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Tumeurs de la prostate - Diagnostic anatomopathologique
#307 #Cours #Facultaires #Médecine #Oncologie #Prostate #Tumeur #Urologie

Modalités de réalisation

• Examen fait le plus souvent sous anesthésie locale (bloc périprostatique à la lidocaïne), par voie endorectale (fig. 15.2), de façon échoguidée.

• Compte tenu du risque septique, le geste doit systématiquement être couvert par une antibioprophylaxie.
Les fluoroquinolones systémiques sont recommandés en une prise unique par voie orale, 1 à 2 heures avant la réalisation de l'acte.
En cas d'allergie, d'intolérance ou de prise récente (< 6 mois) de quinolone, une antibioprophylaxie par la ceftriaxone est proposée en alternative.

• Les risques hémorragiques doivent être évalués en concertation avec le médecin traitant.
Un arrêt temporaire ou les modalités de relais des traitements anti-coagulants et/ou diminuant l'agrégation plaquettaire doivent être organisés avant le jour des biopsies."

• Geste réalisé en consultation, le patient pouvant reprendre une activité dès le lendemain en général.

• Le nombre moyen de carottes biopsiques est de 12, réparties dans la prostate grâce au contrôle échographique.

• Des biopsies « ciblées » supplémentaires peuvent être ajoutées en cas d'IRM préalable à la réalisation des biopsies de la prostate

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Tumeurs de la prostate - Options thérapeutiques disponibles
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Ce qu'il faut retenir des recommandations AFU 2016–2018 sur la surveillance active :

• la surveillance active est une option thérapeutique recommandée des cancers de la pros- tate à faible risque ;

• les critères d'inclusion sont basés sur les données du toucher rectal, le PSA, et les données biopsiques (au moins 12 carottes) ;

• une série de biopsies de confirmation est nécessaire dans les 18 premiers mois suivant le début de la SA, puis sur un rythme régulier non défini pour l'instant ;

• la sortie de la SA est indiquée par la présence d'un score de Gleason à 7 ou plus sur les biopsies de contrôle ;

• la surveillance repose sur un TR et un dosage du PSA régulier (au moins une fois par an). La place de l'IRM et le rythme des biopsies à réaliser dans le cadre de ce suivi est en évalua- tion sur un TR et un test PSA tous les 3–6 mois.

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Tumeurs de la prostate - Stratégie thérapeutique
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Risque intermédiaire

• Traitements standard : prostatectomie totale ± curage (si probabilité de survie >10 ans) ; radiothérapie externe seule ou associée à une suppression androgénique courte (6 mois) ; curiethérapie dans les formes de meilleur pronostic (PSA <15, GG2 ou Gleason 3 + 4) ; abstention-surveillance (si probabilité de survie <10 ans).

• Traitements en évaluation : US focalisés.

• Traitement en cours d'investigation : cryothérapie

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Tumeurs de la prostate - Stratégie thérapeutique
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Risque élevé • Traitements standard : prostatectomie totale + curage (éventuellement complétée par une radiothérapie) ; radiothérapie externe associée à une suppression androgénique longue (18 mois minimum) ; abstention-surveillance (si probabilité de survie <10 ans). • Traitement en cours d'investigation : hormonothérapie adjuvante à la prostatectomie, chimiothérapie adjuvante à la radiothérapie externe associée à l'hormonothérapie adjuvante

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Tumeurs de la prostate - Stratégie thérapeutique
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La durée de suivi doit probablement être d'au moins 10 ans, des récidives tardives, éligibles à un traitement curatif pouvant survenir avant ce déla

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Tumeurs de la prostate - Stratégie thérapeutique
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Suivi après prostatectomie radicale

• Le PSA seul suffit. Le patient est considéré en réponse complète si le PSA est <0,2 ng/ml 6 semaines après la chirurgie.
• Un niveau de PSA >0,2 ng/ml confirmé à une reprise définit une récidive biologique (ou une absence de réponse initiale).
• Rythme recommandé dans les suites de l'intervention : consultation avec dosage PSA à 1,5 mois, 3 mois, 6 mois, 12 mois, puis tous les 6 mois pendant 3 ans puis annuellement

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Tumeurs de la prostate - Stratégie thérapeutique
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Suivi après radiothérapie externe (avec ou sans hormonothérapie adjuvante) et ou curiethérapie

• TR et PSA nécessaires.

• Il n'y a pas de seuil de PSA permettant d'affirmer la réponse complète.
On appelle le PSA « nadir » la valeur la plus faible de PSA atteinte par le patient.
On tolère ensuite de petites variations autour de ce dosage de PSA.

• La définition de la récidive biologique est différente de la définition après chirurgie.
Elle est définie dans ce cas précis par l'augmentation de plus de 2 ng/ml au-dessus du PSA Nadir (valeur la plus basse de PSA observée après traitement local).
Cette définition suppose donc d'avoir demandé plusieurs dosages successifs de PSA avant d'affirmer la récidive.
Il est souhaitable d'observer un délai suffisant entre les dosages de PSA pour observer cette récidive (en général 3 mois, au minimum 1 mois).

• Rythme recommandé dans les suites de la fin de la radiothérapie : consultation avec dosage PSA à 1,5 mois, 3 mois, 6 mois, 12 mois, puis tous les 6 mois pendant 3 ans puis annuellement.

• Pour évaluer les risques de toxicité spécifiques à la radiothérapie, le suivi doit être fait en radiothérapie au moins une fois par an pendant 5 ans

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Tumeurs de la prostate - Stratégie thérapeutique
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Maladie localisée : principes de la stratégie thérapeutique en cas de récidive après un premier traitement standard à visée curative Une IRM pelvienne peut être proposée à la recherche de signes en faveur d'une récidive locale. Un nouveau bilan d'extension est toujours indiqué, afin de vérifier l'absence de maladie métastatique

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Tumeurs de la prostate - Stratégie thérapeutique
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Récidive après chirurgie Une radiothérapie de la loge de prostatectomie peut être proposée, pouvant être associée à une hormonothérapie courte concomitante éventuellement complétée par une irradiation des aires ganglionnaires

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Tumeurs de la prostate - Stratégie thérapeutique
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Récidive biologique persistante malgré les traitements locaux • Après plusieurs traitements locaux, il est possible que la seule manifestation d'une maladie résiduelle soit un PSA qui continue régulièrement d'augmenter. Les différents d'examen d'imagerie sont alors normaux. • Dans ce cas on parle de « récidive biologique ». • La castration est pour l'instant la seule option discutée dans ce cadre. Le moment précis à partir duquel la castration doit être proposée n'est pas défini

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Tumeurs de la prostate - Stratégie thérapeutique
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Stratégie en cas de cancer de la prostate découvert au stade d'emblée métastatique • La castration est la prise en charge de première ligne, toujours associée au traitement des autres symptômes du patient (douleur osseuse, anémie, dysurie…) : – castration chirurgicale ; – antagoniste de la LH-RH ; – agoniste associé avec un antiandrogène pour 15 jours au moins ; – acétate de cyprotérone

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Tumeurs de la prostate - Stratégie thérapeutique
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Stratégie de première ligne en cas de cancer de la prostate en phase de résistance à la castration 1. Principes généraux • Le traitement de castration de première ligne doit être maintenu durant toute cette phase. • Le diagnostic de « résistance à la castration » suppose de l'authentifier en vérifiant qu'il existe : – soit une progression biochimique : trois augmentations de PSA résultant en deux aug- mentations de 50 % au-dessus du nadir avec un PSA >2 ng/ml ; – soit une progression radiographique (nouvelles lésions apparaissant sur des scintigra- phies osseuses ou progression d'une lésion secondaire mesurable) ; – et que la testostéronémie est bien inférieure à 50 ng/dl

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Tumeurs de la prostate - Stratégie thérapeutique
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Stratégie de suivi du cancer de la prostate métastatique • Évaluation clinique et biologique (PSA) en consultation tous les 3 à 6 mois. • La fréquence des examens d'imagerie dépend du contexte clinique (surveillance personnalisée)

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Tumeurs de la prostate - Stratégie thérapeutique
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Deux situations possibles doivent être connues : • risque neurologique : – des lésions d'épidurite néoplasique et/ou de fracture osseuse pathologique peuvent amener à une symptomatologie aiguë de compression nerveuse, – cette situation particulière doit faire discuter une prise en charge neurochirurgicale en urgence (laminectomie décompressive), afin d'éviter des séquelles irréversibles qui pourraient avoir deux conséquences : – impact direct négatif significatif sur la survie du patient même chez des patients ayant par ailleurs une pathologie évoluée, – aggravation symptomatique et perte d'autonomie brutale ; • complications urologiques, de deux ordres : – rétention aiguë ou d'installation plus sournoise : – le volume de la prostate cancéreuse obstrue la filière urétrale (il s'agit alors d'un obstacle sous-vésical), – le traitement est la résection endo-urétrale, – urétéro-hydronéphrose uni- ou bilatérale avec éventuel retentissement sur la fonction rénale (penser à exclure une rétention urinaire [en cas de doute poser une sonde à demeure]) : – si la dilatation persiste après drainage (envahissement trigonal ou compression extrinsèque par adénopathies iliaques), – si le patient est asymptomatique sur le plan urinaire privilégier un traitement par voie endoscopique (pose de sonde double J), – si le geste par voie endoscopique n'est pas possible ou qu'il existe un envahissement de la vessie par la tumeur, proposer la pose de néphrostomie

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Tumeur du rein
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La majorité des tumeurs du rein sont malignes mais un certain nombre d'entre elles sont bénignes (notamment les petites tumeurs) ou ont un faible potentiel évolutif

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Tumeur du rein
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La découverte d'une tumeur du rein est une situation relativement fréquente. Dans 70 à 80 % des cas, les tumeurs du rein sont découvertes de façon fortuite (tumeur incidentale) par des examens d'imagerie abdominale (échographie, scanner ou IRM) demandés pour une autre raison

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Tumeur du rein
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Épidémiologie Le cancer du rein occupe le 6 e rang des tumeurs solides malignes. L'âge médian au diagnostic est de 69 ans et le sex-ratio est de deux hommes pour une femme. Un tiers des patients est diagnostiqué au stade métastatique et, parmi les patients présentant une forme localisée, environ 30 % vont développer des métastases. Aux États-Unis, son incidence a augmenté de 126 % depuis 1950

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Tumeur du rein
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Histoire naturelle

La carcinogenèse rénale est variable en fonction des types histologiques.
Dans le type histologique le plus fréquent (carcinome rénal à cellules claires), les principales voies métaboliques impliquées sont :
• l'inactivation du gène VHL induisant la stimulation d'une néoangiogenèse tumorale ;
• la survenue d'un shift métabolique se traduisant par le métabolisme préférentiel du glucose en lactate indépendamment de la disponibilité en oxygène.

Au moment du diagnostic, environ 10 à 40 % des cancers rénaux sont d'emblée métastatiques et environ 10 à 30 % le deviendront après néphrectomie pour un stade localisé.

Les principaux sites métastatiques sont : le poumon, le foie, les os, les surrénales, le cerveau.

Les tumeurs malignes du rein ont cependant la particularité de pouvoir métastaser dans n'importe quel organe et même plusieurs années après le diagnostic. L'autre particularité du cancer du rein est sa capacité à s'étendre dans le système veineux cave à partir de la veine rénale

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Tumeur du rein
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Facteurs de risque

Les facteurs de risque de cancer du rein sont :

  • Tabac
  • Obésité
  • Sexe masculin
  • Hypertension artérielle
  • Insuffisance rénale
  • Transplantation rénale
  • Exposition environnementale (trichloréthylène)
  • Prédispositions génétiques dont des formes familiales (la principale est la maladie de Von Hippel-Lindau)

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Tumeur du rein
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Près de 70 à 80 % des tumeurs du rein sont des tumeurs malignes. Les carcinomes les plus fréquents sont : • les carcinomes rénaux à cellules claires (CRCC) (75–85 %) ; • les carcinomes tubulopapillaires (CRTP) avec deux sous-types, 1 et 2 (12–14 %) ; • les carcinomes chromophobes (4–6 %)

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Tumeur du rein
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Le grade tumoral ISUP (International Society of Uro-Pathology), anciennement appelé grade de Fuhrman est utilisé pour les CRCC et les CRTP pour évaluer l'agressivité de la tumeur. Il va de 1 à 4 et on distingue souvent les tumeurs de bas grade (1 et 2) et de haut grade (3 et 4). Il est établi à partir de l'analyse de la tumeur (lorsqu'elle a été retirée) ou de la biopsie et repose sur la présence d'anomalies cytonucléaires

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Tumeur du rein
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Tumeurs rénales bénignes Les deux plus importantes à connaître sont : • l'oncocytome (aussi appelé adénome oncocytaire) : – plus fréquent chez la femme, – il peut parfois avoir une cicatrice stellaire centrale visible sur les examens d'imagerie ; • l'angiomyolipome : – c'est une tumeur bénigne qui associe trois composantes (adipeuse, musculaire et vasculaire), – c'est la seule tumeur bénigne dont on peut évoquer le diagnostic lorsqu'il y a une plage graisseuse (densité négative) à la tomodensitométrie, – c'est une tumeur rare (0,1 à 0,2 % de la population), plus fréquente chez la femme, – il est en général petit et isolé, – il est parfois volumineux et multiple et il faut alors évoquer une sclérose tubéreuse de Bourneville, – le risque principal de cette tumeur est un saignement qui peut justifier un traitement préventif lorsque la taille tumorale est supérieure à 4 cm.

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Tumeur du rein
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dans certains cas, elles peuvent être associées à une hypercalcémie ou une polyglobulie

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Tumeur du rein
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ilan biologique Le bilan d'une tumeur du rein est simple : • dosage de la créatinine sanguine avec mesure de la clairance selon MDRD (modification of the diet in renal disease) ou, plus récemment CKD-EPI (chronic kidney disease- epidemiology collaboration) ; • numération-formule sanguine. En cas de tumeur métastatique, il faut y ajouter : • bilan hépatique ; • LDH ; • phosphatases alcalines ; • calcémie ; • bilan de coagulation ; • plaquettes

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Tumeur du rein
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Tomodensitométrie abdominale avec injection C'est l'examen de référence pour faire le diagnostic d'une tumeur du rein. Il doit comprendre quatre temps : sans injection, artériel ou précoce, tubulaire et excréteur ou tardif. La tomodensitométrie (TDM) permet de caractériser la tumeur : • elle renseigne sur son caractère tissulaire (caractérisé par une prise de contraste significative de + de 15 unités Hounsfield [UH]) ou kystique ; • elle évalue précisément sa taille et sa topographie ; • elle peut montrer une zone de densité lipidique, graisseuse sur les coupes sans injection qui est caractéristique d'un angiomyolipome (fig. 16.2) ; • en cas de tumeur kystique, elle permet de classer la tumeur selon la classification de Bosniak

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Tumeur du rein
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La TDM abdominale doit être associée à une TDM thoracique pour faire le bilan d'extension de la tumeur.

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IRM rénale Elle est moins irradiante que la TDM et le gadolinium, utilisé comme produit d'injection, est moins néphrotoxique. Elle est intéressante dans les situations suivantes : • altération de la fonction rénale (clairance MDRD < 60 ml/min) ; • exploration des lésions kystiques mal caractérisées par les autres examens d'imagerie ; • évaluation du niveau supérieur d'un thrombus veineux

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La biopsie donne des renseignements diagnostiques et pronostiques : • nature de la tumeur : maligne ou bénigne ; • sous-type histologique si elle est maligne ; • grade de l'ISUP (anciennement appelé grade de Fuhrman)

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Tumeur du rein
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Dans les centres expérimentés, la biopsie a une bonne performance diagnostique notamment pour déterminer la malignité (> 95 %). Les complications sont peu fréquentes (< 10 %) et le plus souvent mineures

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Tumeur du rein
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Les indications de biopsies sont : • avant de donner un traitement médical en cas de tumeur métastatique ; • en cas d'incertitude diagnostique sur l'imagerie (lorsqu'on pense qu'il peut s'agir d'une tumeur qui n'est pas un cancer du rein : sarcome, lymphome, métastase d'une autre tumeur) ; • avant décision de surveillance active d'une petite tumeur ; • avant thermo-ablation d'une petite tumeur ; • en cas de petite tumeur chez une personne âgée (> 70 ans) avec des comorbidités

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Tumeur tissulaire - Métastases à distance

Le diagnostic est confirmé par la TDM thoracique, abdominale et pelvienne qui montre des lésions secondaires qui peuvent être multiples : poumons, foie, adénopathies… Il faut compléter le bilan par une scintigraphie osseuse et une tomodensitométrie cérébrale. Il faut obtenir une preuve histologique de la nature de la tumeur : • le plus souvent par une biopsie percutanée ; • dans certaines situations par la néphrectomie ; • pour pouvoir décider du meilleur traitement

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Tumeur du rein
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Tumeur localisée

Petite tumeur du rein On parle de petite tumeur du rein en cas de tumeur tissulaire, isolée, de moins de 4 cm (fig. 16.7). C'est une situation fréquente. Les petites tumeurs sont le plus souvent découvertes de façon fortuite. La TDM thoracique, abdominale et pelvienne est suffisante pour le bilan d'extension. Il n'y a en général pas d'anomalie biologique associée. Les petites tumeurs du rein sont malignes dans 80 % des cas et bénignes dans 20 % des cas. Les examens d'imagerie ne sont pas suffisamment performants pour statuer sur la nature bénigne ou maligne sauf en cas de plage de densité graisseuse qui doit faire évoquer un angiomyolipome.

La biopsie percutanée peut être proposée pour confirmer le diagnostic avant de proposer un traitement dans les situations difficiles (patients avec lourdes comorbidités, rein unique, tumeurs bilatérales, tumeur dont l'exérèse chirurgicale est à risque de par sa localisation dans le rein)

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Tumeur localisée de plus de 4 cm (T1b et T2) Ce sont des tumeurs localisées qui n'ont pas dépassé la capsule du rein (fig. 16.8) (vidéos e16.1 et e16.2). Elles sont en général asymptomatiques et découvertes fortuitement. Elles sont souvent malignes et sauf cas particulier (personne âgée, tumeur complexe), la biop- sie n'est pas nécessaire avant traitement

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Tumeur localement avancée Ce sont des tumeurs du rein qui ne sont ni intracapsulaires (T1-T2), ni métastatiques (M1). Elles sont malignes dans la grande majorité des cas. Il est donc rare de devoir faire une biopsie et le traitement (chirurgical) est proposé sans preuve histologique. Ce type de tumeur peut envahir la graisse périrénale (tumeur T3a, fig. 16.9), la veine rénale, la veine cave (fig. 16.10) et s'accompagner d'adénopathies lombo-aortiques

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Tumeur kystique Elles représentent 5 à 10 % des tumeurs du rein. Elles sont en général peu agressives. Elles doivent être analysées par un scanner abdominal ou une IRM. L'échographie de contraste peut être intéressante lorsque le scanner ou l'IRM ne permettent pas de conclure. Un kyste simple est constitué d'une paroi très fine et a un contenu hydrique (fig. 16.12). Ces kystes sont très fréquents à partir de 50 ans et sont bénins

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Certains éléments d'imagerie doivent faire considérer le kyste comme atypique, suspect ou franchement tumoral : • la présence de cloisons ; • l'épaississement des parois ou des cloisons ; • les calcifications ; • le rehaussement de la paroi ou des cloisons ; • la présence de végétations intrakystiques

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La présence d'un ou de plusieurs de ces éléments permet de caractériser le kyste selon la classification de Bosniak (tableau 16.1) : • les kystes bénins (Bosniak I ou II) ne nécessitent ni traitement ni surveillance ; • les kystes Bosniak III (fig. 16.13) sont dits suspects et ont 50 % de risque d'être malins ; il est recommandé de les opérer ; • les kystes Bosniak IV (fig. 16.14) sont dits malins et doivent être opérés. On distingue aussi les kystes classés Bosniak IIF (pour follow-up, surveillance)

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Tumeur du rein
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Tumeur du rein
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Tumeur du rein
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TNM REIN PARTIE 1

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Tumeur du rein
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TNM REIN PARTIE 2

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Tumeur du rein
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Tumeur du rein
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Tumeur du rein
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Tumeur du rein
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Tumeur du rein
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Tumeur du rein
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Tumeur du rein - Traitements
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Tumeurs localisées < 6 cm

Néphrectomie partielle

Le traitement de référence des petites tumeurs du rein est la néphrectomie partielle lorsqu'elle est techniquement réalisable

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Tumeur du rein - Traitements
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Tumeurs localisées < 6 cm

Techniques thermo-ablatives

La radiofréquence ou la cryoablation percutannée peuvent être proposées après confirmation histologique de la nature maligne de la tumeur pour les tumeurs de moins de 3 cm dans certains cas sélectionnés : • patients avec de nombreuses comorbidités ; • rein unique fonctionnel ; • tumeurs multiples

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Tumeur du rein - Traitements
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Tumeurs localisées < 6 cm

Surveillance simple

Dans certains cas, et en raison de la nature souvent indolente des petites tumeurs du rein, une surveillance simple par imagerie peut être proposée chez les patients dont l'espérance de vie est limitée

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Tumeur du rein - Traitements
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Tumeurs de plus de 6 cm

Le traitement de référence des volumineuses tumeurs du rein est la néphrectomie élargie.

La surrénale homolatérale est conservée sauf en cas d'envahissement sur l'imagerie préopératoire

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Tumeur du rein - Traitements
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Surveillance après néphrectomie

Actuellement, aucun traitement adjuvant (thérapie ciblée, immunothérapie ou radiothérapie) n'est recommandé après néphrectomie pour une tumeur localisée.

Il est proposé un suivi clinique, biologique (créatinémie plasmatique) et d'imagerie (scanner thoracique, abdominal et pelvien) dont la fréquence dépend de l'agressivité histologique et du stade de la tumeur

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Tumeur du rein - Traitements
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Tumeurs oligométastatiques Dans le cadre des tumeurs du rein avec peu de métastases, il peut être proposé un traitement de la tumeur primitive (néphrectomie) et des métastases (exérèse chirurgicale, radiothérapie ou traitement ablatif) afin d'obtenir une rémission complète

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Tumeur du rein - Traitements
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Tumeurs du rein multimétastatiques Dans ce contexte la néphrectomie est discutée en fonction de l'état général, de la difficulté de la chirurgie et du pronostic de la maladie. Un traitement systémique est ensuite proposé. Les traitements systémiques reposent sur deux grandes classes thérapeutiques : • les thérapies ciblées (inhibiteur de tyrosine kinase et inhibiteur de mTOR) ; • l'immunothérapie (anti-CTLA-4, inhibiteur de PD-L1 et PD-L1 ligand)

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Tumeurs testiculaires
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Les tumeurs germinales représentent 95 % des tumeurs malignes du testicule et se répar- tissent en non séminomateuses (TGNS) et séminomateuses (TGS)

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Tumeurs testiculaires
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Le cancer du testicule est le cancer le plus fréquent des hommes avant 35 ans. Son incidence en France en 2012 était de 1 230 nouveaux cas par an

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Tumeurs testiculaires
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L'incidence du cancer du testicule (4,5 nouveaux cas/100 000 hommes/an) est en forte aug- mentation et a doublé depuis 1980 (fig. 17.1). Le pic d'incidence se situe entre 30 et 34 ans pour les TGNS et 39 ans pour les TGS

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Tumeurs testiculaires
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Histoire naturelle La néoplasie germinale in situ (NGIS) est un état précancéreux, qui concerne la majorité des tumeurs germinales du testicule. Parallèlement à une croissance volumique locale au sein de la pulpe, les tumeurs germinales ont un tropisme métastatique surtout lymphatique dans la zone de drainage du testicule (ganglions rétropéritonéaux, médiastinaux et sus-claviculaire gauche), mais aussi hématogène (poumons, foie, plus rarement cerveau et os). La maladie est localisée au testicule dans 60 à 70 % des cas au diagnostic

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Tumeurs testiculaires
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Facteurs de risque Les facteurs de risque de tumeurs germinales sont : • antécédent personnel ou familial (1 er degré) de tumeur germinale ; • cryptorchidie, ectopie testiculaire ; • atrophie testiculaire ; • syndrome de dysgénésie testiculaire : infertilité, atrophie, cryptorchidie, hypospadias ; • maladies syndromiques : Down, Klinefelter (tumeurs germinales extragonadiques médiastinales)

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Tumeurs testiculaires
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Les microlithiases testiculaires ne doivent pas être considérées comme un facteur de risque

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Tumeurs testiculaires
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Anatomopathologie La gonade mâle est composée de tubes séminifères enfermant les cellules de la lignée germi- nale, et des cellules stromales (Sertoli et Leydig). Ces éléments sont organisés par des struc- tures conjonctives septales convergentes (cloisons, rete testis, cônes efférents, épididyme)

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Tumeurs testiculaires
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Les tumeurs germinales comprennent les TGNS (55 %) et les TGS (45 %). Les TGNS sont composées d'un sous-type histologique unique ou d'une mosaïque de contingents parmi les- quels : le carcinome embryonnaire, le choriocarcinome, la tumeur du sac vitellin, le tératome. La présence d'un contingent séminomateux au sein d'une tumeur mixte ne requalifie pas le cancer en TGS. Une TGS est toujours « pure ».

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Tumeurs testiculaires
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Signes physiques d'examen Localement, l'examen doit être bilatéral et comparatif. La tumeur est classiquement une masse circonscrite, pierreuse, sensible plus que douloureuse à la palpation. Le sillon épididymo- testiculaire est conservé, ce qui signe l'origine testiculaire du processus (signe de Chevassu) (fig. 17.2). L'abdomen est profondément palpé, les champs pulmonaires auscultés, les aires ganglionnaires sus-claviculaires palpées ainsi que les glandes mammaires à la recherche de gynécomastie

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Tumeurs testiculaires
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L'échographie scrotale (fig. 17.3) est recommandée systématiquement. Elle a une sensi- bilité supérieure à 95 % lorsqu'elle est couplée à l'examen clinique, permet de distinguer les lésions intra- et extratesticulaires, d'évoquer certaines lésions bénignes. Quoique non spécifiques, les TGS ont le plus souvent un aspect de masses lobulées hypoéchogènes, vas- cularisées en Doppler couleur, associées à des microlithes. Les TGNS sont volontiers plus hétérogènes

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Tumeurs testiculaires
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La tomodensitométrie thoracique, abdominale et pelvienne est recommandée systématique- ment, aux fins d'évaluation du stade ganglionnaire rétropéritonéal, des éventuelles métastases viscérales abdominales. Le scanner thoracique est l'examen le plus sensible pour la détection des métastases pulmonaires ou des adénopathies médiastinales

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Tumeurs testiculaires
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Le dosage de trois marqueurs sériques est recommandé systématiquement avant et après orchidectomie. La valeur postopératoire est à la base des classifications pronostiques

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Tumeurs testiculaires
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• L'alpha-fœtoprotéine (AFP) est principalement produite par les tumeurs vitellines et le carci- nome embryonnaire. Sa demi-vie est de 5 à 7 jours. Elle n'est pas totalement spécifique et peut être retrouvée en oncologie digestive (carcinome hépatocellulaire, pancréas, estomac) et dans certaines hépatopathies non tumorales

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Tumeurs testiculaires
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• L'hormone chorionique gonadotrope humaine (HCG) totale est systématiquement sécré- tée par le choriocarcinome et dans 10 à 20 % des séminomes. Sa demi-vie est de 24 à 36 heures. La seule sous-unité β de l'HCG ne peut être utilisée dans les classifications pronostiques qui reposent sur la valeur de l'HCG totale

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Tumeurs testiculaires
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• Les lactates déshydrogénases (LDH) sont non spécifiques car corrélées au turn-over cellulaire.

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Tumeurs testiculaires
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La taille de la tumeur (>4 cm) et l'invasion du rete testis sont les deux facteurs pronostiques des TGS du stade I. L'invasion lymphovasculaire (ILV) est le seul facteur pronostique de récidive (rétropéritonéale) des TGNS du stade I

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Tumeurs testiculaires
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Orchidectomie totale L'orchidectomie dite « élargie » est le traitement local de référence des cancers du testicule. Il s'agit du premier geste thérapeutique mais aussi du dernier geste diagnostique. L'abord inguinal est impératif pour respecter le drainage lymphatique et permettre la ligature première du cordon à l'orifice inguinal interne (fig. 17.5). Une prothèse testiculaire peut être mise en place dans le même temps chirurgical que l'orchidectomie

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Tumeurs testiculaires
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Orchidectomie partielle Elle est recommandée uniquement en cas de testicule unique ou de tumeurs bilatérales syn- chrones (exceptionnelles). Elle est licite dans des conditions stringentes (fonction endocrine normale [testostéronémie normale], volume tumoral inférieur à 30 % du volume gonadique, diamètre de la tumeur inférieur à 2 cm) et doit s'accompagner de prélèvement de pulpe saine à distance de la tumeur pour rechercher une NGIS associée. Lorsque la présentation fait fortement évoquer une tumeur bénigne de type Leydigome (tumeur intratesticulaire bien limitée, ovalaire), une tumorectomie partielle peut être réali- sée. Le patient doit être prévenu d'une possible totalisation en cas de malignité sur l'analyse pathologique définitive

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Tumeurs testiculaires
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Les tumeurs scrotales qui ne sont pas des tumeurs malignes du testicule : • tumeur épididymaire ; • kyste intratesticulaire

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Tumeurs testiculaires
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Conclusion Le diagnostic d'une tumeur testiculaire doit procéder d'une démarche précise, systématique et aboutie, allant jusqu'à l'orchidectomie. Cette attitude est dictée par la fréquence élevée de nature maligne des tumeurs solides du testicule et par l'extrême curabilité de cette pathologie si elle est prise en charge précocement

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Tumeurs testiculaires - Notions de Traitement
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Cancers stades I AJCC Les tumeurs germinales de stade I sont définies par le caractère localisé de la maladie (scanner thoraco-abdominal normal, marqueurs normaux après orchidectomie). L'orchidectomie est curative pour 75 % des stades I mais dans 25 % des cas, la maladie progresse sur un mode ganglionnaire rétropéritonéal (majoritairement dans les 2 ans qui suivent l'orchidectomie). Cette récidive implique la nécessité d'une chimiothérapie de rattrapage.

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Tumeurs testiculaires - Notions de Traitement
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Séminomes (TGS I) La taille de la tumeur supérieure à 4 cm et l'envahissement du rete testis sont les deux facteurs pronostiques de récidive. La récidive concerne jusqu'à 28 % des cas si ces deux facteurs sont présents. La surveillance des séminomes (clinique, scanographique et biologique) est une option de choix, en particulier en l'absence de ces facteurs de risque de récidive. Une attitude adjuvante peut être discutée en cas de facteurs de risque. Il s'agit d'une radio- thérapie sur les aires ganglionnaires rétropéritonéales (20 Gy para-aortique) ou d'une chimio- thérapie par une cure de carboplatine AUC7. Ces traitements adjuvants à l'orchidectomie réduisent le risque de récidive en deçà de 5 %

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Tumeurs testiculaires - Notions de Traitement
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Tumeurs germinales non séminomateuses (TGNS I) L'invasion lymphovasculaire est le principal facteur de risque de récidive des TGNS de stade I. En présence d'invasion lymphovasculaire, le risque de récidive se porte aux alentours de 50 %. La surveillance des TGNS est une option, en particulier en l'absence d'invasion lymphovascu- laire. Cette surveillance est basée sur l'examen clinique, la biologie et l'imagerie. Une attitude adjuvante peut être discutée en cas d'invasion lymphovasculaire. Il s'agit princi- palement d'une chimiothérapie par un cycle unique de BEP (bléomycine, étoposide, cisplatine). Cette chimiothérapie baisse le risque de récidive à 3 %. Un curage rétropéritonéal unilatéral dit « de stadification » est également une option adju- vante, peu utilisée en France, dont le rationnel est la relative constance du site de récidive et la possible présence de tératome (naturellement chimiorésistant) dans le tissu ganglionnaire

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Tumeurs testiculaires - Notions de Traitement
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Tumeurs germinales métastatiques Le traitement des tumeurs germinales métastatiques repose (après l'orchidectomie) sur la chimiothérapie. Le protocole standard par BEP (bléomycine, étoposide, cisplatine) est recom- mandé, 3 ou 4 cycles selon le groupe pronostique auquel appartient le patient, défini par la classification IGCCCG. Une réévaluation (clinique, biologique et par imagerie) post-chimiothérapie est réalisée, qui indique, en cas de masse résiduelle une chirurgie de curage rétropéritonéal. Même si le spé- cimen de lymphadénectomie est dans 50 % des cas de la fibrose, le curage est indiqué en cas de masse résiduelle car aucun examen préopératoire ne permet de préjuger suffisamment sûrement de la nature de ces masses résiduelles. Cette chirurgie est systématique pour toute masse >1 cm en cas de TGNS et se discute pour les masses >3 cm en cas de TGS en fonction d'une évaluation par TEP-TDM au 18 FDG. Les situations de récidive après chimiothérapie, de résistance à la chimiothérapie sont grevées d'un pronostic très péjoratif. Elles relèvent de chimiothérapie de rattrapage conventionnel ou d'intensification (avec support de cellules souches)

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Tumeurs testiculaires - Notions de Traitement
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Tumeurs vésicales
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Généralités Le cancer de la vessie est le 5 e cancer en fréquence en France (12 000 cas/an). Dans plus de 95 % des cas, il s'agit d'une tumeur urothéliale (cellules transitionnelles). Les tumeurs uro- théliales peuvent être multifocales et être localisées à la voie excrétrice supérieure (TVES), à la vessie (TV), à l'urètre. Les tumeurs urothéliales sont favorisées par des carcinogènes urothé- liaux (tabac) auxquels l'exposition doit cesser. Le bilan urothélial puis la surveillance urothéliale associent : cytologie urinaire, urétrocystoscopie et uroscanner

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Tumeurs vésicales
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Le carcinome in situ (CIS) est une forme agressive de tumeur urothéliale. Son développement initialement plan en rend le diagnostic difficile. Multifocalité, volume tumoral, grade tumoral, CIS et récidive sont les éléments diagnostiques de gravité des TVNIM : ils permettent d'évaluer le risque évolutif sur lequel se fonde ensuite la décision thérapeutique

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Tumeurs vésicales
#311 #Cours #Facultaires #Médecine #Oncologie #Tumeur #Urologie #Vésicale
Les rares tumeurs non urothéliales de la vessie (épidermoïde, adénocarcinome, etc.) ont des facteurs de risque, une évolution et une prise en charge différents des tumeurs urothéliales

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Tumeurs vésicales
#311 #Cours #Facultaires #Médecine #Oncologie #Tumeur #Urologie #Vésicale
Urothélium L'urothélium (ou épithélium transitionnel) est l'épithélium de revêtement de l'arbre urinaire. Il recouvre tout l'appareil urinaire (haut et bas appareils excréteurs). La maladie de l'uro- thélium peut donc toucher de manière synchrone ou métachrone : calices, pyélons, uretères, vessie et urètre.

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Tumeurs vésicales
#311 #Cours #Facultaires #Médecine #Oncologie #Tumeur #Urologie #Vésicale

Facteurs de risque

• Tabac : l'intoxication tabagique est le principal facteur de risque, il multiplie par 3 le risque de tumeur de la vessie.

• Carcinogènes industriels : la découverte d'une tumeur de la vessie doit faire évoquer systématiquement une exposition professionnelle. – Les hydrocarbures aromatiques polycycliques (tableau 16 bis du régime général de la Sécurité sociale) : – goudrons, huiles et brais de houille ; – suie de combustion du charbon ; – métallurgie

– Les amines aromatiques et N-nitroso-dibutylamine (tableau 15 ter du régime général de la Sécurité sociale) :

– colorants (teinture) ;

– industrie du caoutchouc (pneu de voiture) ;

– plastinurgie (fabrication de plastiques) ;

– industrie pharmaceutique (laboratoires).

• Inflammation/irritation vésicale :

– bilharziose urinaire ;

– sondage vésical chronique (neurovessies) ;

– irradiation pelvienne ;

– exposition à certaines chimiothérapies (cyclophosphamide).

• Antécédents à risque :

– antécédent de tumeur du bas (vessie) ou du haut (uretère, pyélon, calice) appareil urinaire ;

– syndrome de Lynch.

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Tumeurs vésicales
#311 #Cours #Facultaires #Médecine #Oncologie #Tumeur #Urologie #Vésicale
Circonstances de découverte Le diagnostic est presque toujours fait sur des points d'appel cliniques et la découverte fortuite sur des examens d'imagerie est rare (échographie, scanner ou IRM)

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Tumeurs vésicales
#311 #Cours #Facultaires #Médecine #Oncologie #Tumeur #Urologie #Vésicale
Signes cliniques locaux (communs à toutes les tumeurs) Le diagnostic est rarement fortuit, deux symptômes sont évocateurs : • l'hématurie macroscopique : – c'est le signe révélateur le plus fréquent (80 %). Toute hématurie microscopique ou macroscopique doit faire rechercher une tumeur de la vessie (mais aussi d'un rein ou d'un uretère) ; • les signes irritatifs vésicaux (pollakiurie, urgenturie, brûlures mictionnelles) : – moins fréquents (20 %), doivent faire évoquer le diagnostic s'ils sont d'apparition récente et persistent après avoir éliminé une infection urinaire (ECBU)

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Tumeurs vésicales
#311 #Cours #Facultaires #Médecine #Oncologie #Tumeur #Urologie #Vésicale
Interrogatoire – Facteurs de risque • Recherche des facteurs de risque. • Recherche de symptômes évocateurs d'envahissement locorégional ou à distance et date de début des symptômes. • Score G8 si âgé de plus de 70 ans

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Tumeurs vésicales
#311 #Cours #Facultaires #Médecine #Oncologie #Tumeur #Urologie #Vésicale
Le bilan diagnostique initial repose sur deux examens essentiels : cytologie urinaire et cystoscopie

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Tumeurs vésicales
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Cystoscopie, fibroscopie En cas de signe d'alerte, l'examen endoscopique fait référence. Il est réalisé sous anesthésie locale en consultation après vérification de la stérilité des urines (ECBU). Il est réalisé avec un fibro scope souple idéalement, sinon avec une cystoscopie rigide. Il permet de visualiser et de décrire les lésions. Les résultats sont notés sur un schéma de cartographie vésicale et précisent : • le nombre et la taille de la ou des tumeurs ; • la localisation (notamment en cas de tumeur au trigone, proche des méats urétéraux ou du col vésical) ; • l'aspect tumoral (sessile ou pédiculée, papillaire ou solide) (fig. 18.3) ; • l'aspect de la muqueuse vésicale avoisinante (recherche de zones érythémateuses évoca- trices de carcinome in situ)

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Tumeurs vésicales
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Lorsqu'un patient est adressé par un médecin généraliste avec un examen d'imagerie (écho- graphie ou tomodensitométrie) évoquant fortement une tumeur de la vessie, l'étape de la fibroscopie vésicale diagnostique avant la résection endoscopique devient optionnelle

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Tumeurs vésicales
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Résection transurétrale de tumeurs vésicales En cas de tumeur diagnostiquée endoscopiquement ou radiologiquement, une résection endovésicale, transurétrale, est programmée au bloc opératoire sous anesthésie générale ou locorégionale, après arrêt (ou relais) des anticoagulants et vérification de la stérilité des urines. Les copeaux (ou la pièce monobloc) de résection sont analysés en anatomopathologie. La résection doit : • être endoscopiquement complète (ce n'est donc pas une biopsie) ; • être suffisamment profonde pour avoir une analyse du muscle vésical (le détrusor), sans perforer la vessie ; • respecter les méats urétéraux s'ils ne sont pas envahis

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Tumeurs vésicales
#311 #Cours #Facultaires #Médecine #Oncologie #Tumeur #Urologie #Vésicale
La résection est un geste parfois incomplet et nécessite d'être réalisée une seconde fois 4 à 6 semaines après, ce qui permet de préciser le diagnostic et d'améliorer l'efficacité théra- peutique (résection dite « de second look ») : • lorsqu'elle a probablement été incomplète (tumeur volumineuse) ; • lorsqu'il existe un risque de méconnaître une TVIM : – tumeur affleurant le muscle (stade T1), – résection insuffisamment profonde (muscle non visualisé sur les copeaux de résection)

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Tumeurs vésicales
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Stade tumoral T Il précise la profondeur de l'envahissement vésical : • jusqu'à T1 on parle de TVNIM (tumeur vésicale non infiltrant le muscle) : – Ta : tumeur papillaire sans infiltration du chorion, – Tis : c'est le carcinome in situ urothélial (CIS). On le distingue d'une tumeur Ta car il est plan (donc invisible en imagerie de coupe) et toujours de haut grade (donc agressif). Il peut être isolé, ou associé à des tumeurs papillaires, – T1 : tumeur infiltrant le chorion ; • à partir de T2 on parle de TVIM (tumeur vésicale infiltrant le muscle) : – T2 : tumeur infiltrant la musculeuse, – T3 : tumeur infiltrant la graisse périvésicale, – T4 : tumeur infiltrant un organe de voisinage. La résection ne permet pas d'identifier les stades T3 ou T4. Le bilan d'imagerie peut le prévoir. Seul l'examen anatomopathologique de la pièce de cystectomie permet la stadification défi- nitive de la tumeur

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Tumeurs vésicales
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Le carcinome in situ et les TVIM sont toujours de haut grade.

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Tumeurs vésicales
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Facteurs pronostiques et stratification du risque des TVNIM Le diagnostic pronostique des TVNIM est basé sur : • des critères anatomopathologiques, majeurs, qui sont associés au risque de progression : – stade pathologique (T), – grade histologique (G), – présence de carcinome in situ (CIS) ; • des critères endoscopiques, mineurs, qui sont associés au risque de récidive : – tumeur récidivante, – multifocalité, – taille >3 cm

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Tumeurs vésicales
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TVNIM Aucun bilan d'extension n'est nécessaire pour la tumeur vésicale elle-même. Cependant une uro-TDM (avec un temps tardif urinaire, ou excrétoire) doit être réalisée, après vérifi- cation de la fonction rénale (créatininémie), afin de rechercher une localisation tumorale synchrone dans le haut appareil urinaire.

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Tumeurs vésicales
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TVIM

Une TDM thoraco-abdomino-pelvienne avec injection de produit de contraste et réalisation d'un temps tardif urinaire (ou excrétoire) est indispensable après vérification de la fonction rénale (créatininémie) et permet : • l'évaluation d'un éventuel retentissement sur le haut appareil urinaire (obstruction urété- rale par la tumeur) ; • la recherche d'une seconde localisation urothéliale (tumeur concomitante du haut appareil)

• l'évaluation de l'extension locorégionale et à distance de la tumeur :

– envahissement de la graisse périvésicale ou des organes de voisinage,

– recherche d'adénopathies pelviennes ou lombo-aortiques,

– recherche de métastases à distance.

Les examens optionnels sont :

• la scintigraphie osseuse en cas :

– de douleurs osseuses évocatrices à l'examen clinique,

– d'une anomalie osseuse au scanner,

– de la présence de métastases pulmonaires ;

• le scanner cérébral en cas de troubles neurologiques.

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Tumeurs vésicales - Traitement
#311 #Cours #Facultaires #Médecine #Oncologie #Tumeur #Urologie #Vésicale
Principes spécifiques Sauf exception (risque très élevé), le traitement est conservateur, évitant donc la cystectomie. Il est basé sur des instillations endovésicales répétées et une surveillance endoscopique et cytologique prolongée. Il dépend du risque de récidive et de progression de la tumeur vers une TVIM (tableau 18.3).

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Tumeurs vésicales
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Tumeurs vésicales - Traitement
#311 #Cours #Facultaires #Médecine #Oncologie #Tumeur #Urologie #Vésicale

TVIM non métastatique

Le risque d'évolution métastatique est important et le traitement est non conservateur, associant :
• une chimiothérapie néoadjuvante : à base de cisplatine, visant à détruire d'éventuelles micrométastases non visibles en imagerie et réduire le volume tumoral ;
• l'exérèse chirurgicale de la vessie : on réalise une cystoprostatectomie totale chez l'homme, une pelvectomie antérieure chez la femme, un curage ganglionnaire pelvien est associé, puis les urines sont dérivées soit de façon continente (entérocystoplastie = vessie de rem- placement) soit de façon non continente, c'est-à-dire avec une stomie urinaire (urétéro- iléoplastie cutanée selon Bricker).

Un traitement trimodal (résections-radio-chimiothérapie) peut être proposé en alternative à la cystectomie lorsque celle-ci est contre-indiquée, ou refusée par le patient.

La surveillance est clinique et radiologique, réalisée par scanner thoraco-abdomino-pelvien à la recherche d'une récidive locale, urothéliale (haut appareil excréteur) ou de lésions secondaires métastatiques (tous les 6 mois)

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Tumeurs vésicales - Traitement
#311 #Cours #Facultaires #Médecine #Oncologie #Tumeur #Urologie #Vésicale
TV métastatique Il n'existe pas de traitement curateur. La vessie est laissée en place. Le traitement permet de retarder l'évolution de la maladie et fait appel à : • une chimiothérapie à base de cisplatine en première ligne ; • une immunothérapie systémique en seconde ligne ; • des soins palliatifs et de confort. La surveillance est basée sur l'évaluation clinique et radiologique de la réponse des métastases au traitement et à la prise en charge de ses effets secondaires.

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[unknown IMAGE 5048768531724]
Tumeurs vésicales - Traitement
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[unknown IMAGE 5048775347468]
Tumeurs vésicales - Traitement
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[unknown IMAGE 5048866049292]
#classification #has-images #python-for-data-science
In a classification problem, the input data is presented to the machine learning model, and the task is to predict the target corresponding to the input data. The target is a categorical variable. So the classification task is to predict the category or label of the target given the input data. For example, the classification problem we discussed before, and illustrated in this image, is to predict the type of weather. The target that the model has to predict is the weather. And the possible values for weather in this case is sunny, windy, rainy, or cloudy. The input data can consist of measurements like temperature, relative humidity, atmospheric pressure, wind speed, wind direction, et cetera. So given specific values for temperature, relative humidity, and all those other measurements, the task for the model is to predict if the weather will be sunny, windy, rainy, or cloudy for the day.

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[unknown IMAGE 5048870505740]
#classification #data-for-classification #has-images #python-for-data-science
This is what the data set might look like for the weather classification problem. Each row is a sample with input variables. Temperature, humidity, and pressure, and target variable, weather. Each row has specific values for the input variables and a corresponding value for the target variable. The classification task is to predict the value of the target variable from the values of the input variables.

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[unknown IMAGE 5048874700044]
#classification #has-images #python-for-data-science #supervised
Since a target is provided, we have label data, and so classification is a supervised task.

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[unknown IMAGE 5048878894348]
#classification #has-images #names-for-target-variable #python-for-data-science
Note that the target variable goes by many names such as target, label, output, class variable, category, and class.

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[unknown IMAGE 5048883350796]
#binary-classification #classification #has-images #multi-class-classification #multi-label-classification #multinomial-classification #python-for-data-science
A classification problem can be binary, or multi-class. With the binary classification, the target variable has two possible values, for example yes and no. With multi-class classification, the target variable has more than two possible values, for example the target can be short, medium, and tall. Multi-class classification is also referred to as multinomial or multi-label classification. Remember, though, the target is always a categorical variable in classification.

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[unknown IMAGE 5048887545100]
#classification #classification-examples #has-images #python-for-data-science
Some examples of binary classification are predicting whether it will rain tomorrow or not. Here, there are only two possible outcomes. Yes, it will rain tomorrow, or no, it will not rain tomorrow. Another example is identifying whether a credit card transaction is legitimate or fraudulent. Again, there are only two possible values for the target, legitimate and fraudulent. Some examples of multi-class classification are predicting what the type of product that a customer will buy. In this case, the possible values for the target variables will be product categories, such as kitchen, electronics, clothes, and things like that. And there are more than one categories of products. So, this is a multi-class classification problem. Another example is categorizing a tweet as having positive, negative, or neutral sentiment. Again, the number of possible values for the target is more than two here, although it’s three. So this is, also a multi-class classification task.

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[unknown IMAGE 5048891739404]
#classification #has-images #python-for-data-science #summary
In summary, in classification, the model has to predict the category corresponding to the input data. Since the target is provided for each sample, classification is a supervised task. The target variable is always categorical in classification.

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[unknown IMAGE 5048903535884]
#building-and-applying-a-classification-model #has-images #machine-learning-model #python-for-data-science
A Machine Learning model is a mathematical model or a parametric function over the inputs. In the general sense, this means that the model has parameters and uses equations to determine the relationship between its inputs and outputs. The parameters are used by the model to modify the inputs to generate the outputs. The model adjusts its parameters in order to correct or refine this input output relationship.

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[unknown IMAGE 5048907730188]
#building-a-model #building-and-applying-a-classification-model #has-images #python-for-data-science
A Machine Learning model works in a very similar way. It maps input values to output values and adjusts its parameters in order to correct or refine this input output mapping. The parameters of a Machine Learning model are adjusted or estimated from the data using a learning algorithm. This, in essence, is what’s involved in building a model. This process is referred to by many terms as model building, model creation, model training and model fitting.

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[unknown IMAGE 5048913759500]
#building-a-classification-model #building-and-applying-a-classification-model #has-images #python-for-data-science
In building a model, we want to adjust the parameters in order to reduce the model’s error. In the case of supervised tasks, such as classification, this means getting the model’s outputs to match the targets, or desired outputs, as much as possible. Since the classification task is to predict the category or class given the input variables, you can think of the classification problem visually as carving up the input space into regions corresponding to different class labels. In this diagram, for example, the classification model needs to form the boundaries to define the regions separating red triangles from blue diamonds from green circles, from yellow squares. In this example, if a sample falls between the region in the upper right corner, it will be classified as a blue diamond. Classification decisions are based on these regions, and the regions are defined by the boundaries, as indicated by the dash lines in this diagram. Thus, these boundaries are referred to as decision boundaries. Building a classification model then means using the data to adjust a model’s parameters in order to form decision boundaries to separate the target classes. Note that the term classifier is often used to mean classification model.

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[unknown IMAGE 5048917953804]
#building-and-applying-a-classification-model #has-images #python-for-data-science #testing-phase #training-phase
In general, building a classification model, as well as other Machine Learning models, involves two phases. The first is the training phase, in which the model is constructed, and its parameters adjusted using what’s referred to as training data. Training data is a data set used to train or create the model. The second is the testing phase. This is where the learned model is applied to new data that is data not used in the training model.

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[unknown IMAGE 5048922148108]
#building-and-applying-a-classification-model #has-images #python-for-data-science #testing-phase #training-phase
In the training phase, the learning algorithm uses the training data to adjust a model’s parameters to minimize errors. At the end of the training phase, you get the train model. In the testing phase, the train model is applied to test data, and test data is separate from the training data. Remember, training data is previously seen by the model and the test data is not previously seen by the model. The model is then evaluated on how it performs on the test data. The goal in building a classifier model is to have the model perform well on training, as well as test data. We will discuss in more detail the use of training and tests when we discuss model evaluation.

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[unknown IMAGE 5048926342412]
#algorithms #building-and-applying-a-classification-model #has-images #python-for-data-science
There are many algorithms to build a classification model, including kNN or k-nearest neighbors, Decision Trees and Naïve Bayes.

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[unknown IMAGE 5048966974732]
#building-and-applying-a-classification-model #has-images #naive-bayes #python-for-data-science
Naïve Bayes model uses a probabilistic approach to classification. Bayes’ Theorem is used to capture the relationships within the input data and the output class. Simply put, the Bayes’ Theorem compares the probability of an event in the presence of another event. Here we see the probability of A if B is present. An example for this is probability of having a fire if the weather is hot. You can imagine event B depending on more than one variable, e.g. weather is hot and windy.

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[unknown IMAGE 5048938663180]
#has-images #python-for-data-science #scikit-learn-machine-learning-in-python
Scikit-learn is an open source library in Python for end to end Machine Learning. It builds upon the strength of NumPy, SciPy, and matplotlib like many other Python libraries. It is being rapidly developed and improved by an active community of developers. For example in May 2017 as we speak, the number of contributors to Scikit-learn was 846.

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[unknown IMAGE 5048942857484]
#has-images #processing-tools #python-for-data-science #scikit-learn-machine-learning-in-python
Scikit-learn supports the whole process by providing utility functions for data transformations, as well as a range of data cleaning and preparation functions that help with many tasks including scaling, normalization, feature engineering, and missing value handling.

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[unknown IMAGE 5048947051788]
#cheat-sheet #has-images #python-for-data-science #scikit-learn-machine-learning-in-python
Scikit-learn also provides built-in functions for many Machine Learning algorithms ready for modeling and analysis. Although it requires some expertise to use these algorithms appropriately for the right tasks, there are many resources online that make the learning curve easier.

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[unknown IMAGE 5048951770380]
#has-images #python-for-data-science #scikit-learn-machine-learning-in-python #tutorials
Additionally the documentation on the website for Scikit-learn includes tutorials to get started. We find those documentation really easy to follow. For example, the clustering part of the documentation nicely overviews the available algorithms, their metrics, scalability, parameters and even potential use cases.

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[unknown IMAGE 5048955964684]
#dimensionality-reduction #has-images #python-for-data-science #scikit-learn-machine-learning-in-python
Scikit-learn also includes specialized implementations for dimensionality reduction algorithms.

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[unknown IMAGE 5048960158988]
#has-images #model-selection #python-for-data-science #scikit-learn-machine-learning-in-python
In Machine Learning we use a number of techniques to evaluate and select the right model. You will find a number of methods to help with this as well.

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[unknown IMAGE 5048964353292]
#has-images #python-for-data-science #scikit-learn-machine-learning-in-python #summary
As a summary, Scikit-learn provides an extensive set of tools for the full Machine Learning process. Thanks to Python we can combine these tools with the rest of the data science tools in Python that we’ve learned up to now. This open and extensible Machine Learning library is vibrantly being developed and documented by a very active community.

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[unknown IMAGE 5048981392652]
#decision-trees #has-images #overview #python-for-data-science
The idea behind decision trees for classification is to split the data into subset, where each subset belongs to only one class. This is accomplished by dividing the input space into pure regions. That is, regions with samples from only one class. With real data, completely pure subsets may not be possible, so the goal is to divide the data into subsets that are as pure as possible. That is, each subset contains as many samples as possible of a single class. Graphically, this is equivalent to dividing the input space into regions that are as pure as possible. Boundaries separating these regions are called decision boundaries, and the decision tree model makes classification decisions based on these decision boundaries.

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[unknown IMAGE 5048985586956]
#decision-trees #has-images #python-for-data-science
A decision tree is a hierarchical structure with nodes and directed edges. The node at the top is called a root node. The nodes at the bottom are called leaf nodes. Nodes that are neither the root node or the leaf nodes are called internal nodes. The root and internal nodes have test conditions. Each leaf node has a class label associated with it. A classification decision is made by traversing the decision tree, starting with the root node. At each node, the answer to the test condition determines which branch to traverse to. When a leaf node is reached, the category at the leaf node determines the classification decision. The depth of a node is the number of edges from the root node to that node. The depth of the root node is zero. The depth of a decision tree is the number of edges in the longest path from the root node to the leaf node. The size of a decision tree is the number of nodes in the tree.

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[unknown IMAGE 5048989781260]
#decision-trees #example #has-images #mammal #python-for-data-science
This is an example of a decision tree, and it can be used to classify an animal as a mammal or not a mammal. According to this decision tree, if an animal is warm-blooded, gives live birth, and has a vertebrae, then it is a mammal. If an animal does not have any of these three characteristics, then it’s not a mammal.

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[unknown IMAGE 5048994237708]
#building #decision-trees #has-images #python-for-data-science
A decision tree is built by starting with all samples at a single node, the root node, and adding additional nodes when the data is split into subsets. At the high level, constructing a decision tree consists of the following steps. Start with all samples at a node. Partition the samples into subsets based on the input variables. Here, the goal is to create subsets of records that are purest. That is, each subset contains as many samples as possible belonging to just one class. Another way to say this is that the subsets should be homogenous, or as pure as possible. Repeatedly partition data into successively pure subsets until stopping criteria are satisfied. And an algorithm for constructing a decision tree model is referred to as induction algorithm, so you may hear the term tree induction used to describe the process of building a decision tree.

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Flashcard 5048998956300

Tags
#307 #Cours #Facultaires #Médecine #Oncologie #Prostate #Tumeur #Urologie
Question

Ce qu'il faut retenir des recommandations AFU 2016–2018 sur la surveillance active :

  • La surveillance active est une option thérapeutique recommandée des cancers de la prostate à [...]

Answer

Faible risque


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span> Ce qu'il faut retenir des recommandations AFU 2016–2018 sur la surveillance active : • la surveillance active est une option thérapeutique recommandée des cancers de la pros- tate à faible risque ; • les critères d'inclusion sont basés sur les données du toucher rectal, le PSA, et les données biopsiques (au moins 12 carottes) ; • une série de biopsies de confirmation est nécessa

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Flashcard 5049000529164

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#307 #Cours #Facultaires #Médecine #Oncologie #Prostate #Tumeur #Urologie
Question

Ce qu'il faut retenir des recommandations AFU 2016–2018 sur la surveillance active :

  • Une série de biopsies de confirmation est nécessaire dans les [...] premiers mois suivant le début de la surveillance active, puis sur un rythme régulier non défini.

Answer

18 premiers mois suivant le début


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les critères d'inclusion sont basés sur les données du toucher rectal, le PSA, et les données biopsiques (au moins 12 carottes) ; • une série de biopsies de confirmation est nécessaire dans les <span>18 premiers mois suivant le début de la SA, puis sur un rythme régulier non défini pour l'instant ; • la sortie de la SA est indiquée par la présence d'un score de Gleason à 7 ou plus sur

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[unknown IMAGE 5049005247756]
#decision-trees #greedy-approach #has-images #python-for-data-science
Note that at each split, the induction algorithm only considers the best way to split the particular portion of the data. This is referred to as a greedy approach. Greedy algorithms solve a subset of the problem at the time, and is a necessary approach when solving the entire problem is not feasible. And by feasible, I mean computable in a reasonable amount of time or space. Using a greedy algorithm is necessary for decision trees. It is not feasible to determine the best tree given a dataset, so the tree has to be built in a piecemeal fashion by determining the best way to split the current node at each step, and combining these decisions together to form a final decision tree.

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Flashcard 5049003674892

Tags
#307 #Cours #Facultaires #Médecine #Oncologie #Prostate #Tumeur #Urologie
Question

Ce qu'il faut retenir des recommandations AFU 2016–2018 sur la surveillance active :

  • La sortie de la surveillance active est indiquée par la présence d'un score de Gleason à [...] ou plus sur les biopsies de contrôle

Answer

Gleason à 7 ou +


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nécessaire dans les 18 premiers mois suivant le début de la SA, puis sur un rythme régulier non défini pour l'instant ; • la sortie de la SA est indiquée par la présence d'un score de Gleason à <span>7 ou plus sur les biopsies de contrôle ; • la surveillance repose sur un TR et un dosage du PSA régulier (au moins une fois par an). La place de l'IRM et le rythme des biopsies à réaliser

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[unknown IMAGE 5049011014924]
#best-split #decision-trees #has-images #python-for-data-science
In this example, the partition shown on the right results in more homogenous subsets, since these subsets contain more samples belonging to a single class than the resulting subsets shown on the left. So the partition on the right results in purer subsets, and is the preferred partition.

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Flashcard 5049014422796

Tags
#307 #Cours #Facultaires #Médecine #Oncologie #Prostate #Tumeur #Urologie
Question

Tumeurs de la prostate - Options thérapeutiques disponibles

Que doit-on réaliser dans les 18 premiers mois suivant le début d'une PEC par surveillance active ?

Answer

Une série de biopsies de confirmation


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recommandée des cancers de la pros- tate à faible risque ; • les critères d'inclusion sont basés sur les données du toucher rectal, le PSA, et les données biopsiques (au moins 12 carottes) ; • <span>une série de biopsies de confirmation est nécessaire dans les 18 premiers mois suivant le début de la SA, puis sur un rythme régulier non défini pour l'instant ; • la sortie de la SA est indiquée par la présence d'un score

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[unknown IMAGE 5049018354956]
#decision-trees #entropy #gini-index #has-images #impurity-measure #misclassification-rate #python-for-data-science
Therefore, we need a way to measure the purity of a split in order to compare different ways to partition a set of data. It turns out that it works better mathematically if you measure the impurity, rather than the purity, of a split. So the impurity measure of a node specifies how mixed the resulting subsets are. Since we want the resulting subsets to have homogenous class labels, not mixed class labels, we want the split that minimizes the impurity measure. A common impurity measure used for determining the best split is called the Gini index. The lower the Gini index, the higher the purity of the split, so the decision tree will select the split that minimizes the Gini index. Besides the Gini index, other impurity measures include entropy, or information gain, and misclassification rate.

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Flashcard 5049020189964

[unknown IMAGE 5048161668364]
Tags
#307 #Cours #Facultaires #Médecine #Oncologie #Prostate #Tumeur #Urologie #has-images
Question
Quelles sont les 5 options de traitement standard d'un cancer de prostate à faible risque ?
Answer

Traitements standard :

  • Surveillance active

  • Prostatectomie totale (si probabilité de survie >10 ans)

  • Curiethérapie

  • Radiothérapie externe

  • Abstention-surveillance (si probabilité de survie <10 ans)


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Risque faible • Traitements standard : surveillance active ; prostatectomie totale (si probabilité de survie >10 ans) ; curiethérapie ; radiothérapie externe ; abstention-surveillance (si probabilité de survie <10 ans) • Traitements en évaluation : US focalisés. • Traitement en cours d'investigation : traitement par photothérapie dynamique ; traitement focal par cryothérapie ; traitement focal par ult

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[unknown IMAGE 5049023597836]
#decision-trees #has-images #python-for-data-science #what-variable-to-split-on
The other factor in determining the best way to partition a node is which variable to split on. The decision tree will test all variables to determine the best way to split the nodes, using a purity measure such as the Gini index to compare the various possibilities.

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[unknown IMAGE 5049030413580]
#decision-trees #has-images #python-for-data-science #splitting-a-node #when-to-stop
Recall that the tree induction algorithm repeatedly splits nodes to get more and more homogenous datasets. So when does this process stop building subsets? When does the algorithm stop growing the tree? There are several criteria that can be used to determine when a node should no longer be split into subsets. The induction algorithm can stop expanding a node when all samples in the node have the same class label. This means that this set of data is as pure as possible, and further splitting will not result in any better partition of the data. And since getting completely pure subsets is difficult to achieve with real data, this stopping criterion can be modified to when a certain percentage of the samples in the node, say 90%, for example, have the same class labels. The algorithm can stop expanding a node when the number of samples in the node falls below a certain minimum value. At this point, the number of samples is too small to make much difference in the classification results with further splitting. The induction algorithm can also stop expanding a node when the improvement in impurity measure is too small to make much of a difference in classification results. Additionally, the tree, or the algorithm, can stop expanding a node when the maximum tree depth is reached. This is to control the complexity of the resulting tree.

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[unknown IMAGE 5049038277900]
#decision-trees #example #has-images #python-for-data-science #split
Let’s say we want to classify loan applicants as being likely to repay a loan, or not likely to repay a loan, based on their income and amount of debt they have. Building a decision tree for this classification problem could proceed as follows. Consider the input space of this problem, as shown in the left figure. One way to split this dataset into a more homogenous subset is to consider the decision boundary where income is t1. To the right of this decision boundary are mostly red samples, and to the left are mostly blue samples. The subsets are not completely homogenous, but that is the best way to split the original dataset based on the variable income. The decision tree boundary is represented in the decision tree by the condition income is greater than t1 at the root node. This is the condition used to split the original dataset. Samples with income greater than the threshold value of t1 are placed in the right subset, and samples with income less than or equal to t1 are placed in the left subset, just as shown in the left diagram. Because the right subset almost perfectly predicts that lenders will repay properly, the right subset is now labeled as red, meaning that the loan applicant is likely to repay the loan. The second step, then, is to determine how to split the region outlined in red. As shown in the left diagram and input space, the best way to split this data is specified by the second decision boundary, with debt equals t2. This is represented in the decision tree on the right with the addition of the node with condition debt greater than t2. Samples with a value for debt greater than t2 are shown in the region around the decision boundary. This region contains all blue samples, and so the corresponding node is labeled blue, meaning that the loan applicant is not likely to repay the loan. The third and final split looks at how to split the region outlined in red in the left diagram. The best split is specified by the boundary with income equals t3. This splits the red region into two pure subsets. The split is represented in the decision tree by adding a node with condition income is greater than t3, and the left resulting node is labeled blue, and the right resulting node is labeled red, corresponding to the resulting subsets with the red border in the left diagram. We end with the final decision tree on the right, which implements the decision boundaries shown as dashed lines in the left diagram. These decision boundaries partition the dataset as shown. The label for each region is determined by the label of the majority of the samples. These labels are reflected in the leaf nodes of the decision tree shown on the right.

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Flashcard 5049042472204

Tags
#307 #Cours #Facultaires #Médecine #Oncologie #Prostate #Tumeur #Urologie
Question

Tumeurs de la prostate - Stratégie thérapeutique

Risque intermédiaire

  • Traitements standard :
    • [...] ± [...] (si probabilité de survie >10 ans)
    • Radiothérapie externe seule ou associée à une suppression androgénique courte (6 mois)
    • Curiethérapie dans les formes de meilleur pronostic (PSA <15, GG2 ou Gleason 3 + 4)
    • Abstention-surveillance (si probabilité de survie <10 ans)

Answer

Prostatectomie totale ± curage (si probabilité de survie >10 ans)


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Risque intermédiaire • Traitements standard : prostatectomie totale ± curage (si probabilité de survie >10 ans) ; radiothérapie externe seule ou associée à une suppression androgénique courte (6 mois) ; curiethérapie dans les formes de meilleur prono

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Flashcard 5049044045068

Tags
#307 #Cours #Facultaires #Médecine #Oncologie #Prostate #Tumeur #Urologie
Question

Tumeurs de la prostate - Stratégie thérapeutique

Risque INTERMÉDIAIRE

  • Traitements standard :
    • Prostatectomie totale ± curage (si probabilité de survie >10 ans)
    • [...] seule ou [...]
    • Curiethérapie dans les formes de meilleur pronostic (PSA <15, GG2 ou Gleason 3 + 4)
    • Abstention-surveillance (si probabilité de survie <10 ans)

Answer

Radiothérapie externe seule ou associée à une suppression androgénique courte (6 mois)


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Risque intermédiaire • Traitements standard : prostatectomie totale ± curage (si probabilité de survie >10 ans) ; radiothérapie externe seule ou associée à une suppression androgénique courte (6 mois) ; curiethérapie dans les formes de meilleur pronostic (PSA <15, GG2 ou Gleason 3 + 4) ; abstention-surveillance (si p

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Flashcard 5049045617932

Tags
#307 #Cours #Facultaires #Médecine #Oncologie #Prostate #Tumeur #Urologie
Question

Tumeurs de la prostate - Stratégie thérapeutique

Risque intermédiaire

  • Traitements standard :
    • Prostatectomie totale ± curage (si probabilité de survie >10 ans)
    • Radiothérapie externe seule ou associée à une suppression androgénique courte (6 mois)
    • [...] dans les formes de meilleur pronostic (PSA <15, GG2 ou Gleason 3 + 4)
    • Abstention-surveillance (si probabilité de survie <10 ans)

Answer

Curiethérapie


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médiaire • Traitements standard : prostatectomie totale ± curage (si probabilité de survie >10 ans) ; radiothérapie externe seule ou associée à une suppression androgénique courte (6 mois) ; <span>curiethérapie dans les formes de meilleur pronostic (PSA <15, GG2 ou Gleason 3 + 4) ; abstention-surveillance (si probabilité de survie <10 ans). • Traitements en évaluation : US focalisés. • T

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Flashcard 5049047452940

Tags
#307 #Cours #Facultaires #Médecine #Oncologie #Prostate #Tumeur #Urologie
Question

Tumeurs de la prostate - Stratégie thérapeutique

Risque intermédiaire

  • Traitements standard :
    • Prostatectomie totale ± curage (si probabilité de survie >10 ans)
    • Radiothérapie externe seule ou associée à une suppression androgénique courte (6 mois)
    • Curiethérapie dans les formes de meilleur pronostic (PSA <15, GG2 ou Gleason 3 + 4)
    • [...] (si probabilité de survie <10 ans)

Answer

Abstention-surveillance


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e >10 ans) ; radiothérapie externe seule ou associée à une suppression androgénique courte (6 mois) ; curiethérapie dans les formes de meilleur pronostic (PSA <15, GG2 ou Gleason 3 + 4) ; <span>abstention-surveillance (si probabilité de survie <10 ans). • Traitements en évaluation : US focalisés. • Traitement en cours d'investigation : cryothérapie <span>

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Flashcard 5049049025804

Tags
#307 #Cours #Facultaires #Médecine #Oncologie #Prostate #Tumeur #Urologie
Question

Tumeurs de la prostate - Stratégie thérapeutique

Risque intermédiaire

  • Traitements standard :
    • Curiethérapie dans les formes de meilleur pronostic :
      • PSA <[...]
      • GG [...] ou Gleason [...]

    • Autres options possibles

Answer

PSA < 15

GG2 ou Gleason 3+4


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age (si probabilité de survie >10 ans) ; radiothérapie externe seule ou associée à une suppression androgénique courte (6 mois) ; curiethérapie dans les formes de meilleur pronostic (PSA <<span>15, GG2 ou Gleason 3 + 4) ; abstention-surveillance (si probabilité de survie <10 ans). • Traitements en évaluation : US focalisés. • Traitement en cours d'investigation : cryothérapie

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[unknown IMAGE 5049053744396]
#decision-boundaries #decision-trees #has-images #python-for-data-science #rectilinear
You may have noticed that the decision boundaries of a decision tree are parallel to the axes formed by the variables. This is referred to as being rectilinear. The boundaries are rectilinear because each split considers only a single variable. There are variants of the tree induction algorithm that consider more than one attribute when splitting a value. However, each split has to consider all combinations of combined variables, and so such induction algorithms are more computationally intensive, or we can also call them more computationally expensive.

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[unknown IMAGE 5049060297996]
#decision-trees #has-images #python-for-data-science
There are a few important things to note about the decision tree classifier. The resulting tree is often simple to understand and interpret, and this is one of the biggest advantages of decision trees for classification. It is often possible to look at the resulting tree to see which variables are important to the classification problem, and understand how the classification is performed. For this reason, many people will start out with a decision tree classifier to get a feel for the classification problem, even if they end up using a more sophisticated model later on. The tree induction algorithm, as described in this lesson, is relatively computationally inexpensive, so training a decision tree for classification can be relatively fast. The greedy approach used by the tree induction algorithm determines the best way to split the proportion of the data at a node, but does not guarantee the best solution overall for the entire dataset. Decision boundaries are rectilinear, and this can limit the expressiveness of the resulting model, which means it may not be able to solve complicated classification problems that require more complex decisions, or decision boundaries, to be formed.

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#live-code-decision-trees #python-for-data-science #sufficient-data
In this notebook we will use scikit learning action to perform a decision tree base classification of metadata. This metadata was curated from sensor data of a weather station located here in San Diego, California and the weather station has sensors that capture weather related measurements such as air temperature, air pressure, and relative humidity. The data was collected from a period of three years. So it has longitudinal information from September 2011 to September 2014 and this ensures also that sufficient data for different seasons and weather conditions are captured.

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[unknown IMAGE 5049082318092]
#good-practice #has-images #import-libraries #live-code-decision-trees #python-for-data-science
But it’s also a good practice to have them all listed on top of the notebook so you’ll often seem them like this in practice. This ensures that the users of your notebook understand what you’ll be using when they open the notebook.

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[unknown IMAGE 5049087560972]
#data-cleaning-steps #has-images #live-code-decision-trees #python-for-data-science
And now we can look at the null values in it if there are any null values. We see that there are some NaNs in this data set so we see some rows with null values. So let’s clean this DataFrame a little bit to get it ready for analysis.

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[unknown IMAGE 5049093852428]
#convert-to-a-classification-task #has-images #live-code-decision-trees #python-for-data-science
We will use a classifier to predict humidity on a given afternoon by looking at the weather in the morning. So it gives us the ability to predict weather in the afternoon just by looking at the morning weather. It’s useful in some contexts. And remember we use the dropna function to generate a slice of the data and assign that to the DataFrame instead. Now we’ll copy the slice into a new DataFrame that is not a slice. It’s a real DataFrame or what we would call, the data is what we would call a view over the original data set, the one that we assign it we’ll call this clean data will be real DataFrame again. And after this step we will add clean data in new column called High Humidity Label. This new column will store one for humidity values higher than, as you see here, 24.99. And we, if we look at the relative humidity at 3 pm if it’s higher than 24.99 it’s going to give us a true/false value. We multiply this true/false value generated by that comparison greater than operator. We’ll multiply that by one, the true/false value by one to turn the column into integer values, zero or one. And when we actually print that column we see that we have ones and zeroes. So to summarize what we did here we created a new variable that’s zero or one, that’s our target variable. And we call this target variable the High Humidity Label. So we labeled our target variable as High Humidity. So if it’s one we know that value is high humidity or above 24.99 and if it’s zero we know it’s below that.

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Flashcard 5049096998156

Tags
#307 #Cours #Facultaires #Médecine #Oncologie #Prostate #Tumeur #Urologie
Question
De façon consensuelle en France, il est proposé à partir de [...] ng/ml et jusqu'à [...] ng/ml d'utiliser la densité du PSA pour savoir si un avis urologique et/ou des biopsies sont indiquées.
Answer

2,5 ng/ml et jusqu'à 10 ng/ml


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De façon consensuelle en France, il est proposé à partir de 2,5 ng/ml et jusqu'à 10 ng/ml d'uti- liser la densité du PSA pour savoir si un avis urologique et/ou des biopsies sont indiquées (cf infra). Par ailleurs compte tenu des variations parfois

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Flashcard 5049098571020

Tags
#307 #Cours #Facultaires #Médecine #Oncologie #Prostate #Tumeur #Urologie
Question
En cas d'infection urinaire de l'homme, le taux de PSA peut rester élevé plusieurs [...]
Answer

plusieurs mois


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ins une fois le dosage sérique du PSA par un second prélèvement, en général après un délai d'au moins un mois. En cas d'infection urinaire de l'homme, le taux de PSA peut rester élevé plusieurs <span>mois <span>

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Flashcard 5049100143884

Tags
#307 #Cours #Facultaires #Médecine #Oncologie #Prostate #Tumeur #Urologie
Question
Il est de bonne pratique de toujours confirmer au moins une fois le dosage sérique du PSA par un second prélèvement, en général après un délai d'au moins [...].
Answer

Confirmer après un délai d'au moins 1 mois


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tions parfois significatives du dosage, il est de bonne pratique de toujours confirmer au moins une fois le dosage sérique du PSA par un second prélèvement, en général après un délai d'au moins <span>un mois. En cas d'infection urinaire de l'homme, le taux de PSA peut rester élevé plusieurs mois <span>

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[unknown IMAGE 5049105648908]
#has-images #live-code-decision-trees #python-for-data-science #target-is-stored-in-y
Going with the parametric function analogy, y = f(x) we will now create a new DataFrame called y for what we are trying to predict. So by looking at x we’ll try to predict y, that’s the analogy. And we will do this by storing our High Humidity Label column into y. So now we are storing the High Humidity Label in our clean data into y. Let’s uncomment y here to see what’s stored in it. It shouldn’t be a surprise that it stores that High Humidity Labels from the clean data. So now we have our labels stored in y. I’m just going to for cleanness sake uncomment y and move on. So we can also print out the first five rows of y and clean data to compare the humidity values with the High Humidity Labels and verify them.

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[unknown IMAGE 5049111678220]
#feature-selection #has-images #live-code-decision-trees #python-for-data-science
Remember that we are using the morning data to come up with a predictor for the afternoon and we will load all these morning 9 am variables or features into a list called Morning Features. So here let’s run this one, Morning Features, air pressure at 9 am, air temperature at 9 am, all of this is stored in a list called Morning Features. After we run this we will create a matrix or a DataFrame in this case with only these morning features as columns. We will literally copy the values in those morning-related columns into a DataFrame called x. Remember again we are trying to do y = fx. So that’s why we call the labels y and the input we will be using to train x. So given the x we’ll try to come up with the y values. That’s what we are trying to do. Here the values in clean data are now in x are pretty standard data types. However, if they were lists or other more complex data types we might have had to use a deep copy. In that case we would have said inside those parentheses in the copy deep = true for the copy function that will ensure if you have any complicated data types like arrays or lists in your input matrix they’ll be copied over to x in this situation. Now let’s double check the columns for x and y. So we can say x.columns. We see that everything we selected within those morning features are columns of x and y will have a label, high humidity label, as the column index.

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Prise en charge immédiate préhospitalière et à l'arrivée à l'hôpital, évaluation des complications chez : un polytraumatisé, un traumatisé abdominal
#329 #Cours #Facultaires #Médecine #Polytraumatisme #Urologie
Polytraumatisme Association de plusieurs lésions traumatiques dont au moins une met en jeu le pronostic vital. Tout patient ayant subi un traumatisme violent, à haute cinétique est un polytraumatisé jusqu'à preuve du contraire

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Prise en charge immédiate préhospitalière et à l'arrivée à l'hôpital, évaluation des complications chez : un polytraumatisé, un traumatisé abdominal
#329 #Cours #Facultaires #Médecine #Polytraumatisme #Urologie
La mortalité du polytraumatisé augmente avec l'âge. Un patient sur 2 décédera sur les lieux de l'accident ou pendant le transport vers un milieu hospitalier.

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Prise en charge immédiate préhospitalière et à l'arrivée à l'hôpital, évaluation des complications chez : un polytraumatisé, un traumatisé abdominal
#329 #Cours #Facultaires #Médecine #Polytraumatisme #Urologie
La prise en charge associera ensuite aux manœuvres de réanimation la prévention de l'aggra- vation des lésions éventuelles, parfois non discernables à ce stade. On associera ainsi : • équipement du patient : 2 voies veineuses périphériques de bon calibre, oxygène à haut débit/intubation orotrachéale, scope, immobilisation du rachis ou d'une éventuelle fracture (collier cervical, matelas coquille, attelle), pansement compressif si plaie hémorragique, réchauffement ; • remplissage vasculaire : restauration de la volémie ± amines vassopressives pour PAM ≥ 65 mmHg ; • traitement symptomatique : antalgiques ++ (palier III)

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Prise en charge immédiate préhospitalière et à l'arrivée à l'hôpital, évaluation des complications chez : un polytraumatisé, un traumatisé abdominal
#329 #Cours #Facultaires #Médecine #Polytraumatisme #Urologie

Stabilisé ?

NON : indication chirurgicale en urgence : laparotomie d'hémostase

• Après une évaluation minimale réalisée idéalement au bloc opératoire et sans retarder la prise en charge du patient :

– radiographie thoracique : indication de drainage/thoracotomie d'hémostase ?

– radiographie du bassin : contre-indication exploration chirurgicale = indication d'artériographie d'emblée, contre-indication au sondage urétral ?

– FAST échographie (Focused Assessement with Sonography for Trauma) : recherche épanchement intra-abdominal, péricardique ou pleural.

• Poursuite conjointe des manœuvres de réanimation +++ (accès veineux, remplissage vasculaire, transfusion de produits sanguins labiles).

• Laparotomie médiane xiphopubienne.

• Exploration quadrant par quadrant en débutant par l'hypochondre droit, tamponnement du quadrant exploré avant de poursuivre l'exploration.

• Stratégie de chirurgie écourtée ou « damage control », lutte contre la coagulopathie (triade hypothermie-acidose-consommation des facteurs de coagulation)

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[unknown IMAGE 5049121901836]
Prise en charge immédiate préhospitalière et à l'arrivée à l'hôpital, évaluation des complications chez : un polytraumatisé, un traumatisé abdominal
#329 #Cours #Facultaires #Médecine #Polytraumatisme #Urologie #has-images

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Prise en charge immédiate préhospitalière et à l'arrivée à l'hôpital, évaluation des complications chez : un polytraumatisé, un traumatisé abdominal
#329 #Cours #Facultaires #Médecine #Polytraumatisme #Urologie
Message 1 Les traumatismes urologiques isolés sont exceptionnellement responsables d'une instabilité hémodyna- mique persistante (rôle de « tamponnement » du saignement par l'espace rétropéritonéal qui n'est pas exten- sible) par opposition aux lésions d'organes intrapéritonéaux (foie, rate ++) qui sont à rechercher en priorité. Message 2 En cas d'origine du saignement identifiée au niveau d'un organe intrapéritonéal ne pas ouvrir le rétro- péritoine : risque de redéclencher un saignement jusque-là contrôlé et d'aboutir à une néphrectomie qui aurait pu être évitée

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Prise en charge immédiate préhospitalière et à l'arrivée à l'hôpital, évaluation des complications chez : un polytraumatisé, un traumatisé abdominal
#329 #Cours #Facultaires #Médecine #Polytraumatisme #Urologie

Stabilisé ?

OUI : priorité au bilan lésionnel Celui-ci sera réalisé le plus rapidement possible en parallèle des mesures de réanimation qui seront poursuivies (mise en condition du patient, remplissage vasculaire ± transfusion en pro- duits sanguins labiles)

• paraclinique :

  • biologique : bandelette urinaire, Hemocue®, gaz du sang-lactates, NFS, plaquettes, ionogramme-créatininémie, bilan de coagulation complet (TP, TCA, fibrinogène), bilan prétransfusionnel (groupage, RAI), troponine, bilan hépatique, CPK, lipase,
  • imagerie :
    • – FAST échographie,
    • – radiographie pulmonaire : indication de drainage thoracique/thoracotomie ?
    • – radiographie du bassin : contre-indication au sondage urétral/exploration chirurgicale ?
    • – scanner corps entier sans puis avec injection de produit de contraste iodé,
    • – artériographie diagnostique et thérapeutique : exceptionnellement réalisée en première intention, largement supplantée par le scanner corps entier qui permet de mettre en évidence le saignement actif et d'éviter une artériographie « blanche ».

La prise en charge ultérieure dépendra des lésions mises en évidence.

Ne pas oublier la vérification du statut vaccinal (VAT) du patient en cas de plaie +++

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Traumatismes du Rein
#329 #Cours #Facultaires #Médecine #Polytraumatisme #Urologie
Message Le traitement conservateur des traumatismes fermés du rein est la règle.

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Traumatismes du Rein
#329 #Cours #Facultaires #Médecine #Polytraumatisme #Urologie
– uroscanner +++ = scanner sans puis avec injection de produit de contraste iodé avec temps artériel, portal et temps tardif urinaire (recherche extravasation urinaire) ; – Indiqué systématiquement en cas : – d'hématurie macroscopique, – d'accident à haute cinétique : décélération avec risque de lésion pédiculaire et absence d'hématurie macroscopique du fait d'un rein non sécrétant, – de traumatisme pénétrant. – Ne pas oublier la recherche de lésions associées par scanner corps entier.

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Traumatismes du Rein
#329 #Cours #Facultaires #Médecine #Polytraumatisme #Urologie
Classification La classification la plus utilisée est celle de l'AAST (American Association for Surgery of Trauma), en 5 grades (encadré 19.1). Elle est définie à partir de l'uroscanner (fig. 19.2). Les traumatismes de haut grade correspondent aux grades 4 et 5. Cette classification a montré un intérêt pronostic : morbidité, mortalité, risque de néphrectomie

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Traumatismes du Rein
#329 #Cours #Facultaires #Médecine #Polytraumatisme #Urologie
± radiologie interventionnelle : artériographie et embolisation artérielle sélective en cas d'extravasation de produit de contraste iodé au temps artériel sur l'uroscanner (saignement actif), recanalisation avec angioplastie + stent en cas de dissection artérielle (grade 5) si réalisable dans les 6 heures suivant le traumatisme ;

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Traumatismes du Rein
#329 #Cours #Facultaires #Médecine #Polytraumatisme #Urologie
exploration chirurgicale et néphrectomie (fig. 19.3) : exceptionnellement motivée par une instabilité hémodynamique. En général rendue nécessaire par l'évolution défavorable (septique) d'un rein détruit laissé en place ou d'un urohématome important (surinfection, syndrome du compartiment abdominal)

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Traumatismes du Rein
#329 #Cours #Facultaires #Médecine #Polytraumatisme #Urologie

Complications

• À moyen terme : formation de fistule artérioveineuse ou pseudo-anévrisme avec risque de resaignement (imagerie de contrôle systématique des traumatismes de haut grade). Traitement = embolisation sélective. Collections (abcès, urinome). Traitement = drainage percutané ou endoscopique. • À long terme : HTA rénovasculaire

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Traumatismes de Vessie
#329 #Cours #Facultaires #Médecine #Polytraumatisme #Urologie
Message La prise en charge des traumatismes de vessie dépend du site de la perforation (intra- versus extra-péritonéale)

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Traumatismes de Vessie
#329 #Cours #Facultaires #Médecine #Polytraumatisme #Urologie
Mécanismes • Traumatisme du bassin +++ (70–97 % cas). • Deux sites de rupture possibles : – dôme vésical (vessie pleine dépassant la symphyse pubienne, rupture par augmentation brutale de la pression intravésicale) = perforation intrapéritonéale ; – espace sous-(extra)-péritonéal (esquille osseuse ++).

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Traumatismes de Vessie
#329 #Cours #Facultaires #Médecine #Polytraumatisme #Urologie
• Imagerie : urétrocystographie rétrograde +++ (opacification de l'urètre et de la vessie par une sonde positionnée juste en arrière du méat urétral, remplissage 350 ml minimum). Possibilité d'opacification lors du scanner corps entier (cystoscanner) : – confirmation du diagnostic ; – localisation de la brèche (intrapéritonéale parfois difficile à visualiser du fait de la dilu- tion du produit de contraste dans la cavité péritonéale, sous-péritonéale) ; – recherche d'une lésion de l'urètre associée (10–30 %).

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Traumatismes de Vessie
#329 #Cours #Facultaires #Médecine #Polytraumatisme #Urologie
Prise en charge Elle dépend du site de la perforation : • intrapéritonéale : prise en charge chirurgicale en urgence, fermeture de la brèche vésicale, sondage vésical 7–10 j ; • sous-péritonéale : traitement conservateur, sondage vésical prolongé (10 j), contrôle cysto- graphie avant ablation de la sonde

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[unknown IMAGE 5049150737676]
Traumatismes du Rein
#329 #Cours #Facultaires #Médecine #Polytraumatisme #Urologie #has-images

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[unknown IMAGE 5049157553420]
Traumatismes du Rein
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Traumatismes de l'Urètre
#329 #Cours #Facultaires #Médecine #Polytraumatisme #Urologie
Message 1 Tout traumatisme du bassin doit faire suspecter un traumatisme de l'urètre = contre-indication au son- dage urétral. Message 2 Complications principales des traumatismes de l'urètre = à long terme : pronostic fonctionnel ++ (conti- nence, fonction érectile)

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Traumatismes de l'Urètre
#329 #Cours #Facultaires #Médecine #Polytraumatisme #Urologie
Mécanismes • Lésions de l'urètre antérieur : traumatisme iatrogène ou direct (corps étranger, lésion péné- trante…), chute à califourchon, faux pas du coït. • Lésions de l'urètre postérieur : traumatisme du bassin +++ (disjonction symphyse pubienne ++)

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Traumatismes de l'Urètre
#329 #Cours #Facultaires #Médecine #Polytraumatisme #Urologie
Examen clinique Triade caractéristique • urétrorragie ; • globe vésical/impossibilité à uriner ; • hématome périnéal en ailes de papillon (fig. 19.4).

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Traumatismes de l'Urètre
#329 #Cours #Facultaires #Médecine #Polytraumatisme #Urologie
Examen paraclinique • Biologie : non spécifique, bilan du polytraumatisme. • Imagerie : urétrocystographie rétrograde (sonde introduite juste en arrière du méat urétral) ± antégrade si lésion complète (cathéter sus-pubien) – confirme le diagnostic ; – classification de la gravité des lésions : lésion partielle (opacification vésicale en amont) ou complète ; – recherche une lésion vésicale associée.

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Traumatismes de l'Urètre
#329 #Cours #Facultaires #Médecine #Polytraumatisme #Urologie
Prise en charge Contre-indication au sondage urétral : risque d'aggravation d'une lésion incomplète, saigne- ment incoercible… • En urgence : – mise en place d'un cathéter sus-pubien : drainage des urines en urgence ; – prise en charge du traumatisme du bassin (immobilisation/clamp ou fixateur externe, artériographie-embolisation si saignement) : le pronostic vital dépend de la prise en charge du traumatisme du bassin ! • À distance : – réalignement endoscopique précoce de l'urètre (lésion partielle) ou réparation chirurgi- cale (lésion complète, souvent différée > 3 mois).

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Traumatismes de l'Urètre
#329 #Cours #Facultaires #Médecine #Polytraumatisme #Urologie
Complications • Précoces : infection, saignement, insuffisance rénale aiguë si diagnostic tardif. • À moyen et long terme : sténose urétrale récidivante +++, incontinence urinaire, dysfonc- tion érectile ++ (lésion des nerfs de l'érection dilacérés par l'hématome pelvien)

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[unknown IMAGE 5049180097804]
Traumatismes de l'Urètre
#329 #Cours #Facultaires #Médecine #Polytraumatisme #Urologie #has-images

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Traumatismes des OGE
#329 #Cours #Facultaires #Médecine #Polytraumatisme #Urologie
Message Tout hématome scrotal hyperalgique ou aspect échographique de rupture de l'albuginée doit motiver une exploration scrotale en urgence

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Traumatismes des OGE
#329 #Cours #Facultaires #Médecine #Polytraumatisme #Urologie
• Hématocèle volumineuse (hématome intravaginal extratesticulaire >3 fois volume du testicule normal controlatéral). • Rupture de l'albuginée avec issue de pulpe testiculaire

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Traumatismes des OGE
#329 #Cours #Facultaires #Médecine #Polytraumatisme #Urologie
Prise en charge • Exploration chirurgicale en urgence en cas d'hématocèle volumineuse, de rupture de l'al- buginée ou de scrotum hyperalgique inexaminable : évacuation de l'hématome, exérèse de la pulpe nécrosée, fermeture de l'albuginée (fig. 19.5). • Repositionnement du testicule et orchidopexie en cas de luxation testiculaire. • Traitement conservateur en cas d'hématome des tuniques scrotales

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[unknown IMAGE 5049197137164]
Traumatismes des OGE
#329 #Cours #Facultaires #Médecine #Polytraumatisme #Urologie #has-images

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Polytrumatisé Urologie
#329 #Cours #Facultaires #Médecine #Polytraumatisme #Urologie
À ne pas faire ❯ Traumatisme du bassin : contre-indication exploration chirurgicale. ❯ Pas d'ouverture du rétropéritoine lors d'une laparotomie d'hémostase. ❯ Traumatisme de l'urètre : contre-indication sondage urétral

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Rétention aiguë d'urine
#342 #Aigue #Cours #Facultaires #Médecine #RAU #Retention #Urine #Urologie
Pour comprendre La rétention aiguë d'urine est l'impossibilité totale et brutale d'uriner malgré la réplétion vésicale. Elle s'accompagne d'une envie pressante et douloureuse d'uriner

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Rétention aiguë d'urine
#342 #Aigue #Cours #Facultaires #Médecine #RAU #Retention #Urine #Urologie
La rétention aiguë d'urine est une pathologie essentiellement masculine en dehors du contexte de vessie neurologique

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Rétention aiguë d'urine
#342 #Aigue #Cours #Facultaires #Médecine #RAU #Retention #Urine #Urologie
La rétention aiguë d'urine peut donc résulter : • d'un obstacle sous-vésical (le plus souvent) ; • d'une altération de la commande neurologique ; • plus rarement d'un défaut de contraction vésicale

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Rétention aiguë d'urine
#342 #Aigue #Cours #Facultaires #Médecine #RAU #Retention #Urine #Urologie
Antécédents neurologiques à rechercher • Lésion médullaire. • Sclérose en plaques. • Spina-bifida. • Maladie de Parkinson. • Neuropathie diabétique. • Accident vasculaire cérébral

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Rétention aiguë d'urine
#342 #Aigue #Cours #Facultaires #Médecine #RAU #Retention #Urine #Urologie
• Cas particuliers : parfois, la symptomatologie peut être plus fruste rendant le diagnostic plus difficile chez les patients suivants : – les personnes âgées : confusion, désorientation temporospatiale, agitation, anxiété, dyspnée. Il faut systématiquement rechercher un fécalome lors du toucher rectal ; – les patients diabétiques : hypoesthésie vésicale avec rétention indolore ; – les patients blessés médullaires ou sous anesthésie : rétention urinaire indolore

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Rétention aiguë d'urine
#342 #Aigue #Cours #Facultaires #Médecine #RAU #Retention #Urine #Urologie
• Diagnostique différentiel : l'anurie. Elle correspond à une absence de sécrétion d'urine par les reins. La vessie est alors vide. Cliniquement, il n'y a pas de globe vésical, pas d'envie d'uriner, pas de douleur pelvienne associée. Une insuffisance rénale aiguë y est associée

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Rétention aiguë d'urine
#342 #Aigue #Cours #Facultaires #Médecine #RAU #Retention #Urine #Urologie
Avant drainage • Aucun examen complémentaire n'est requis en urgence avant le sondage urétral : la douleur impose un drainage rapide

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Rétention aiguë d'urine
#342 #Aigue #Cours #Facultaires #Médecine #RAU #Retention #Urine #Urologie
Après drainage • Examen cytobactériologique des urines (ECBU) systématique. • Créatinémie, ionogramme sanguin. • Échographie du haut appareil en cas de fièvre ou d'insuffisance rénale aiguë, afin de recher- cher une dilatation urétéro-pyélocalicielle ou de signes de pyélonéphrite. Si l'on retrouve une dilatation des cavités pyélocalicielles au moment de la rétention aiguë d'urine, il faudra s'assurer de la disparition de cette dilatation sur une échographie ultérieure. La persistance de la dilatation signe le caractère chronique de la rétention et doit inciter à une prudence particulière sur le risque de syndrome de levée d'obstacle (cf. infra). • Jamais de dosage de PSA dans ce contexte (fausse élévation)

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Rétention aiguë d'urine
#342 #Aigue #Cours #Facultaires #Médecine #RAU #Retention #Urine #Urologie

Après drainage, systématiquement :

• relever le volume contenu dans la vessie au moment de la rétention (meilleur pronostic si inférieur à 600 ml) ; • surveiller la diurèse horaire ; • prévenir le syndrome de levée d'obstacle, et l'hématurie a vacuo

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Rétention aiguë d'urine
#342 #Aigue #Cours #Facultaires #Médecine #RAU #Retention #Urine #Urologie

• Modalités de mise en place d'une sonde urinaire :

– sonder dans des strictes conditions d'asepsie et de stérilité ; – utiliser du gel lubrifiant en seringue ; – maintenir un système clos : interdiction de déconnecter la sonde vésicale du système de drainage ; – utiliser des sondes à double courant si une irrigation est nécessaire (en cas d'hématurie macroscopique) ; – instaurer un drainage vésical déclive en permanence pour éviter toute stase urinaire ; – prélever de manière rigoureusement aseptique les urines pour les examens cytobactériologiques ; – éviter les sondes de petit calibre en première intention, (utiliser une Charrière 18–20 chez les hommes susceptibles d'avoir une HBP) ; – utiliser de l'eau pour préparation injectable pour gonfler le ballonnet de la sonde uri- naire. Ne pas utiliser de sérum physiologique pour gonfler le ballonnet : le chlorure de sodium peut cristalliser et empêcher le dégonflage du ballonnet par la suite ; ballon gonflé à 8–10 ml habituellement ; – toujours recalotter le malade en fin de geste (risque de paraphimosis)

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Rétention aiguë d'urine
#342 #Aigue #Cours #Facultaires #Médecine #RAU #Retention #Urine #Urologie
• Contre-indications du sondage vésical : – sténose urétrale ; – traumatisme de l'urètre, notamment en cas de polytraumatisme (fracture du bassin associée à une urétrorragie) ; – prostatite aiguë (contre-indication relative, possibilité de sondage si le patient est apy- rétique et après mise en route d'une antibiothérapie) ; – présence d'un sphincter urinaire artificiel (nécessité de désactivation du système préalablement)

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Rétention aiguë d'urine
#342 #Aigue #Cours #Facultaires #Médecine #RAU #Retention #Urine #Urologie #has-images

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Rétention aiguë d'urine
#342 #Aigue #Cours #Facultaires #Médecine #RAU #Retention #Urine #Urologie
• Modalités de mise en place d'un cathéter sus-pubien : – indication en cas d'échec ou de contre-indication au sondage vésical ; – toujours s'assurer de l'existence d'un globe vésical avant de mettre en place un cathéter sus-pubien. En l'absence de globe, il y a un risque élevé de perforation d'une anse intestinale ; – c'est un acte médical ; – informer le patient, lui expliquer le principe du soin et son utilité, le rassurer ; – strictes conditions d'asepsie et de stérilité, désinfection de la zone de ponction en quatre temps ; – repérage du point de ponction qui est situé à l'intersection de deux lignes : la ligne médiane de l'abdomen et la ligne horizontale située à 2 travers de doigts au-dessus de la symphyse pubienne ; – sous anesthésie locale (lidocaïne 1 %) ; – incision cutanée ; – introduction du trocart dans le globe vésical ; – mise en place du cathéter sus-pubien dans la vessie par la lumière du trocart ; – ablation du trocart et fixation du cathéter à la peau

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Rétention aiguë d'urine
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• Contre-indications du cathéter sus-pubien : – absence de globe vésical (contre-indication absolue) ; – pontage vasculaire extra-anatomique en région sus-pubienne (fémoro-fémoral croisé) (contre-indication absolue) ; – antécédents de cancer de la vessie (risque d'essaimage du cancer dans la paroi) ; – hématurie macroscopique (risque de cancer de vessie méconnu et risque d'obstruction du cathéter par des caillots) ; – troubles de l'hémostase, patients sous anticoagulant ; – cicatrices de laparotomie (contre-indication relative, il faut s'assurer avec une écho- graphie qu'il n'y ait pas d'anse digestive intercalée entre la vessie et la paroi)

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Rétention aiguë d'urine
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Épreuve d'ablation de sonde Quelques jours après l'épisode de rétention, sera organisée une épreuve d'ablation de sonde vésicale (ou de clampage de cathéter), sous réserve que la cause ait été diagnostiquée et traitée. Pour majorer les chances de reprise des mictions chez l'homme, un traitement alpha- bloquant sera mis en place, et ce d'autant plus qu'une hypertrophie prostatique est impliquée dans le mécanisme de la rétention. Lors de cette épreuve d'ablation de sonde, une mesure du résidu post-mictionnel sera réalisée, et un avis spécialisé sera habituellement demandé

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Rétention aiguë d'urine
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Hypertrophie bénigne de la prostate L'incidence annuelle de la rétention aiguë d'urine dans les populations de patients présentant une HBP symptomatique a été évaluée entre 0,4 et 6 %. L'âge et la sévérité des symptômes (IPSS >7) apparaissent comme des facteurs augmentant le risque de rétention aiguë d'urine. L'ablation de la sonde peut être tentée après 48 heures de traitement par alpha-bloquant (si le patient n'était pas déjà traité). En l'absence de facteur de risque lors de l'épisode de rétention, le risque de récidive est aux alentours de 50 %. Une intervention chirurgicale sera discutée d'emblée en cas d'HBP compliquée ou sévère ou en cas d'échec de désondage

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Rétention aiguë d'urine
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Cancer de la prostate Le cancer de la prostate ne donne des rétentions qu'en cas de pathologie localement avancée (stades T3 ou T4). Le toucher rectal révèle alors une prostate « pierreuse » et une infiltration locale voire un blindage pelvien

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Rétention aiguë d'urine
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Anticholinergiques De nombreuses spécialités pharmaceutiques ont des effets anticholinergiques directs ou secondaires : • collyre mydriatique : atropine (Atropine ® ), cyclopentolate (Skiacol ® ), topicamide (Mydriaticum ® )… • anticholinergiques utilisés en urologie pour traiter l'instabilité vésicale : oxybutinine (Ditropan ® , Driptane ® ), toltérodine (Détrusitol ® ), trospium (Céris ® ) ; • neuroleptiques en particulier les phénothiazines : halopéridol (Haldol ® ), zuclopenthixol (Clopixol ® ), chlorpromazine (Largactil ® )… • antidépresseurs tricycliques imipraminiques (première génération) ; • certains antiparkinsoniens : bipéridène (Akineton ® ), trihexyphénidyle (Artane ® ), tropaté- pine (Lepticur ® ) ; • antalgiques d'usage courant : néfopam (Acupan ® ), tiémonium (Viscéralgine ® ) ; • bronchodilatateurs bêtamimétiques à action secondaire anticholinergique (Atrovent ® , Tergistat ® ) ou associés à un anticholinergique (Bronchodual ® , Combivent ® ) ; • antihistaminiques utilisés comme antitussifs (Hexpneumine ® , Toplexil ® , Rhinathiol ® …), comme sédatifs (hydroxyzine : Atarax ® , Théralène ® ), comme antiallergiques (Polaramine ® , Allergefon ® ) ou encore dans la prévention du mal des transports (Dramamine ® , Mercalm ® , Nautamine ® , Scopoderm ® ). Ces produits exposent à un risque élevé de rétention surtout si on les prescrit chez un patient ayant déjà une rétention chronique avec un résidu post-mictionnel supérieur à 100 ml

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Rétention aiguë d'urine
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Causes de RAU

Autres traitements (moins fréquents) • Les sympathomimétiques : phénylpropanolamine, pseudo-éphédrine, phényléphrine, éphédrine (vasoconstricteurs nasaux). • Les bêta-2-mimétiques : salbutamol, terbutaline. • Les inhibiteurs calciques

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Rétention aiguë d'urine
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Sténose de l'urètre • L'étiologie des sténoses de l'urètre peut être : – post-traumatique ; – iatrogène (compliquant un sondage urétral traumatique ou une chirurgie endoscopique urologique) ; – post-infectieuse (urétrite sur IST). • La dérivation des urines doit se faire par cathéter sus-pubien. Le sondage urétral risque d'aggraver les lésions. • Le bilan lésionnel devra comporter une urétrocystographie rétrograde et permictionnelle (UCRM) permettant de déterminer la localisation et la longueur de la lésion

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Rétention aiguë d'urine
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L'insuffisance rénale régresse rapidement après drainage vésical. La dilatation des cavités pyé- localicielles peut persister pendant quelques semaines

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Rétention aiguë d'urine
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Syndrome de levée d'obstacle (SLO) Le syndrome de levée d'obstacle peut survenir après dérivation des urines. Il est favorisé par une insuffisance rénale aiguë obstructive due à la rétention aiguë d'urine. Du fait de l'augmen- tation de pression dans les cavités rénales, les reins vont surcompenser afin de maintenir une diurèse. Après dérivation des urines cette surcompensation va persister quelque temps indui- sant une polyurie avec risque de déshydratation. La diurèse doit donc être surveillée toutes les heures après dérivation des urines. La polyurie peut parfois être majeure avec un volume supérieur à un litre par heure, la déshydratation consécutive peut engager le pronostic vital du patient. Une réhydratation parentérale en adaptant les entrées aux sorties doit être mise en place en cas de polyurie liée à un SLO

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Rétention aiguë d'urine
#342 #Aigue #Cours #Facultaires #Médecine #RAU #Retention #Urine #Urologie
Vessie claquée La distension détrusorienne peut aboutir à un claquage musculaire du détrusor : la vessie perd alors ses capacités contractiles. C'est la raison pour laquelle il peut être nécessaire d'attendre quelques jours à quelques semaines avant de tenter d'enlever une sonde à demeure. Les altérations de la paroi vésicale peuvent aboutir au développement de diverticules vésicaux. Ces altérations peuvent favoriser des récidives de rétention aiguë d'urine ou le développement de rétention chronique d'urine

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[unknown IMAGE 5049271323916]
#has-images #live-code-decision-trees #python-for-data-science #split
Now we will start building a model, our first model, a classification model using Decision Trees. To do that we will split the data set into tests and training samples. So just as a reminder, we’ll need to use, and if you look at this figure here from our slides before, we’ll need to use some part of our data for training and that’s the training data and we’ll use the rest for testing. To do this, to be able to do this we use train test split function to generate these two data sets. Now these two data sets will be slices of our original data set stored in x and labels stored in y. Let’s discuss a little bit the arguments here. We have the train test split, we give it the x, our input, and y, the labels for training. So in addition to these two we provide a value for how much of the data we want to test with called the test size. So we are telling this function store 33% of the data, keep it, don’t show it to the trainer because we’ll use it for testing later. We also have the random state seed here set as 324 in this notebook. Although the seed is changeable it will lead to different partitioning of the original data set and later leading to different prediction accuracy. So I strongly recommend that you keep it as it is if you like to follow along and you can later on maybe test with different seeds.

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Insuffisance rénale aiguë
#343 #Aigue #Cours #Facultaires #IRA #Insuffisance #Médecine #Renale #Urologie
Les valeurs normales de la créatininémie sont situées : • entre 60 et 107 μmol/l chez la femme ; • entre 80 et 115 μmol/l chez l'homme

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Insuffisance rénale aiguë
#343 #Aigue #Cours #Facultaires #IRA #Insuffisance #Médecine #Renale #Urologie
L'IRA est liée à une altération brusque des capacités d'excrétion du rein entraînant une réten- tion azotée et de nombreux troubles hydroélectrolytiques. Elle peut être anurique ou à diurèse conservée (diurèse > 500 ml/24 h). Les signes révélateurs d'IRA sont d'apparition plus tardive : nausées, vomissements, céphalées, diarrhées et troubles visuels

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[unknown IMAGE 5049280761100]
#fit-on-train-set #has-images #live-code-decision-trees #python-for-data-science
Now let’s use a decision tree classifier to train on the training data set and I will name this training data set, our decision tree in that sense, a humidity classifier. Here we are. We are trying to fit on the training data set now. We have the humidity classifier and to the decision tree classifier we will set max leaf nodes as 10. So this is our stopping criteria for the tree induction. If you left it as default it would have been unlimited, making it potential over fit the tree to the training data. We don’t want that but in general you need to experiment with it a little bit. And the random state argument in this algorithm is used for splitting the nodes. Zero here is one of the internal states used to build a decision tree. Although, just like random seed before, this one’s changeable. Keep it as zero if you would like to replicate the results in this video locally on your end. Okay, so we use a decision tree classifier. We give it the max leaf nodes and random state and we assign that to humidity classifier. Next, so we created a decision tree classifier object called humidity classifier, right? We will use the fit method of this object, kay? To make the classifier tune itself to learn from the samples. So we have the humidity classifier that dot and we give it the training sets for x and y that we split in the code cell before. At the end of this function we will have a decision tree-based classifier, a model. If we run this we see that the type for the humidity classifier object is indeed the decision tree classifier.

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Insuffisance rénale aiguë
#343 #Aigue #Cours #Facultaires #IRA #Insuffisance #Médecine #Renale #Urologie
Préciser le caractère aigu Contrairement à l'insuffisance rénale chronique (IRC), l'IRA se caractérise par une élévation de la créatininémie récente (< 1 mois)

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Insuffisance rénale aiguë
#343 #Aigue #Cours #Facultaires #IRA #Insuffisance #Médecine #Renale #Urologie
Il faut toujours faire préciser si cette IRA est à diurèse conservée (> 500 ml/24 h) ou oligoa- nurique (100–500 ml/24 h) ou anurique (< 100 ml/24 h)

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Insuffisance rénale aiguë
#343 #Aigue #Cours #Facultaires #IRA #Insuffisance #Médecine #Renale #Urologie
Déterminer le type d'insuffisance rénale La cause obstructive doit être évoquée systématiquement en première intention. Elle est à l'origine de l'IRA dans 10 % des cas. Une échographie rénovésicale doit être demandée en première intention et permet de la diag- nostiquer et de déterminer le type d'obstacle : • obstacle sous-vésical responsable d'une rétention aiguë d'urine et d'une dilatation des deux uretères et systèmes pyélocaliciels ; • obstacle urétéral : bilatéral ou sur rein unique. Si l'origine obstructive est confirmée et en l'absence d'indication de dialyse en urgence, un scanner abdominopelvien sans injection pourra être demandé afin de préciser l'origine de l'obstacle

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Insuffisance rénale aiguë
#343 #Aigue #Cours #Facultaires #IRA #Insuffisance #Médecine #Renale #Urologie
Examen clinique • On s'attachera en 1 er lieu à éliminer un globe vésical. Les touchers pelviens (toucher rectal et vaginal) sont indispensables notamment à la recherche d'une HBP, une prostatite, un blindage pelvien. • On recherchera un contact ou une sensibilité des fosses lombaires. • On vérifiera l'absence de complications : – de l'insuffisance rénale : atteinte cardiaque, œdème aigu du poumon ; – de l'obstruction : sepsis urinaire.

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Insuffisance rénale aiguë
#343 #Aigue #Cours #Facultaires #IRA #Insuffisance #Médecine #Renale #Urologie
Examens radiologiques • L'échographie des voies urinaires recherche une dilatation des cavités pyélocalicielles. Il faut noter que l'échographie peut être normale (fig. 21.1) : – en cas d'obstacle d'installation brutale ou récente, la dilatation des cavités peut ne pas être majeure. Un scanner abdominopelvien complémentaire peut alors être utile ; – si le patient est déshydraté et oligoanurique ; – en cas de fibrose rétropéritonéale : les cavités pyélocalicielles n'ont pas la capacité de se dilater malgré l'obstruction qui est réelle. Dans les autres cas, elle montrera une dilatation des cavités pyélocalicielles pouvant s'étendre à tout l'uretère selon le niveau de l'obstacle (fig. 21.2A et B). • Le scanner abdominopelvien peut compléter l'échographie et aider au diagnostic de la cause surtout en cas de lithiase et de tumeur pelvienne (fig. 21.3 à 21.5). • L'UIV ou l'uro-TDM sont contre-indiquées car l'injection de produit de contraste iodé est à proscrire dans ce contexte. • L'uro-IRM pourrait permettre de visualiser les voies excrétrices mais est souvent difficile à obtenir en urgence

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[unknown IMAGE 5049288101132]
#has-images #live-code-decision-trees #predict-on-test-set #python-for-data-science
Now, we will use the test data for this prediction to test the model we just built. We will use the predict function of the decision tree classifier object which was our humidity classifier.

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Insuffisance rénale aiguë
#343 #Aigue #Cours #Facultaires #IRA #Insuffisance #Médecine #Renale #Urologie
La mortalité au cours de l'IRA en réanimation ou nécessitant la prise en charge en dialyse est en moyenne de 50 % toutes causes confondues

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Insuffisance rénale aiguë
#343 #Aigue #Cours #Facultaires #IRA #Insuffisance #Médecine #Renale #Urologie
Les complications métaboliques propres à l'IRA sont l'acidose métabolique et l'hyperkaliémie, la surcharge hydrosodée et le risque de dénutrition lié à l'hypercatabolisme azoté

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Insuffisance rénale aiguë
#343 #Aigue #Cours #Facultaires #IRA #Insuffisance #Médecine #Renale #Urologie
De l'obstruction La stase urinaire peut se compliquer d'infection, de prostatite, de pyonéphrose et rapidement de septicémie. Il faut donc attentivement rechercher les marqueurs cliniques et biologiques d'infection, réaliser à titre systématique des prélèvements bactériologiques urinaires. Les urines peuvent être « faussement » stériles au-dessous de l'obstacle et infectées en amont

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[unknown IMAGE 5049294130444]
Insuffisance rénale aiguë
#343 #Aigue #Cours #Facultaires #IRA #Insuffisance #Médecine #Renale #Urologie #has-images

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[unknown IMAGE 5049316936972]
#classifier-accuracy #has-images #live-code-decision-trees #python-for-data-science
So we have about 10 values here and two of them were wrong. So overall this is called an error. For the classification task an error occurs, just like this, when the model’s prediction of the class label is different from the true class label. We can measure these errors by calculating the number of correct labels just like I’ve done now. We had two wrong, so if we had 10 rows it would be that many wrong in it and we can turn it into an error measure. For example like we did if we just looked at first 10 rows for the generated labels we can see that the values and the prediction are pretty close to the values and y tests but we can’t always count, right? How close, especially when we have a large number of rows, how do we test the accuracy of our classifier by calculating the accuracy store, score? We actually have a function for that. It’s called accuracy score and if you look at that, the accuracy of our algorithm here is about 81%. We can also define the different types of error in the classification depending of the predicted and true labels.

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[unknown IMAGE 5049310645516]
Insuffisance rénale aiguë
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[unknown IMAGE 5049315101964]
Insuffisance rénale aiguë
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Insuffisance rénale aiguë
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Insuffisance rénale aiguë
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Insuffisance rénale aiguë
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Insuffisance rénale aiguë
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[unknown IMAGE 5049341316364]
Insuffisance rénale aiguë
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[unknown IMAGE 5049525603596]
#clustering #has-images #python-for-data-science #visualization
Cluster analysis divides all the samples in a data set into groups. In this diagram, we see that the red, green, and purple data points are clustered together. Which group a sample is placed in is based on some measure of similarity. The goal of cluster analysis is to segment data so that the differences between samples in the same cluster are minimized, as shown by the blue arrow for our yellow dots. And the differences between samples of different clusters are maximized as shown by the blue arrow between the red and yellow dots. Visually, you can think of this as getting samples in each cluster to be as close as possible and the samples from different clusters to be as far apart as possible.

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[unknown IMAGE 5049529797900]
#clustering #has-images #python-for-data-science #similarity-measure
Cluster analysis requires some sort of metric to measure similarity between two samples. Some common similarity measures are: Euclidean distance, which is the distance along a straight line between two points, A and B, as shown on this plot; Manhattan distance, which is calculated on a strictly horizontal and vertical path as shown in the right plot, to go from point A to point B, you can only step along either the X axis or the Y axis in the two-dimensional case. So the path to calculate the Manhattan distance crosses two segments along the axis, instead of along a diagonal path as with the Euclidean distance. Cosine similarity measures the Cosine of the angle between points A and B as shown in the bottom plot.

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[unknown IMAGE 5049533992204]
#clustering #has-images #normalization #python-for-data-science
Since distance measures such as Euclidean distance are often used to measure similarity between samples in clustering algorithms, note that it may be necessary to normalize the input variables so that no one value dominates the similarity calculation. We discussed scaling and normalizing variables in an earlier video. Normalizing is one method to scale variables. Essentially scaling with input variables puts the variables on the same scale so that all variables have equal weighting in the calculation to determine similarity between samples. Scaling is necessary when you have variables that have very different scales, such as weight and height. The magnitude of the weight values which are in pounds, will be much larger than the magnitude of the height values which are in feet and inches. So scaling both variables to a common value range will make the contributions from both weight and height equal.

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[unknown IMAGE 5049538186508]
#clustering #has-images #notes #python-for-data-science
Some things to note about cluster analysis are: first, unlike classification and regression in general, cluster analysis is an unsupervised task. This means that there is no target label for any sample in the data set. In general, there is no correct clustering results. The best set of clusters is highly dependent on the application, how the resulting clusters will be used. There are numerical measures to compare two different clusters, but since there are no labels to determine whether a sample has been correctly clustered, there’s no grounds to determine if a set of clustering results are truly correct or incorrect. Clusters don’t come with labels. You may end up with five different clusters at the end of cluster analysis process, but you don’t know what each cluster represents. Only by analyzing the samples in each cluster further, you can come up with reasonable labels for your clusters. Given all this, it is important to keep in mind that interpretation and analysis of the clusters are required to make sense of and make use of the results of cluster analysis.

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[unknown IMAGE 5049544215820]
#clustering #has-images #python-for-data-science #usage
There are several ways that the results of cluster analysis can be used. The most obvious is data segmentation and how the benefits that come from that. If you segment your customer base into different types of readers for example. Analyzing each segment separately can provide valuable insight into each group’s likes, dislikes and purchasing behavior, just like we see science fiction, non fiction, children’s book preferences here. These insights can be used to provide more effective marketing to different customer groups based on their preferences. Clusters can also be used to classify new data samples. When a sample is received, like the orange sample here, compute the similarity measure within it and the centers of all clusters and assign the new sample to the closest cluster. The label of cluster manually determined through analysis is then used to classify the new sample. In our book buyers preferences example any customer can be classified as being either a science fiction, non fiction, or a children’s book customer based on which cluster the new customer is most similar to. Once cluster labels have been determined, samples in each cluster can be used as label data for another classification task. The samples would be the input to the classification model, and the cluster label will be the target class for each sample. This process can be used to provide much needed label data for classification. Yet another use of cluster results is as a basis for anomaly detection. If a sample is very far away or very different from any of the cluster centers, like the green sample here, then that sample is a cluster outlier and can be flagged as anomaly. However, these anomalies require further analysis. Depending on the application, these anomalies can be considered noise and should be removed from the data set. An example of this would be a sample with value of 150 for age. For other cases, these anomalies cases should be studied more carefully. Examples of this are in a credit card fraud detection or network intrusion detection application. In these applications, examples outside of the norm are the interesting cases that should be looked at to determine if they represent potential problems.

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[unknown IMAGE 5049556012300]
#has-images #k-means-algorithm #k-means-clustering #python-for-data-science
K-means is a classic algorithm used for cluster analysis. The algorithm is very simple. The first step is to select k initial centroids. A centroid is simply the center of a cluster as you see in the diagram here. Next, assign each sample in a data set to the closest centroid. This means you calculate the distance between the sample and each cluster center and assign the sample to the cluster with the closest centroid. Then you calculate the mean or average of each cluster to determine a new centroid. Those two steps are done repeatedly until some stopping criteria is reached.

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[unknown IMAGE 5050099436812]
#has-images #k-means-clustering #python-for-data-science
Here is an illustration of how k-means works. A in the diagram shows the original data set with some samples. In b, initial centroids are randomly selected. C shows the first iteration. Here samples are assigned to the closest centroid. In d, the centroids are re-calculated. E shows the second iterations. Samples are assigned to the closest centroid. Notice some samples changed cluster assignments during this step. In f, the centroids are re-calculated again. Cluster assignments and centroid re-calculation are repeated until some stopping criterion is reached and you get your final clusters as shown in f.

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#python
In C or C++, we are responsible for the allocation and deallocation of memory. Every piece of memory allocated should eventually be freed, otherwise we have a memory leak.

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Ownership in Python — Shipeng Feng's Writings
Ownership in Python — Shipeng Feng's Writings Welcome Blog Projects About Ownership in Python written by Shipeng Feng on 2016-01-09 In C or C++, we are responsible for the allocation and deallocation of memory. Every piece of memory allocated should eventually be freed, otherwise we have a memory leak. It is really hard to prevent leaks from happening by manual management. In Python, we use reference counting as the strategy to avoid memory leaks. The idea is simple: everything is one




#python
In Python, we use reference counting as the strategy to avoid memory leaks. The idea is simple: everything is one object and every object has a counter, which keeps the total number of references to this object. When the counter drops to 0, the object should be freed,

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and deallocation of memory. Every piece of memory allocated should eventually be freed, otherwise we have a memory leak. It is really hard to prevent leaks from happening by manual management. <span>In Python, we use reference counting as the strategy to avoid memory leaks. The idea is simple: everything is one object and every object has a counter, which keeps the total number of references to this object. When the counter drops to 0, the object should be freed, the operation is also safe because we know it is used in nowhere. What interests me most is how does this happen under the hood. After some exploration, I think I have something here an




#python
In CPython, two macros called Py_INCREF(x) and Py_DECREF(x) are used to handle the increment and decrement of the reference count.

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Ownership in Python — Shipeng Feng's Writings
o safe because we know it is used in nowhere. What interests me most is how does this happen under the hood. After some exploration, I think I have something here and want to share it with you. <span>In CPython, two macros called Py_INCREF(x) and Py_DECREF(x) are used to handle the increment and decrement of the reference count. There are a few questions though, when should we use them and how are they used in CPython implementation? We should use Py_INCREF(x) when we need ownership of an object. What is owners




#python
What is ownership, if you want to use one object, you have to own it, otherwise it might be taken away from you by others, in our case, you have to inform the garbage collector that you are using the object, or gc might free it.

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f the reference count. There are a few questions though, when should we use them and how are they used in CPython implementation? We should use Py_INCREF(x) when we need ownership of an object. <span>What is ownership, if you want to use one object, you have to own it, otherwise it might be taken away from you by others, in our case, you have to inform the garbage collector that you are using the object, or gc might free it. However it is totally free for you to borrow one object, if you are 100% sure the owners hold on to the object longer than you. The ownership in Python means you keep a reference to one




#python
We should use Py_INCREF(x) when we need ownership of an object.

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nd Py_DECREF(x) are used to handle the increment and decrement of the reference count. There are a few questions though, when should we use them and how are they used in CPython implementation? <span>We should use Py_INCREF(x) when we need ownership of an object. What is ownership, if you want to use one object, you have to own it, otherwise it might be taken away from you by others, in our case, you have to inform the garbage collector that you




#python
However it is totally free for you to borrow one object, if you are 100% sure the owners hold on to the object longer than you. The ownership in Python means you keep a reference to one object.

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se one object, you have to own it, otherwise it might be taken away from you by others, in our case, you have to inform the garbage collector that you are using the object, or gc might free it. <span>However it is totally free for you to borrow one object, if you are 100% sure the owners hold on to the object longer than you. The ownership in Python means you keep a reference to one object. All owners of one object should call Py_DECREF(x) after they finish using the object, otherwise a memory leak is created. Here is one simple example: def hello(): s = 'hi' # s keeps a r




#python
All owners of one object should call Py_DECREF(x) after they finish using the object, otherwise a memory leak is created.

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Ownership in Python — Shipeng Feng's Writings
However it is totally free for you to borrow one object, if you are 100% sure the owners hold on to the object longer than you. The ownership in Python means you keep a reference to one object. <span>All owners of one object should call Py_DECREF(x) after they finish using the object, otherwise a memory leak is created. Here is one simple example: def hello(): s = 'hi' # s keeps a reference to 'hi' and have ownership print s # use 'hi' for something hello() # s finishes and decreases the reference coun




#python

if you call a C function from Python, in order to make things work right, as a Python C Extension developer, you have to return an object that has its ownership:

 static PyObject * get_first_item ( PyObject * list ) { PyObject * item = PyList_GetItem ( list , 0 ); /* do not have ownership */ Py_INCREF ( item ); /* get ownership */ return item ; /* safe to return */ } 

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Ownership in Python — Shipeng Feng's Writings
ing a normal Python function, the returned object will pass its ownership to the receiver. The Python itself makes sure that all returned object has the ownership. Things get a little uncertain <span>if you call a C function from Python, in order to make things work right, as a Python C Extension developer, you have to return an object that has its ownership: static PyObject * get_first_item(PyObject *list) { PyObject *item = PyList_GetItem(list, 0); /* do not have ownership */ Py_INCREF(item); /* get ownership */ return item; /* safe to return */ } tags: python ownership © Copyright 2017 by Shipeng Feng. Content licensed under the Creative Commons attribution-noncommercial-sharealike License. <span>