infectiologie #Maladies-infectieuses-et-tropicales #Médecine #Toxoplasmose
Chez la femme enceinte, il convient de confirmer rapidement une infection acquise en cours de grossesse par un contrôle sérologique rapproché (15 jours) — apparition ou augmentation d'IgG en présence d'IgM — et d'instaurer le traitement par spiramycine dès la confirmation

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#ANOFEL #Cours #Facultaires #Infectiologie #Maladies-infectieuses-et-tropicales #Médecine #Toxoplasmose
Chez l'immunodéprimé Chez les patients réactivant une toxoplasmose ancienne, la sérologie ne permet jamais d'affirmer que l'épisode clinique aigu est bien en rapport avec la toxoplasmose ; elle permet seulement d'envisager le diagnostic comme possible et c'est la recherche du parasite — ou l'efficacité du traitement d'épreuve, justifié devant un tableau d'abcès cérébral avec une ima- gerie évocatrice — qui confirme le diagnostic

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#ANOFEL #Cours #Facultaires #Infectiologie #Maladies-infectieuses-et-tropicales #Médecine #Toxoplasmose
La recherche du toxoplasme peut être faite par coloration, marquage avec des anticorps monoclonaux, inoculation à l'animal ou PCR à partir de n'importe quel prélèvement biologique (lavage bronchiolo-alvéolaire, liquide cérébrospinal, sang périphérique, moelle…)

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#ANOFEL #Cours #Facultaires #Infectiologie #Maladies-infectieuses-et-tropicales #Médecine #Toxoplasmose
Chez les patients greffés d'organes solides séropositifs pour le toxoplasme en prégreffe, une réactivation sérologique portant sur les IgG est possible en post-greffe, parfois accompagnée de la réapparition des autres isotypes (IgM, IgA), mais le plus souvent sans conséquence cli- nique

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#ANOFEL #Cours #Facultaires #Infectiologie #Maladies-infectieuses-et-tropicales #Médecine #Toxoplasmose
L'échographie ne permettant que la visualisation d'anomalies déjà constituées, c'est l'amniocentèse avec la détection dans le liquide amniotique du parasite par PCR qui permet de confirmer l'atteinte fœtale ; ces examens doivent être réalisés dans un laboratoire agréé.

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#ANOFEL #Cours #Facultaires #Infectiologie #Maladies-infectieuses-et-tropicales #Médecine #Toxoplasmose
On recommande un délai de 1 mois minimum entre la contamination maternelle et la date de la ponction (délai placentaire nécessaire au passage du parasite de la mère vers l'enfant), qui n'est faite au plus tôt qu'à partir de la 18 e semaine d'aménor- rhée

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#ANOFEL #Cours #Facultaires #Infectiologie #Maladies-infectieuses-et-tropicales #Médecine #Toxoplasmose
En revanche, un résultat négatif n'exclut pas l'atteinte fœtale, les données bibliographiques faisant état d'environ 10 % de faux négatifs, essen- tiellement en cas de séroconversion survenue au premier ou au troisième trimestre de la grossesse

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#ANOFEL #Cours #Facultaires #Infectiologie #Maladies-infectieuses-et-tropicales #Médecine #Toxoplasmose
Ces moyens associent la recherche du parasite et la sérologie. Ils sont associés à un bilan clinique comportant la réalisation d'un fond d'œil et d'une échographie transfontanellaire

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#ANOFEL #Cours #Facultaires #Infectiologie #Maladies-infectieuses-et-tropicales #Médecine #Toxoplasmose
Sur le sang prélevé à quelques jours de vie, la présence d'IgM ou d'IgA spécifiques per- met d'affirmer la toxoplasmose congénitale, car ces isotypes d'immunoglobulines ne franchissent pas la barrière placentaire et les IgM maternelles contaminant éventuellement le sang du cordon disparaissent très rapidement chez l'enfant non infecté

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#ANOFEL #Cours #Facultaires #Infectiologie #Maladies-infectieuses-et-tropicales #Médecine #Toxoplasmose
Le profil immunologique comparé mère/enfant par immunoempreinte (western blot) permet de mettre en évidence les anticorps IgG ou IgM propres à l'enfant

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#ANOFEL #Cours #Facultaires #Infectiologie #Maladies-infectieuses-et-tropicales #Médecine #Toxoplasmose
Si le diagnostic n'est pas porté à la naissance, le suivi sérologique est le suivant : contrôles séro- logiques à M1, M2, M3. Cette procédure permet de diagnostiquer 94 % des toxoplasmoses congénitales au cours des trois premiers mois. Les sérologies prélevées ensuite à M4, M6, M9 et M12 confirment les cas restants sur la persistance des IgG

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#ANOFEL #Cours #Facultaires #Infectiologie #Maladies-infectieuses-et-tropicales #Médecine #Toxoplasmose
La suspicion de diagnostic de toxoplasmose oculaire est principalement ophtalmolo- gique

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#ANOFEL #Cours #Facultaires #Infectiologie #Maladies-infectieuses-et-tropicales #Médecine #Toxoplasmose
En cas de doute, des arguments en faveur du diagnostic peuvent être apportés par l'étude de l'humeur aqueuse après ponction de la chambre antérieure. Les techniques utilisées sont la PCR et la sérologie, avec la recherche d'une synthèse locale d'anticorps objectivée par le calcul du coefficient de charge immunitaire, ou coefficient de Desmonts ou de Goldmann-Witmer, et le profil immunologique comparé sérum/humeur aqueuse par western blot. La positivité de ces examens est un bon argument pour le diagnostic de toxo- plasmose oculaire ; leur négativité ne permet pas de le récuser formellement

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#ANOFEL #Cours #Facultaires #Infectiologie #Maladies-infectieuses-et-tropicales #Médecine #Toxoplasmose

Toxoplasmose

En cas de séroconversion en cours de grossesse, le suivi échographique doit être mensuel, à la recherche de signes d'atteinte fœtale :

  • Dilatation ventriculaire
  • Calcifications cérébrales
  • Épaississement du placenta
  • Hépatomégalie
  • Ascite ou péricardite

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#ANOFEL #Cours #Facultaires #Infectiologie #Maladies-infectieuses-et-tropicales #Médecine #Toxoplasmose
Chez le nouveau-né, l'échographie transfontanellaire (cf. fig. 6.8) peut détecter des calcifications intracérébrales ou une dilatation ventriculaire

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#ANOFEL #Cours #Facultaires #Infectiologie #Maladies-infectieuses-et-tropicales #Médecine #Toxoplasmose
En cas d'abcès cérébral, la biopsie stéréotaxique n'est souvent pratiquée qu'en cas d'échec du traitement d'épreuve. Quelle que soit la nature des biopsies, un fragment doit toujours être adressé au laboratoire de parasitologie

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La toxoplasmose acquise guérit le plus souvent sans traitement chez l'immunocompé- tent. En cas d'asthénie importante, le traitement classique repose sur la spiramycine (Rova- mycine ® 1,5 MUI/10 kg par jour en pédiatrie, 6 à 9 MUI par jour chez l'adulte) administrée pendant 1 mois. L'association triméthoprime-sulfaméthoxazole (cotrimoxazole, Bactrim ® ) est probablement plus efficace, mais il y a peu de données bibliographiques dans cette indication

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#ANOFEL #Cours #Facultaires #Infectiologie #Maladies-infectieuses-et-tropicales #Médecine #Toxoplasmose
Toxoplasmose de l'immunodéprimé Le traitement de première intention est l'association pyriméthamine (Malocide ® , 50 à 75 mg par jour, après une dose de charge initiale de 100 mg le premier jour) et sulfadiazine (Adiazine ® , 100 à 150 mg/kg soit 4 à 6 g par jour). La prescription d'acide folinique (Leder- foline ® , Osfolate ® , Folinoral ® ) 25 mg par jour doit être systématique pour prévenir les effets secondaires hématologiques, ainsi qu'une hydratation suffisante avec alcalinisation

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#ANOFEL #Cours #Facultaires #Infectiologie #Maladies-infectieuses-et-tropicales #Médecine #Toxoplasmose
• toxicité hématologique, principalement due à la pyriméthamine, toxicité qu'il faut parfois tolérer si elle ne cède pas à l'augmentation de posologie de l'acide folinique

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En cas de localisation cérébrale, la nécessité d'un traitement anti-œdémateux est à appré- cier au cas par cas. Il faut autant que possible éviter la prescription de corticoïdes : ceux-ci, efficaces aussi bien sur l'œdème associé à la toxoplasmose cérébrale que sur les lymphomes cérébraux, pourraient être source d'erreur diagnostique

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L'alternative à ce traitement de référence est l'association pyriméthamine (50 mg par jour) et clindamycine (2,4 g par jour) (Dalacine ® ), dont les effets indésirables sont les mêmes, toutefois moins sévères pour ce qui est de l'exanthème, avec en plus un risque de colite pseudo-membraneuse

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Le traitement d'attaque est maintenu pendant 3 à 6 semaines. Un traitement d'entretien utilisant les mêmes molécules à demi-dose doit être poursuivi ensuite tant que dure l'immuno- dépression. Chez les patients infectés par le VIH, le contrôle de l'infection (charge virale non détectable) avec une remontée des lymphocytes CD4 au-dessus de 15 % et 200/mm 3 deux fois de suite à 3 mois d'intervalle autorise l'interruption de la prophylaxie secondaire

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Toxoplasmose congénitale En cas de séroconversion en cours de grossesse, il faut prescrire à la femme un traitement par spi- ramycine (Rovamycine®) à 9 MUI par jour en trois prises, instaurer une surveillance échographique et programmer l'amniocentèse

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Le traitement vise à réduire le risque global de transmission verticale ; il réduirait également le risque de toxoplasmose congénitale grave. Si le diagnostic anténatal est positif, la femme est traitée par une association pyriméthamine-sulfadiazine aux mêmes posologies que l'immunodéprimé, en continu, jusqu'à l'accouchement.

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Pour réduire le nombre de prises médi- camenteuses, on peut prescrire l'association pyriméthamine-sulfadoxine à la posologie de 1 comprimé pour 20 kg tous les 10 jours. Dans tous les cas, il ne faut pas omettre d'associer l'acide folinique (à la posologie de 50 mg par semaine).

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#ANOFEL #Cours #Facultaires #Infectiologie #Maladies-infectieuses-et-tropicales #Médecine #Toxoplasmose
L'interruption médicale de la grossesse n'est justifiée qu'en cas d'anomalie échographique. Si le diagnostic anténatal est négatif, le traitement par spiramycine est poursuivi jusqu'à l'accouchement. Chez l'enfant, que le diagnostic ait été posé en période anténatale ou dans la période néonatale, le traite- ment en continu par pyriméthamine-sulfamides est prescrit pendant au moins 1 an. La complé- mentation par acide folinique est systématique (à la posologie de 50 mg par semaine). Une surveillance régulière de la toxicité hématologique par numération-formule sanguine est obligatoire. En l'absence de preuve d'infection, l'enfant ne doit pas recevoir de traitement

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#ANOFEL #Cours #Facultaires #Infectiologie #Maladies-infectieuses-et-tropicales #Médecine #Toxoplasmose
Toxoplasmose oculaire Le traitement de la toxoplasmose oculaire est le même (molécules et posologie) que celui de la toxoplasmose des immunodéprimés. La nécessité d'un traitement corticoïde local associé est à apprécier individuellement. Il ne doit jamais être donné seul

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#ANOFEL #Cours #Facultaires #Infectiologie #Maladies-infectieuses-et-tropicales #Médecine #Toxoplasmose
Prévention de la toxoplasmose congénitale Pour la toxoplasmose congénitale, le programme repose sur le dépistage sérologique obli- gatoire des femmes associé à des conseils hygiénodiététiques en cas de sérologie négative : • depuis 1985, lors de la déclaration de la grossesse, au cours du premier trimestre ; • depuis 1992, si ce dépistage est négatif, le suivi sérologique mensuel est obligatoire jusqu'à l'accouchement. Les sérums doivent être conservés congelés 12 mois. Afin de ne pas méconnaître une contamination de l'extrême fin de la grossesse, le dernier contrôle sérologique doit être fait 2 à 3 semaines après l'accouchement (problème du délai d'apparition des anticorps) ; ce dernier point, sur lequel les parasitologues et les obstétri- ciens sont d'accord, ne figure pas dans la législation

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#ANOFEL #Cours #Facultaires #Infectiologie #Maladies-infectieuses-et-tropicales #Médecine #Toxoplasmose
Pour les personnes infectées par le VIH, le dépistage systématique de la toxoplasmose est recommandé lors du bilan initial. Si ce dépistage est négatif, le patient doit être informé des mêmes mesures prophylactiques que la femme enceinte et une surveillance sérologique semestrielle doit être instaurée. Si ce dépistage est positif, une prophylaxie primaire doit être prescrite lorsque le taux de lymphocytes CD4 est inférieur à 100/mm 3

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• Bien cuire la viande (bœuf, mouton, porc, cheval, gibier…), c'est-à-dire une cuisson d'au moins 65 °C dans toute l'épaisseur de la viande, ce qui correspond en pratique à une viande ne laissant pas s'écouler de jus rosé à la coupe

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a congélation de la viande à une température de –12 °C au minimum pendant 3 jours ou la surgélation à –18 °C tuent les kystes (la viande achetée surgelée est sans risque).

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Éviter les contacts directs avec les objets qui pour- raient être contaminés par les excréments de chat (comme les bacs de litières, la terre) et porter chaque fois des gants en cas de manipulation de ces objets. Désinfecter les bacs des litières de chat avec de l'eau bouillante. Bien se laver les mains après contact avec les chats

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#ANOFEL #Cours #Facultaires #Infectiologie #Maladies-infectieuses-et-tropicales #Médecine #Toxoplasmose
• Consommer de préférence de l'eau en bouteille. • Éviter les coquillages crus

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Once M. tuberculosis comes into contact with dendritic or alveolar macrophages, the interaction of these cells with M. tuberculosis first involves recognition by these cells of microbe-associated molecular patterns (MAMPs) by pattern recognition receptors (PRRs) located on the cell surface or in the cytosol [7].

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culosis with lung epithelial cells may affect later dendritic cell and alveolar macrophage migration and ultimately clinical outcome. Little is known about what happens during this early phase. <span>Once M. tuberculosis comes into contact with dendritic or alveolar macrophages, the interaction of these cells with M. tuberculosis first involves recognition by these cells of microbe-associated molecular patterns (MAMPs) by pattern recognition receptors (PRRs) located on the cell surface or in the cytosol [7]. Distinct sets of macrophage PRRs recognize distinct sets of MAMPs of M. tuberculosis. These PRRs serve to trigger innate immune response against molecules recognized to be foreign to th




These PRRs serve to trigger innate immune response against molecules recognized to be foreign to the host cell. The recognition of M. tuberculosis by a group of PRRs called toll-like receptors (TLRs) triggers cell signal transduction that induces a proinflammatory response that is supposed to control the infection [8]. However, M. tuberculosis has evolved to subvert these host responses for its own survival in the host.

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patterns (MAMPs) by pattern recognition receptors (PRRs) located on the cell surface or in the cytosol [7]. Distinct sets of macrophage PRRs recognize distinct sets of MAMPs of M. tuberculosis. <span>These PRRs serve to trigger innate immune response against molecules recognized to be foreign to the host cell. The recognition of M. tuberculosis by a group of PRRs called toll-like receptors (TLRs) triggers cell signal transduction that induces a proinflammatory response that is supposed to control the infection [8]. However, M. tuberculosis has evolved to subvert these host responses for its own survival in the host. Toll-like receptors — TLR is a mammalian homologue of the toll receptor in the insect Drosophila that plays a role in conferring immunity of the insect against yeast infections [9]. TLR




Further characterization of the mechanism of killing of M. tuberculosis in human macrophages has identified that TLR1/2 activation up-regulates expression of the vitamin D receptor as well as vitamin D-1-hydroxylase [15]. The expression of vitamin D receptor-related genes leads to an increased expression of cathelicidin, an antimicrobial peptide, which is then responsible for inhibition of growth of M. tuberculosis

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an macrophage, it was independent of this pathway [14]. That is, the human TLR2 activation by the 19-kD lipoprotein killed M. tuberculosis, but no nitric oxide production could be demonstrated. <span>Further characterization of the mechanism of killing of M. tuberculosis in human macrophages has identified that TLR1/2 activation up-regulates expression of the vitamin D receptor as well as vitamin D-1-hydroxylase [15]. The expression of vitamin D receptor-related genes leads to an increased expression of cathelicidin, an antimicrobial peptide, which is then responsible for inhibition of growth of M. tuberculosis. TLR2 and TLR4 require MyD88, an intracellular adapter protein required for inducing early innate immune response to pathogens [16]. However, in murine macrophages, M. tuberculosis can




The adaptive immune response was not sufficient to compensate for the innate immune defect in unvaccinated mice, suggesting that the innate immune response plays a substantive role in protection against TB, at least in the mouse model [18].

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cterium bovis Bacillus Calmette-Guérin (BCG), they were protected from M. tuberculosis infection, indicating that the adaptive immune response functioned normally in this MyD88-deficient mouse. <span>The adaptive immune response was not sufficient to compensate for the innate immune defect in unvaccinated mice, suggesting that the innate immune response plays a substantive role in protection against TB, at least in the mouse model [18]. Genetic polymorphism found in TLR2/4 has been shown to affect infection outcomes in some populations. TLR4 polymorphism among Asian Indian population has been reported to be associated




That is, the human TLR2 activation by the 19-kD lipoprotein killed M. tuberculosis, but no nitric oxide production could be demonstrated

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n macrophages [14]. However, the killing in the mouse macrophage was dependent on the intracellular nitric oxide pathway, while in the human macrophage, it was independent of this pathway [14]. <span>That is, the human TLR2 activation by the 19-kD lipoprotein killed M. tuberculosis, but no nitric oxide production could be demonstrated. Further characterization of the mechanism of killing of M. tuberculosis in human macrophages has identified that TLR1/2 activation up-regulates expression of the vitamin D receptor as




Genetic polymorphism found in TLR2/4 has been shown to affect infection outcomes in some populations

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to compensate for the innate immune defect in unvaccinated mice, suggesting that the innate immune response plays a substantive role in protection against TB, at least in the mouse model [18]. <span>Genetic polymorphism found in TLR2/4 has been shown to affect infection outcomes in some populations. TLR4 polymorphism among Asian Indian population has been reported to be associated with increased severity of TB, while, in other populations, no such association has been found [19,20




Human studies have shown that some M. tuberculosis strains preferentially activate TLR2, whereas others activate TLR4 [21].

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th increased severity of TB, while, in other populations, no such association has been found [19,20]. Such differential host response may also be affected by M. tuberculosis strain differences. <span>Human studies have shown that some M. tuberculosis strains preferentially activate TLR2, whereas others activate TLR4 [21]. Evasion mechanisms — After the tubercle bacterium gets taken up by macrophages, it uses several strategies to evade early intracellular killing mechanisms inside these target cells. Som




Evasion mechanisms — After the tubercle bacterium gets taken up by macrophages, it uses several strategies to evade early intracellular killing mechanisms inside these target cells. Some of the mechanisms previously thought to contribute to these strategies include:

● Resistance to reactive oxygen intermediates (ROIs)

● Inhibition of phagosome-lysosome fusion

● Inhibition of phagosome acidification

● Escape from the phagosomal compartment into the cytoplasmic space

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response may also be affected by M. tuberculosis strain differences. Human studies have shown that some M. tuberculosis strains preferentially activate TLR2, whereas others activate TLR4 [21]. <span>Evasion mechanisms — After the tubercle bacterium gets taken up by macrophages, it uses several strategies to evade early intracellular killing mechanisms inside these target cells. Some of the mechanisms previously thought to contribute to these strategies include: ●Resistance to reactive oxygen intermediates (ROIs) ●Inhibition of phagosome-lysosome fusion ●Inhibition of phagosome acidification ●Escape from the phagosomal compartment into the cytoplasmic space During the initial stages of infection, tubercle bacilli stimulate the migration of neutrophils and mononuclear phagocytes to the site of infection. M. tuberculosis possesses a variety




Thus, drugs targeted against mycolic acid biosynthesis can exert an antibacterial effect early in the phase of M. tuberculosis infection or during transition from latent infection to active disease, when mycolic acid synthesis is most active

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ibit the expression of interleukin (IL)-12, monocyte chemotactic protein 1 (MCP-1), and tumor necrosis factor (TNF)-alpha in a toll-like receptor 2 (TLR-2)-dependent manner in macrophages [26]. <span>Thus, drugs targeted against mycolic acid biosynthesis can exert an antibacterial effect early in the phase of M. tuberculosis infection or during transition from latent infection to active disease, when mycolic acid synthesis is most active. In Escherichia coli and Salmonella, the oxyR gene serves as a regulatory element in response to oxidative stress. In contrast, the oxyR homologue in M. tuberculosis contains numerous d




During the initial stages of infection, tubercle bacilli stimulate the migration of neutrophils and mononuclear phagocytes to the site of infection. M. tuberculosis possesses a variety of products that enable it to constitutively resist ROIs produced by these cells, which are usually toxic to other pathogens.

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stance to reactive oxygen intermediates (ROIs) ●Inhibition of phagosome-lysosome fusion ●Inhibition of phagosome acidification ●Escape from the phagosomal compartment into the cytoplasmic space <span>During the initial stages of infection, tubercle bacilli stimulate the migration of neutrophils and mononuclear phagocytes to the site of infection. M. tuberculosis possesses a variety of products that enable it to constitutively resist ROIs produced by these cells, which are usually toxic to other pathogens. Lipoarabinomannan serves as a scavenger for oxygen intermediates [22]. Entry of the organism into macrophages via complement receptors (CR1 and CR3) does not stimulate ROI production [2




M. tuberculosis products suggested to inhibit macrophage presentation of MHC class II molecules include lipoarabinomannan, 25 kDa glycoprotein, and a 19 kDa lipoprotein [22,39,40].

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]. Such interference could lead to resistance of M. tuberculosis to acquired immunity in the host and, hence, may contribute to bacterial persistence, a characteristic feature of this organism. <span>M. tuberculosis products suggested to inhibit macrophage presentation of MHC class II molecules include lipoarabinomannan, 25 kDa glycoprotein, and a 19 kDa lipoprotein [22,39,40]. The traditional view is that when M. tuberculosis is engulfed by macrophages or dendritic cells, it resides inside the phagosomal compartment and that it does not escape into the cytoso




M. tuberculosis is also known to interfere with antigen presentation by major histocompatibility complex (MHC) class II molecules, which is important for priming CD4 T cells [38]

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r fate of the pathogen. Macrophages activated by cytokines can acidify phagosomes, but the acidification itself may not contribute to significant killing of mycobacteria inside such cells [37]. <span>M. tuberculosis is also known to interfere with antigen presentation by major histocompatibility complex (MHC) class II molecules, which is important for priming CD4 T cells [38]. Such interference could lead to resistance of M. tuberculosis to acquired immunity in the host and, hence, may contribute to bacterial persistence, a characteristic feature of this org




Additional evidence for the importance of RNI in controlling M. tuberculosis infection in mice is illustrated by the following observations:

● Mortality in mice infected with M. tuberculosis is increased when inducible nitric oxide synthase (NOS2 or iNOS), which leads to RNI expression, is blocked by nitric oxide synthase inhibitors [48].

● IFN-gamma is a potent stimulus of NOS2 expression in mice. Mice with disrupted IFN-gamma or NOS2 genes become highly susceptible to M. tuberculosis infections [49,50].

Human macrophages do not express NOS2 when exposed to IFN-gamma, and NOS2 expression in peripheral blood-derived macrophages is difficult to demonstrate. However, several studies have provided evidence for NOS2 expression by alveolar macrophages obtained from bronchial alveolar lavage (BAL) fluid of patients with TB [51-53]

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erculosis. A murine macrophage cell line expressing RNI but defective in ROI expression was able to kill a virulent strain of M. tuberculosis after stimulation with interferon (IFN)-gamma [47]. <span>Additional evidence for the importance of RNI in controlling M. tuberculosis infection in mice is illustrated by the following observations: ●Mortality in mice infected with M. tuberculosis is increased when inducible nitric oxide synthase (NOS2 or iNOS), which leads to RNI expression, is blocked by nitric oxide synthase inhibitors [48]. ●IFN-gamma is a potent stimulus of NOS2 expression in mice. Mice with disrupted IFN-gamma or NOS2 genes become highly susceptible to M. tuberculosis infections [49,50]. Human macrophages do not express NOS2 when exposed to IFN-gamma, and NOS2 expression in peripheral blood-derived macrophages is difficult to demonstrate. However, several studies have provided evidence for NOS2 expression by alveolar macrophages obtained from bronchial alveolar lavage (BAL) fluid of patients with TB [51-53]. Thus, human NOS2 may require factors other than those that stimulate NOS2 expression in murine macrophages. RNIs may play an important role in the initial (innate immunity) as well as




Interferon-gamma — In human macrophages, the effect of IFN-gamma in killing M. tuberculosis has not been demonstrated definitively. In one study, for example, cells preincubated with IFN-gamma enhanced the intracellular proliferation of M. tuberculosis; in comparison, killing of another intracellular organism, Leishmania, was increased [60].

However, the coadministration of IFN-gamma with calcitriol (the most active metabolite of vitamin D), which causes monocytes to mature in vitro, leads to intracellular killing of M. tuberculosis [61]. Calcitriol independently stimulates NOS2 production and suppresses growth of M. tuberculosis inside the human macrophage-like cell line, HL-60 [62]

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by methionine sulfoxide reductase encoded by msrA [58]. Another gene noxR3 of M. tuberculosis has been reported to protect Salmonella typhimurium against oxidative and nitrosative stress [59]. <span>Interferon-gamma — In human macrophages, the effect of IFN-gamma in killing M. tuberculosis has not been demonstrated definitively. In one study, for example, cells preincubated with IFN-gamma enhanced the intracellular proliferation of M. tuberculosis; in comparison, killing of another intracellular organism, Leishmania, was increased [60]. However, the coadministration of IFN-gamma with calcitriol (the most active metabolite of vitamin D), which causes monocytes to mature in vitro, leads to intracellular killing of M. tuberculosis [61]. Calcitriol independently stimulates NOS2 production and suppresses growth of M. tuberculosis inside the human macrophage-like cell line, HL-60 [62]. Transcription factor hypoxia-inducible factor-1alpha (HIF-1alpha) has been demonstrated to be an essential mediator of IFN-gamma-dependent control of M. tuberculosis in murine macropha




One important cytokine is TNF-alpha. Its role in controlling latent infection with M. tuberculosis in humans has been dramatically demonstrated by multiple reports of reactivation TB occurring in individuals treated for rheumatoid arthritis or Crohn disease with anti-TNF-alpha (infliximab) or TNF-alpha receptor (etanercept) antibodies [65-67].

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or in addition to being an antibacterial factor [64]. Other cytokines — In addition to the role that IFN-gamma plays in M. tuberculosis control described above, other cytokines also contribute. <span>One important cytokine is TNF-alpha. Its role in controlling latent infection with M. tuberculosis in humans has been dramatically demonstrated by multiple reports of reactivation TB occurring in individuals treated for rheumatoid arthritis or Crohn disease with anti-TNF-alpha (infliximab) or TNF-alpha receptor (etanercept) antibodies [65-67]. TNF-alpha is also important for proper granuloma formation (see below). Persistently infected mice treated with neutralizing anti-TNF-alpha antibody develop granuloma disorganization, w




Macrophages as well as other phagocytic cells such as dendritic cells carry phagocytized M. tuberculosis to draining lymph nodes where they present M. tuberculosis antigens to T cells. The presentation of antigens to T cells induces cellular immune response. This occurs two to six weeks after infection with M. tuberculosis

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llular immunity may contribute to the protective response against TB, but the specific correlates of such protective response have not yet been well established in human cell-mediated immunity. <span>Macrophages as well as other phagocytic cells such as dendritic cells carry phagocytized M. tuberculosis to draining lymph nodes where they present M. tuberculosis antigens to T cells. The presentation of antigens to T cells induces cellular immune response. This occurs two to six weeks after infection with M. tuberculosis. This response can be demonstrated clinically by the development of a delayed-type hypersensitivity (DTH) response to intradermally injected tuberculin or purified protein derivative (P




The DTH response per se does not correlate with protection against TB, since numerous BCG vaccination trials have demonstrated that disease can occur in those who mount a DTH response [77]. As a result, the protective T cell response must be distinguished from the T cell response associated with DTH

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vitro following stimulation with PPD [76]. By contrast, T cells from PPD-positive patients produced both IL-10 and IFN-gamma and displayed a dramatic proliferative response to PPD stimulation. <span>The DTH response per se does not correlate with protection against TB, since numerous BCG vaccination trials have demonstrated that disease can occur in those who mount a DTH response [77]. As a result, the protective T cell response must be distinguished from the T cell response associated with DTH. IFN-gamma release assays have been developed; these are in vitro, whole blood-based tests to measure T cell activation. The assays are an alternative to the tuberculin skin test for de




IFN-gamma release assays have been developed; these are in vitro, whole blood-based tests to measure T cell activation. The assays are an alternative to the tuberculin skin test for detection of latent M. tuberculosis infection in human hosts [78-82]. The test measures IFN-gamma released into blood from T cells when they are activated by M. tuberculosis antigens in vitro. The tests use antigens specific to M. tuberculosis including ESAT-6 and CFP-10 [78,79]. These proteins are encoded by genes located within the region of difference 1 (RD1) of the M. tuberculosis genome and are absent in vaccine strain BCG or M. bovis. This enables the test to differentiate those latently infected with M. tuberculosis from those vaccinated with BCG.

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have demonstrated that disease can occur in those who mount a DTH response [77]. As a result, the protective T cell response must be distinguished from the T cell response associated with DTH. <span>IFN-gamma release assays have been developed; these are in vitro, whole blood-based tests to measure T cell activation. The assays are an alternative to the tuberculin skin test for detection of latent M. tuberculosis infection in human hosts [78-82]. The test measures IFN-gamma released into blood from T cells when they are activated by M. tuberculosis antigens in vitro. The tests use antigens specific to M. tuberculosis including ESAT-6 and CFP-10 [78,79]. These proteins are encoded by genes located within the region of difference 1 (RD1) of the M. tuberculosis genome and are absent in vaccine strain BCG or M. bovis. This enables the test to differentiate those latently infected with M. tuberculosis from those vaccinated with BCG. (See "Use of interferon-gamma release assays for diagnosis of latent tuberculosis infection (tuberculosis screening) in adults".) The importance of T cells in the protective immune resp




If it is assumed that the DTH response is mediated by CD4+ Th1 cells, the wide range of protection (0 to 80 percent) demonstrated by numerous BCG trials suggest that CD4+ T cells are not sufficient for protection and that other cells must be involved [77]

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cells from BCG-immunized mice protected irradiated recipient mice from infection [83,84]. Other animal studies showed that this protective response was mediated by CD4-bearing T cells [85,86]. <span>If it is assumed that the DTH response is mediated by CD4+ Th1 cells, the wide range of protection (0 to 80 percent) demonstrated by numerous BCG trials suggest that CD4+ T cells are not sufficient for protection and that other cells must be involved [77]. However, the greatly increased risk of TB with HIV infection, in which CD4+ T cells become depleted, suggests that these cells are important for protection against TB in humans. CD4+ T




In one study, in CD4-disrupted mice, levels of IFN-gamma in the lungs, while diminished early in infection, reached levels found in wild-type mice after about three weeks, suggesting that other cell types (CD8+ cells) can compensate for the decreased cytokine expression by CD4 T cells [ 87].

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gainst TB in humans. CD4+ T cells exert their effector function by producing IFN-gamma, which activates macrophages. This response is important, particularly during early phase of an infection. <span>In one study, in CD4-disrupted mice, levels of IFN-gamma in the lungs, while diminished early in infection, reached levels found in wild-type mice after about three weeks, suggesting that other cell types (CD8+ cells) can compensate for the decreased cytokine expression by CD4 T cells [87]. Finally, in addition to the role of cytokines produced by CD4+ cells, apoptosis of infected cells by CD4+ T cells may contribute to controlling infection. However, published reports on




CD4+ T cells exert their effector function by producing IFN-gamma, which activates macrophages.

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involved [77]. However, the greatly increased risk of TB with HIV infection, in which CD4+ T cells become depleted, suggests that these cells are important for protection against TB in humans. <span>CD4+ T cells exert their effector function by producing IFN-gamma, which activates macrophages. This response is important, particularly during early phase of an infection. In one study, in CD4-disrupted mice, levels of IFN-gamma in the lungs, while diminished early in infection,




Cytotoxic T lymphocytes (CTLs) have been implicated in protection against M. tuberculosis, and active investigation into the details of this mechanism is ongoing.

● Mice with disruption of the beta-2 microglobulin gene fail to control infection with a virulent strain of M. tuberculosis (Erdman) despite having intact CD4+ and cytolytic gamma-delta T cells [90]. A beta2-microglobulin-deficient mouse is unable to present antigens through MHC class I and class I-like molecules

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sis of infected cells by CD4+ T cells may contribute to controlling infection. However, published reports on the role of apoptosis in M. tuberculosis infection control remain equivocal [88,89]. <span>Cytotoxic T lymphocytes (CTLs) have been implicated in protection against M. tuberculosis, and active investigation into the details of this mechanism is ongoing. ●Mice with disruption of the beta-2 microglobulin gene fail to control infection with a virulent strain of M. tuberculosis (Erdman) despite having intact CD4+ and cytolytic gamma-delta T cells [90]. A beta2-microglobulin-deficient mouse is unable to present antigens through MHC class I and class I-like molecules. ●Another study using different strains of gene-disrupted mice found that perforin contributed only partially to the protective ability of CTLs, but beta-2-microglobulin-dependent T cel




These observations suggested that alteration in the cell wall lipid composition or its remodeling can greatly affect host immune response and that a certain level of proinflammatory response induced by M. tuberculosis itself is necessary for proper granuloma formation that is protective both to the host and the bacterium

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ct host immune response. M. tuberculosis mutant defective in trans-cyclopropanation of mycolic acids induced larger sized granulomas in mouse lungs than did the wild-type M. tuberculosis [110]. <span>These observations suggested that alteration in the cell wall lipid composition or its remodeling can greatly affect host immune response and that a certain level of proinflammatory response induced by M. tuberculosis itself is necessary for proper granuloma formation that is protective both to the host and the bacterium. Thus, the granuloma is not only a host protective factor but may serve as a shelter constructed by the tubercle bacterium itself for its long-term survival in the host and that bacteri




Mycobacterial lipids — M. tuberculosis lipid products have been associated with TB pathogenesis since 1947, when Middlebrook suggested that a growth morphology called "cording" was associated with virulent tubercle bacilli [114].

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ndeed play a role in protection. With better understanding of antibody functional repertoires, the role of humoral immunity in protection against TB is undergoing reevaluation. Pathogen factors <span>Mycobacterial lipids — M. tuberculosis lipid products have been associated with TB pathogenesis since 1947, when Middlebrook suggested that a growth morphology called "cording" was associated with virulent tubercle bacilli [114]. Subsequently, the toxic effect of petroleum ether extractable "cord factor" from M. tuberculosis was characterized in a murine model [115]. This cord factor was eventually identified as




PERFORMING THE TST

General principles — The TST consists of intradermal injection of tuberculin material, which stimulates a delayed-type hypersensitivity response mediated by T lymphocytes and, in patients with prior mycobacterial exposure, causes induration at the injection site within 48 to 72 hours

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es related to interpretation of IGRAs are discussed separately. (See "Use of interferon-gamma release assays for diagnosis of latent tuberculosis infection (tuberculosis screening) in adults".) <span>PERFORMING THE TST General principles — The TST consists of intradermal injection of tuberculin material, which stimulates a delayed-type hypersensitivity response mediated by T lymphocytes and, in patients with prior mycobacterial exposure, causes induration at the injection site within 48 to 72 hours. In the United States, two FDA-approved PPD tuberculin antigens are available in the United States for use in performing TSTs: Tubersol and Aplisol. In North America, the tuberculin mat




Tuberculin skin testing is performed via the Mantoux technique, which consists of intradermal injection of tuberculin material on the inner surface of the forearm [1,3]. Epinephrine should be available during TST placement.

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dard dose is 5 tuberculin units (0.1 mL). In other regions, RT-23 may be the tuberculin material used; the standard dose is 2 tuberculin units. These doses have been shown to be equivalent [2]. <span>Tuberculin skin testing is performed via the Mantoux technique, which consists of intradermal injection of tuberculin material on the inner surface of the forearm [1,3]. Epinephrine should be available during TST placement. (See 'Adverse reactions' below.) To read the test, the transverse diameter of the induration (not erythema) should be demarcated, measured, and recorded in millimeters. The test should




To read the test, the transverse diameter of the induration (not erythema) should be demarcated, measured, and recorded in millimeters. The test should be read 48 to 72 hours following intradermal injection. The results are less reliable if the test is read after 72 hours

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which consists of intradermal injection of tuberculin material on the inner surface of the forearm [1,3]. Epinephrine should be available during TST placement. (See 'Adverse reactions' below.) <span>To read the test, the transverse diameter of the induration (not erythema) should be demarcated, measured, and recorded in millimeters. The test should be read 48 to 72 hours following intradermal injection. The results are less reliable if the test is read after 72 hours. A strongly positive reaction after 96 hours may be accepted; however, results become increasingly doubtful with longer intervals between injection and reading. In one study including 4




If the TST cannot be read within 48 to 72 hours, repeat testing should be performed. If a new TST is performed ≥7 days after the unread test, then boosting may cause a positive TST result on the second test (see 'Serial testing' below). However, in the absence of a documented negative first TST, there is no way to know if the second TST represents boosting or new infection. Hence, the second TST must be interpreted in the same way as a single initial TST. This potential problem reinforces the importance of reading the TST at the correct time.

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en injection and reading. In one study including 400 individuals with positive TST at 48 to 72 hours, about 20 percent had negative results when the TST was read seven days after placement [4]. <span>If the TST cannot be read within 48 to 72 hours, repeat testing should be performed. If a new TST is performed ≥7 days after the unread test, then boosting may cause a positive TST result on the second test (see 'Serial testing' below). However, in the absence of a documented negative first TST, there is no way to know if the second TST represents boosting or new infection. Hence, the second TST must be interpreted in the same way as a single initial TST. This potential problem reinforces the importance of reading the TST at the correct time. Multipuncture methods (including the Tine test and the Heaf test) should not be used; they may be easier to administer but are not accurate because it is not possible to precisely contr




The TST may be repeated with no effect on subsequent testing. Administration of one or more TSTs does not stimulate type IV hypersensitivity to tuberculin (ie, repeated testing does not sensitize individuals to the test reagent)

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ncluding the Tine test and the Heaf test) should not be used; they may be easier to administer but are not accurate because it is not possible to precisely control the amount of tuberculin [3]. <span>The TST may be repeated with no effect on subsequent testing. Administration of one or more TSTs does not stimulate type IV hypersensitivity to tuberculin (ie, repeated testing does not sensitize individuals to the test reagent) [1]. Adverse reactions — In general, adverse reactions to TST are rare; the most important is hypersensitivity to the tuberculin skin test materials (<1 per million). Manifestations




Manifestations may include urticaria, dyspnea, and angioedema [5]. These manifestations occur immediately (within 15 minutes) or within 6 to 12 hours

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ls to the test reagent) [1]. Adverse reactions — In general, adverse reactions to TST are rare; the most important is hypersensitivity to the tuberculin skin test materials (<1 per million). <span>Manifestations may include urticaria, dyspnea, and angioedema [5]. These manifestations occur immediately (within 15 minutes) or within 6 to 12 hours. Adverse reactions should not be confused with, or interpreted as a positive TST. In addition, secondary bacterial infection may develop at an exuberant test reaction site. If there is




Sensitivity of TST for the 5 mm, 10 mm, and 15 mm threshold is 98, 90, and 50 to 60 percent, respectively [11]. As the cutoff for mm of induration increases, the sensitivity decreases and the specificity increases. A higher cutoff is useful for evaluation of individuals in regions with low rates of true TB infection

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loped to facilitate the interpretation of these tests [10]. The algorithm provides information on positive predictive value of a test result along with predicted risk of progression to disease. <span>Sensitivity of TST for the 5 mm, 10 mm, and 15 mm threshold is 98, 90, and 50 to 60 percent, respectively [11]. As the cutoff for mm of induration increases, the sensitivity decreases and the specificity increases. A higher cutoff is useful for evaluation of individuals in regions with low rates of true TB infection. Guidelines in the United Kingdom for TST interpretation are discussed separately. (See "Approach to diagnosis of latent tuberculosis infection (tuberculosis screening) in adults", sect




Causes of false-negative tests — False-negative TST results may occur in the setting of biologic and technical limitations (table 3). Biologic limitations include immunosuppression, natural waning of immunity, or very recent infection. Technical limitations include improper tuberculin handling and interpretation.

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rranted. The patient should be referred for medical evaluation to exclude active TB, followed by consideration for initiation of treatment for LTBI. (See 'Positive tests' below.) Negative tests <span>Causes of false-negative tests — False-negative TST results may occur in the setting of biologic and technical limitations (table 3). Biologic limitations include immunosuppression, natural waning of immunity, or very recent infection. Technical limitations include improper tuberculin handling and interpretation. Measles vaccination may temporarily suppress tuberculin reactivity. Measles-mumps-rubella (MMR) vaccine may be given after, or on the same day as, the TST. If MMR has been given recentl




Causes of false-positive tests — Causes of false-positive TST include nontuberculous mycobacteria infection and Bacillus Calmette-Guérin (BCG) vaccination. Among individuals with high likelihood of LTBI and/or high risk of development of disease if infected, potential causes of false-positive tests should not influence the decision to administer LTBI therapy

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such as close contact with an active TB case or prior residence in a high-incidence country), the higher the PPV. A computer-based algorithm is available to assist in the interpretation of TST. <span>Causes of false-positive tests — Causes of false-positive TST include nontuberculous mycobacteria infection and Bacillus Calmette-Guérin (BCG) vaccination. Among individuals with high likelihood of LTBI and/or high risk of development of disease if infected, potential causes of false-positive tests should not influence the decision to administer LTBI therapy. ●Nontuberculous mycobacteria – Infection with nontuberculous mycobacteria (NTM) may cause false-positive reactions to tuberculin. Estimates of the frequency of false-positive TSTs due




BCG vaccination in the first year of life may produce low-level TST reactivity in adults; such reactions are typically <10 mm and rarely persist past the age of 10 years. Vaccination after the first year of life (such as at entrance to primary school at age 5 to 6) may cause a stronger and longer-lasting effect; as many as 20 percent of individuals remain TST positive 10 years or more after vaccination at this age [17].

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cination – BCG vaccination is a well-known but frequently misunderstood cause of false-positive tuberculin reactions. The effect of BCG on TST depends primarily on the age when vaccinated [14]. <span>BCG vaccination in the first year of life may produce low-level TST reactivity in adults; such reactions are typically <10 mm and rarely persist past the age of 10 years. Vaccination after the first year of life (such as at entrance to primary school at age 5 to 6) may cause a stronger and longer-lasting effect; as many as 20 percent of individuals remain TST positive 10 years or more after vaccination at this age [17]. In pediatric populations, the interval since vaccination is important since there is progressive waning over the first 10 years after vaccination. Current and past BCG vaccination polic




In general, if primary TB infection develops following clinical exposure, TST conversion occurs three to eight weeks later [13]

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baseline negative testing was recorded many years before the initial TST (see 'General principles' above). Alternatively, one test may be performed 8 to 10 weeks following the end of exposure. <span>In general, if primary TB infection develops following clinical exposure, TST conversion occurs three to eight weeks later [13]. For HCWs with a baseline TST of 0 mm, TST ≥5 mm is considered a positive result; for HCWs with a baseline TST result >0 mm but <10 mm, TST ≥10 mm is considered a positive result




Allergic reactions — Early reaction within 24 hours with absence of induration at 48 to 72 hours is considered an allergic reaction [21]

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is discussed further separately. (See "Use of interferon-gamma release assays for diagnosis of latent tuberculosis infection (tuberculosis screening) in adults", section on 'Reproducibility'.) <span>Allergic reactions — Early reaction within 24 hours with absence of induration at 48 to 72 hours is considered an allergic reaction [21]. Immediate hypersensitivity skin reactions to the TST are possible; these consist of wheal and flare response at the testing site within 20 minutes of purified protein derivative (PPD)




General principles — If the TST is documented to be positive, it should never be repeated. Once the TST is positive it will remain positive, and repeating the test has no clinical utility. However, if there is a history of a positive TST but this is not documented, then it may be appropriate to confirm this

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develop. (See "Use of interferon-gamma release assays for diagnosis of latent tuberculosis infection (tuberculosis screening) in adults", section on 'Serial testing'.) REPEAT AND SERIAL TESTING <span>General principles — If the TST is documented to be positive, it should never be repeated. Once the TST is positive it will remain positive, and repeating the test has no clinical utility. However, if there is a history of a positive TST but this is not documented, then it may be appropriate to confirm this. Individuals who were immunocompromised when they underwent TST or IGRA may have false-negative test results. If the immunocompromising condition is treated (eg, HIV-infected person who




In these individuals, the TST should be repeated eight to ten weeks after the last exposure, since it usually takes three to eight weeks for tuberculin conversion to occur after new infection [13]. The same technique and dose is used, but the TST is applied on the opposite forearm.

In the setting of recent exposure, we define skin test conversion if the induration of the repeat TST measures ≥10 mm and has increased by ≥6 mm over the previous test (ie, the initial negative TST).

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with untreated active pulmonary TB (algorithm 1). These individuals may have an initial negative TST because the TB infection was so recent that delayed hypersensitivity has not yet developed. <span>In these individuals, the TST should be repeated eight to ten weeks after the last exposure, since it usually takes three to eight weeks for tuberculin conversion to occur after new infection [13]. The same technique and dose is used, but the TST is applied on the opposite forearm. In the setting of recent exposure, we define skin test conversion if the induration of the repeat TST measures ≥10 mm and has increased by ≥6 mm over the previous test (ie, the initial negative TST). (See 'TST interpretation' below.) Serial testing — Serial testing is warranted for individuals with ongoing potential exposure (algorithm 2). This may include residents or employees of




In individuals with remote exposure to mycobacterial antigens (eg, due to prior BCG vaccination, nontuberculous mycobacteria infection, or remote TB infection), the tuberculin reaction may have waned due to reduction in number of sensitized T lymphocytes in the absence of new antigen exposure (faded immune memory), and an initial TST may be negative [25-27]. However, placement of the initial TST stimulates anamnestic recall of immunity, such that a second tuberculin test ("booster") will be positive. For this reason, evaluation for the "booster phenomenon" should be performed by repeating the TST (on the opposite forearm) one to four weeks after the initial test. The induration observed with the second test is the baseline that should be used for subsequent evaluation of skin test conversion.

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not performed because of limited resources in these settings [24]. Prior to beginning serial tuberculin testing, two-step tuberculin testing should be performed to establish a correct baseline. <span>In individuals with remote exposure to mycobacterial antigens (eg, due to prior BCG vaccination, nontuberculous mycobacteria infection, or remote TB infection), the tuberculin reaction may have waned due to reduction in number of sensitized T lymphocytes in the absence of new antigen exposure (faded immune memory), and an initial TST may be negative [25-27]. However, placement of the initial TST stimulates anamnestic recall of immunity, such that a second tuberculin test ("booster") will be positive. For this reason, evaluation for the "booster phenomenon" should be performed by repeating the TST (on the opposite forearm) one to four weeks after the initial test. The induration observed with the second test is the baseline that should be used for subsequent evaluation of skin test conversion. The risk of developing active TB among individuals with a booster response is lower than the risk of developing active TB among individuals with an initial positive TST [28,29]. Repeate




The risk of developing active TB among individuals with a booster response is lower than the risk of developing active TB among individuals with an initial positive TST [ 28,29]. Repeated administration of the TST in the absence of mycobacterial exposure or infection is not associated with a booster effect.

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e opposite forearm) one to four weeks after the initial test. The induration observed with the second test is the baseline that should be used for subsequent evaluation of skin test conversion. <span>The risk of developing active TB among individuals with a booster response is lower than the risk of developing active TB among individuals with an initial positive TST [28,29]. Repeated administration of the TST in the absence of mycobacterial exposure or infection is not associated with a booster effect. In the setting of serial testing in individuals with ongoing risk of exposure, skin test conversion refers to a positive TST after a baseline negative TST. The risk of developing active




In the setting of serial testing in individuals with ongoing risk of exposure, skin test conversion refers to a positive TST after a baseline negative TST. The risk of developing active TB is much higher in the setting of TST conversion than booster response.

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tive TB among individuals with an initial positive TST [28,29]. Repeated administration of the TST in the absence of mycobacterial exposure or infection is not associated with a booster effect. <span>In the setting of serial testing in individuals with ongoing risk of exposure, skin test conversion refers to a positive TST after a baseline negative TST. The risk of developing active TB is much higher in the setting of TST conversion than booster response. (See 'TST interpretation' below.) The role of interferon-gamma release assay (IGRA) for serial testing in HCWs is uncertain, in large part due to high rates of false conversions in most




TST interpretation — For TST conversion, we define the repeat TST as positive if the induration measures ≥10 mm and has increased by ≥6 mm since the previous test [1,13]. This definition is used because test variability may be associated with increases in induration of up to 6 mm.

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is discussed further separately. (See "Use of interferon-gamma release assays for diagnosis of latent tuberculosis infection (tuberculosis screening) in adults", section on 'Reproducibility'.) <span>TST interpretation — For TST conversion, we define the repeat TST as positive if the induration measures ≥10 mm and has increased by ≥6 mm since the previous test [1,13]. This definition is used because test variability may be associated with increases in induration of up to 6 mm. The United States Centers for Disease Control and Prevention definition of TST conversion (an increase in induration of ≥10 mm since the previous test) is more specific but less sensiti




The term carbohydrate originates from the root word carbo-, denoting carbon, and hydrate, denoting a compound that is produced when chemical substances combine with water

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Carbohydrates and Barbell Training | Robert Santana
utrient. If I had to be a macronutrient, I’d probably be a carbohydrate. Since I am not, I’ll settle for being an author who defends their honor, palatability, and function in human physiology. <span>The term carbohydrate originates from the root word carbo-, denoting carbon, and hydrate, denoting a compound that is produced when chemical substances combine with water. Put simply, they are hydrates of carbon, although structurally they are more complex than this. Carbohydrate Classification Carbohydrates are classified as either simple carbohydrates




To prospectively evaluate factors that predict achievement of trifecta and pentafecta following robotic-assisted partial nephrectomy (RAPN). Clinical variables of 330 RAPNs performed for a single renal tumor were analyzed for association with post-operativ

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. Journal of robotic surgery 2019 Pre-operative factors that predict trifecta and pentafecta in robotic assisted partial nephrectomy. Amanda E Kahn Ashley M Shumate Colleen T Ball David D Thiel <span>To prospectively evaluate factors that predict achievement of trifecta and pentafecta following robotic-assisted partial nephrectomy (RAPN). Clinical variables of 330 RAPNs performed for a single renal tumor were analyzed for association with post-operative... more Tags Identifiers doi: 10.1007/s11701-019-00958-7 pmid: 30993524 Read SupportCancel<span>